Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001290051.2
Sequence Length
3846 nt
GC Content
0.5554
GUGGGCUCGCUGGCGCGACCCGCGCGGGCCAGUGGGAGUGCGGGAGGGACGCCGAGGGUCCAGGGUUUGGAGGGGCGCGAGCUGCCGGGGGUUGGAGGUCGAGCGCCGACACCAUGUGGAUCCAGGUUCGGACCAUGGACGGGAGGCAGACCCACACGGUGGACUCGCUGUCCAGGCUGACCAAGGUGGAGGAGCUGAGGCGGAAGAUCCAGGAGCUGUUCCACGUGGAGCCAGGCCUGCAGAGGCUGUUCUACAGGGGCAAACAGAUGGAGGACGGCCAUACCCUCUUCGACUACGAGGUCCGCCUGAAUGACACCAUCCAGCUCCUGGUCCGCCAGAGCCUCGUGCUCCCCCACAGCACCAAGGAGCGGGACUCCGAGCUCUCCGACACCGACUCCGGCUGCUGCCUGGGCCAGAGUGAGUCAGACAAGUCCUCCACCCACGGUGAGGCGGCCGCCGAGACUGACAGCAGGCCAGCCGAUGAGGACAUGUGGGAUGAGACGGAAUUGGGGCUGUACAAGGUCAAUGAGUACGUCGAUGCUCGGGACACGAACAUGGGGGCGUGGUUUGAGGCGCAGGUGGUCAGGGUGACGCGGAAGGCCCCCUCCCGGGACGAGCCCUGCAGCUCCACGUCCAGGCCGGCGCUGGAGGAGGACGUCAUUUACCACGUGAAAUACGACGACUACCCGGAGAACGGCGUGGUCCAGAUGAACUCCAGGGACGUCCGAGCGCGCGCCCGCACCAUCAUCAAGUGGCAGGACCUGGAGGUGGGCCAGGUGGUCAUGCUCAACUACAACCCCGACAACCCCAAGGAGCGGGGCUUCUGGUACGACGCGGAGAUCUCCAGGAAGCGCGAGACCAGGACGGCGCGGGAACUCUACGCCAACGUGGUGCUGGGGGAUGAUUCUCUGAACGACUGUCGGAUCAUCUUCGUGGACGAAGUCUUCAAGAUUGAGCGGCCGGGUGAAGGGAGCCCCAUGGUUGACAACCCCAUGAGACGGAAGAGCGGGCCGUCCUGCAAGCACUGCAAGGACGACGUGAACAGACUCUGCCGGGUCUGCGCCUGCCACCUGUGCGGGGGCCGGCAGGACCCCGACAAGCAGCUCAUGUGCGAUGAGUGCGACAUGGCCUUCCACAUCUACUGCCUGGACCCGCCCCUCAGCAGUGUUCCCAGCGAGGACGAGUGGUACUGCCCUGAGUGCCGGAAUGAUGCCAGCGAGGUGGUACUGGCGGGAGAGCGGCUGAGAGAGAGCAAGAAGAAGGCGAAGAUGGCCUCGGCCACAUCGUCCUCACAGCGGGACUGGGGCAAGGGCAUGGCCUGUGUGGGCCGCACCAAGGAAUGUACCAUCGUCCCGUCCAACCACUACGGACCCAUCCCGGGGAUCCCCGUGGGCACCAUGUGGCGGUUCCGAGUCCAGGUCAGCGAGUCGGGUGUCCAUCGGCCCCACGUGGCUGGCAUACACGGCCGGAGCAACGACGGAGCGUACUCCCUAGUCCUGGCGGGGGGCUAUGAGGAUGAUGUGGACCAUGGGAAUUUUUUCACAUACACGGGUAGUGGUGGUCGAGAUCUUUCCGGCAACAAGAGGACCGCGGAACAGUCUUGUGAUCAGAAACUCACCAACACCAACAGGGCGCUGGCUCUCAACUGCUUUGCUCCCAUCAAUGACCAAGAAGGGGCCGAGGCCAAGGACUGGCGGUCGGGGAAGCCGGUCAGGGUGGUGCGCAAUGUCAAGGGUGGCAAGAAUAGCAAGUACGCCCCCGCUGAGGGCAACCGCUACGAUGGCAUCUACAAGGUUGUGAAAUACUGGCCCGAGAAGGGGAAGUCCGGGUUUCUCGUGUGGCGCUACCUUCUGCGGAGGGACGAUGAUGAGCCUGGCCCUUGGACGAAGGAGGGGAAGGACCGGAUCAAGAAGCUGGGGCUGACCAUGCAGUAUCCAGAAGGCUACCUGGAAGCCCUGGCCAACCGAGAGCGAGAGAAGGAGAACAGCAAGAGGGAGGAGGAGGAGCAGCAGGAGGGGGGCUUCGCGUCCCCCAGGACGGGCAAGGGCAAGUGGAAGCGGAAGUCGGCAGGAGGUGGCCCGAGCAGGGCCGGGUCCCCGCGCCGGACAUCCAAGAAAACCAAGGUGGAGCCCUACAGUCUCACGGCCCAGCAGAGCAGCCUCAUCAGAGAGGACAAGAGCAACGCCAAGCUGUGGAAUGAGGUCCUGGCGUCACUCAAGGACCGGCCGGCGAGCGGCAGCCCGUUCCAGUUGUUCCUGAGUAAAGUGGAGGAGACGUUCCAGUGUAUCUGCUGUCAGGAGCUGGUGUUCCGGCCCAUCACGACCGUGUGCCAGCACAACGUGUGCAAGGACUGCCUGGACAGAUCCUUUCGGGCACAGGUGUUCAGCUGCCCUGCCUGCCGCUACGACCUGGGCCGCAGCUAUGCCAUGCAGGUGAACCAGCCUCUGCAGACCGUCCUCAACCAGCUCUUCCCCGGCUACGGCAAUGGCCGGUGAUCUCCAAGCACUUCUCGACAGGCGUUUUGCUGAAAACGUGUCGGAGGGCUCGUUCAUCGGCACUGAUUUUGUUCUUAGUGGGCUUAACUUAAACAGGUAGUGUUUCCUCCGUUCCCUAAAAAGGUUUGUCUUCCUUUUUUUUUUUAUUUUUAUUUUUCAAAUCUAUACAUUUUCAGGAAUUUAUGUAUUCUGGCUAAAAGUUGGACUUCUCAGUAUUGUGUUUAGUUCUUUGAAAACAUAAAAGCCUGCAAUUUCUCGACAAAACAACACAAGAUUUUUUAAAGAUGGAAUCAGAAACUACGUGGUGUGGAGGCUGUUGAUGUUUCUGGUGUCAAGUUCUCAGAAGUUGCUGCCACCAACUCUUUAAGAAGGCGACAGGAUCAGUCCUUCUCUCGGGUUCUGGCCCCCAAGGUCAGAGCAAGCAUCUUCCUGACAGCAUUUUGUCAUCUAAAGUCCAGUGACAUGGUUCCCCGUGGUGGCCCGUGGCAGCCCGUGGCAUGGCGUGGCUCAGCUGUCUGUUGAAGUUGUUGCAAGGAAAAGAGGAAACAUCUCGGGCCUAGUUCAAACCUUUGCCUCAAAGCCAUCCCCCACCAGACUGCUUAGCGUCUGAGAUCCGCGUGAAAAGUCCUCUGCCCACGAGAGCAGGGAGUUGGGGCCACGCAGAAAUGGCCUCAAGGGGACUCUGCUCCACGUGGGGCCAGGCGUGUGACUGACGCUGUCCGACGAAGGCGGCCACGGACGGACGCCAGCACACGAAGUCACGUGCAAGUGCCUUUGAUUCGUUCCUUCUUUCUAAAGACGACAGUCUUUGUUGUUAGCACUGAAUUAUUGAAAAUGUCAACCAGAUUCUAGAAACUGCGGUCAUCCAGUUCUUCCUGACACCGGAUGGGUGCUUGGGAACCGUUUGAGCCUUAUAGAUCAUUUACAUUCAAUUUUUUUAACUCAGCAAGUGAGAACUUACAAGAGGGUUUUUUUAAAAUUUUUUUUUCUCUUAAUGAACACAUUUUCUAAAUGAAUUUUUUUUGUAGUUACUGUAUAUGUACCAAGAAAGAUAUAACGUUAGGGUUUGGUUGUUUUUGUUUUUGUAUUUUUUUUCUUUUGAAAGGGUUUGUUAAUUUUUCUAAUUUUACCAAAGUUUGCAGCCUAUACCUCAAUAAAACAGGGAUAUUUUAAAUCACAUACCUGCAGACAAACUGGAGCAAUGUUAUUUUUAAAGGGUUUUUUUCACCUCCUUAUUCUUAGAUUAUUAAUGUAUUAGGGAAGAAUGAGACAAUUUUGUGUAGGCUUUUUCUAAAGUCCAGUACUUUGUCCAGAUUUUAGAUUCUCAGAAUAAAUGUUUUUCACAGAUAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1430.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1500.63
Frequency: 0.0000
Diversity: 853.37
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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