Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001289970.2

Sequence Length

622 nt

GC Content

0.5418

AGGGUGCCCUUCUGUCUGUUGAGUGUGGUCCACCCAGGCAGCCAGAUCUGAGGCCAUGGCAACCCAGCAAGUGGACAGCAGAAGGCAGGUGGCAGCAGAGCAGGUGGCAGCCCAGCUGCUUGAACGGAGAAGGGGCAGCCACUGUGAUGACGAGAAGCAGACGCUGUUGGCAUUGCUGAUCUUGGUGCUGUACUUGAGCACAGAGAUAUGGGGAAGCAGUUGGGAGGUGUCAGAAAGGAUCAGAGAAUGUAACUACUACCAGAAUCUUGCAGUUCCCCAGGGGCUUGAAUAUCAGACCAACGAGCCCUCAGAAGAACCGAUAAAGACCAUCAGGAACUGGCUGAAGGAGAAGUUGCAUGUCUUCUCGGAGAAGUUAGAGGAAGAGGUGCAGCAGCUGGAGCAGCUAGCGUGGGACCUGGAACUGUGGCUGGAUGCUCUUCUGGGAGAGCCACACCAGGAGGAGCACUGCUCCACAUAUAAAAGUCACUUGUGGGAGUGGGCCUGGGCCCUGGGGAGAGAGCACAAAGGUGGGGAGGGGUUGCUAGAGAUUUCUCUAAGCGGGGCAGAGCUCUGACUCUUGAAGUUCCAGUCAGGCAAGAAAAUAAAGUAGUUGGGAAAUGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-221.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -231.54

Frequency: 0.0000

Diversity: 152.06

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..((((((((((((........(((((((.(.(((((((((((((.(((((((...........((((((((.((((((.....((...(.(...((..((((.((((.((((..((.(......).))...)))).))))))))..)).).)...))....)))))).)).))))))(((((.(((((.......))))).))))).(((((((((((((((..(((..((...............))..)))....))))....))))..)))))))((((((((.............))))))))..................)).)))))..)))))))....((..(((((((.(((((((..........)).))))).)))))))..))((((((.(((((...((........))...))))).)))))))))))).).)))))))))))))).)))))(((((.((((...........)))))))))..((((((...(((((..((((((((....))).(((((((((......)))))))))...((((((...)))))).))))).....)))))))))))...........................

Thermodynamic Ensemble Prediction

..{(((((((((({,,,.,,..((((({(,{.(((((((((((((.(((((((,,.,{{.....((((((((.((((((.....((...{.,,..((..((({{((((.((((..((.(,,....}}))...)))).))))))))..)).}.,...))...,)))))).)).))))))(((((.(((((.......))))).))))).(((((((((((((((..(((,,{{...............}}..,)}.},.))))...,))))..)))))))((((((((.............)))))))).........,......}.)).)))))..)))))))....((..(((((((.(((((((.,,....,,.)))))))).)))))))..))((((({.{{{((.,,({.,...,..)),,,))))).}}|}}}}}}))).}.)))))))))))))).))}||(((((.(({{.........,,)))})))))}}(({{{{,,,|||||..||{{||||....)}).||||||||{,,,,,,|}}}}))))..,|(((((...)))))}.))))}....,}}}))})))))..............,.,,,,.......