Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001290264.2
Sequence Length
6434 nt
GC Content
0.5527
AGAACGGCCCGGGCGGAACCAACGGGCAGCCGCGGGGGCGUUGUGGGCCGCGGCGCGUUUCCCCGGCUCCGUGGCUCUGGGGCACUGAGGAGCGGCGCCCGCGGGGCAGCGAGGAGCCCGAUGCAGGGUUCUGCGCGUCAUUUCCGGUCCCGCGGGCGCCCCGUGAAGCCCACCUGGAUCCGCCAGCGCUGUGCCACUCCCCAGUGCCGAGCUCCGAGCUGUCUCCGCGGCCUCGCGCCCGGCCCCUCCACCGCGCGCCUCUCAGGCCCCGCCCGCCAGCGUCCCUUUGUUGUGAAGGCGCCGGGGCCUAGCGCUAUGCCUGCGGCGGAGACUGCAUCAGGCUCUCGUCCUCGGGCUCCACCCGGGGAGCUGUGCCCAGACAGCAGAAGGGAAGGAUGUCACUUCUGAGAUGAGGUUCAGAAAGGUCUGGGCUCCUGUCCUGGCUGCUCUCUCCCACUCCCUGAUGAGCUUGCUGGAUGAAAGCUCCUGUCAGGCUGUGGGGCGUCCUGUGGAGAAGCUGGCAAGAAACUGGUGGGGGCCCUUUCCACCUAUAGCCAGCAAGGAACUGAACCCAGCCAGCGUCCACCUGAGUGAGCUCAGAGGUGGGCCUCAGCCCCAGUUGAGCCUUCGGAUGAGGUCACAGCCCUGGUCCAUGGUGUGACUGCAGCUUCAGGAGGGACCUUAAGCCAGAGGUGCCUGGCUAAGCUUCCCGCAGAUUGCUGCCCCACAGGAGCCAACAUCAAAAGCAUUUGUUGUUUUGAGGUGCGUCUGCUUCUGCGCUUUGCCUGGGAGAGGCCCUGGUGGCCUCGUUCCUGGCGCCCGGAGUCCCUGCUGCGGCCCCACCCCCGGGCGGUCACGGUGACCCAUGCUGCCCAGCCUGGAGGUAAAAUCGUUCGUGGCUGUGGCUUCAGCAUGUCGUCCUCGGUGAAAACCCCAGCACUGGAAGAGCUGGUUCCUGGCUCCGAAGAGAAGCCGAAAGGCAGGUCGCCUCUCAGCUGGGGCUCUCUGUUUGGUCACCGAAGUGAGAAGAUUGUUUUUGCCAAGAGCGACGGCGGCACAGAUGAGAACGUACUGACCGUCACCAUCACGGAGACCACGGUCAUCGAGUCAGACUUGGGUGUGUGGAGCUCGCGGGCGCUGCUCUACCUCACGCUGUGGUUCUUCUUCAGCUUCUGCACGCUCUUCCUCAACAAGUACAUCCUGUCCCUGCUGGGAGGCGAGCCCAGCAUGCUAGGUGCGGUGCAGAUGCUGUCCACCACGGUUAUCGGGUGUGUGAAAACCCUCGUUCCUUGCUGUUUGUAUCAGCACAAGGCCCGGCUUUCCUACCCACCCAACUUCCUUAUGACGAUGCUGUUUGUGGGUCUGAUGAGGUUUGCAACUGUGGUUUUGGGUUUGGUCAGCCUGAAAAAUGUGGCGGUUUCGUUUGCUGAGACGGUGAAGAGCUCCGCCCCCAUCUUCACGGUGAUCAUGUCUCGGAUGAUUCUGGGGGAGUACACAGGGCUGCUGGUCAACCUCUCCCUCAUCCCAGUCAUGGGCGGGCUGGCGCUGUGCACGGCCACUGAGAUCAGCUUCAAUGUCCUGGGGUUCUCGGCCGCACUGUCCACCAACAUCAUGGACUGUUUGCAAAAUGUUUUUUCAAAAAAGCUGCUCAGCGGGGACAAAUACAGGUUCUCGGCCCCGGAGCUGCAGUUCUACACCAGCGCCGCUGCGGUGGCCAUGCUCGUCCCGGCCCGGGUUUUCUUUACGGACGUCCCAGUGAUCGGGAGGAGUGGGAAGAGCUUCAGCUACAACCAGGACGUGGUGCUGCUGCUUCUGACAGACGGAGUCCUGUUCCACCUUCAGAGCGUCACGGCGUACGCCCUCAUGGGGAAAAUCUCCCCGGUGACUUUCAGCGUCGCCAGCACCGUGAAACAUGCCUUGUCCAUCUGGCUCAGCGUAAUCGUUUUCGGCAACAAGAUCACCAGCUUGUCGGCCGUUGGCACAGCCCUGGUGACCGUUGGGGUCCUGCUCUACAACAAAGCCAGGCAACACCAGCAGGAGGCGCUGCAGAGCCUGGCUGCAGCCACUGGCCGGGCCCCAGACGACACAGUGGAGCCGCUGCUUCCACAGGACCCCAGGCAGCAUCCCUGAGAGCAGGAAGCUGCCAGCUGCUGCUGUCCUCGUGACACUGCAUCCCCCAGAAAUGGGCAGGGACGCCCUCCUCCAUGGCCCUGCUGGGGUGCAGGACAUGGGGAGCUAAGUUGGCCAUUGCCUGCGGCUUUCUCGGUUUGUCGGUGAAGACCAGCAGAAACUCAAACUGGGGAUUCCAGGUAUCAGCUUCCUGGAGUAGAGACCAGACCAGUAGCUGACUGUGUCCGCCGAGCCCAUCCCCGUGUAAUGUGAAAACAGCCUCUGAGGCUCCCAUGCUGGGGGUGCCCACUUCCUCUCUGGGCGACACCCCAGGGUCCACCGGGAGCCAGAGGUGGGUCCAGUGCCAACGAGAGCCGCUCCCUGCCACAGCCAAGAGAGCCCUCGGCUUCCCACACCAGCCAUCGAAGGCCCUGAGGCCCUGGACCGGCGGCAGACUGGCCCUGGGCAUGAGGCCACAGAGCAGGGCCGAAGGGAGGGGACAGAGGGCCCUGGAAGGAAGGGUCUCCUGCUGCCACGGUGGGCACUCAGAACUUCUCCCCACCUGACCCAGGGCUGUGGGCAUCCUCAGACUAUCCCAGAGGCAUCGCAAGCCUCAAGCUGCAGCAUUGCACGGCACUCAAGGGCUAUGACCACGGAGGCCGUUCAGUCGCUUCUGUUUAGAGGAAGGCCCCCUACCUCUUCCACACCCUGCCCUCCUAUCCCUUCCACACCCUGGGCUGCGUGAGCUCCCCGCAACCCCAGGGCACCCUGCCCUCCUACCUGUGGGGGUUUCCAGCCCUGAGGUUGAGGACAAACCUCUCGUGUUUAACUUGGGAGGAGAUGUGUACGUUCCUUUUCUUUUUUGGACUCUGAGUAUGAGGCAGGCUGUUCUGAGGUCCCCGUGGGGUGAGCCUGUCUGUCCUCCCUCAGAGCCCACUGUUCCUAUCAUCAUCUAGCACCUGUCCGGUUCCCCACGUGAGCCUUGGGCAGGACGCUGCAGUGUUGAUGGUUUGGGUUACGUGGCGUUUACCUGGGCGCCGUCCUUACUGAAAAAGGAAACGUCCACACUGAAUGUUUCUGGGGCGCGUGGUGUGUGUCAGGCGCCCACCCUGUCCCACUCUCCCCAAGGGACAGUAGUACGGCACACUGGGGCCACCAGCCAGCUCAACUCAUCCUCCUGUGUCACGCACCCCCGAGGGCGCAGGAGGCCUGAGGAGUGGCUACUGGAGCCGUGUGUUAGGCAGAGGCUUCUGACCAUGUCUGAGCUCUUUACCCCCAAUCUCGCAGCUGGCGGAUUCCCAUGCCCGGUGCAGCCUGUUGCCAGCCAGCCUUUGAGACCCAGAGCUCCAGGGCUUGUCAGAGGCAGCAUGGGGCUCCAGUGGUCCCGAGUCUCAUUUCCCUGCCUGCUCUUUAGGCCUUUGGCACCCAUGGUCACUUCACUGGCUUUCCAUUUGGCUUCUCACCUGGGAAAUACAAAAAUAGCCCCUCCUGAAGAUAAAAUCAUUCAGAAACAGAGCAAUAAUUCUGACUCAUUAACUUCUACCUACUCAAAAAAGUCUGCCAUGAUGAUGGACCGAAGUGAGGCUUUUUAACCCACAAGUAACCUUUUUAUUUUUUUGAGACAGUCUUGCUCUGUCUGUCACCCAGGCUGGAGUACAGUGGCAUGAUCUUGGCUCACUGCAGCCUCGACUUCCUGGGCUCAAAUGAUCCUCCCACCUCAGCCUCCCAUGUGGCUGGAACCACAGGCACGUGCCACCAUGCCUGGCUAUUUUUUUGUUGAGCUGGGCUCUCGCUUUGUUGCCCAGGCUGGUCUUGAACUCCUCGGCUCAAGCAAUCCUUCCCACUCAGCCUCCUGUAGUGUCGAGAAUAUAGGCGUGGGCUACUACACCUGCUUCAGCCGCUUCUAUAAAACCGCUGACCUGUGUGUGGAGGACAGGCCAGGUGUGUGCUCACUGCGCUGCGAAGAUGUUUUGUCACGUGACUUUCCCCGGAUUUCCAUUUCUUUUUUUCUGCUUUCCUCAAAAACUAAUAGAAGACUGGGUGCGGUGGCUCACGCCUCUAAUCGCAGCACUUUGGGAGGCAGCAGCUGGCGGAUCACAAGGCCAGGAGUUCGAGACCAGCCUGGCCAACAUGAUGAAACCCUGUCUCUACCAAAAAUACAAAAAUUAGCUGGGUGCGAUGGUGGGUGCCUGUAAUCCCAGAUACUCAGGAGGCUGAGGCAGGAGAAUUGUUUGAACCCCGGAGAUGGAGGUUGCAGUGAGCCAAGAUCGUGCCAUUGCACUCCAGCCUGGGCAACAGGGCAAGAUUCCGUCUCAAAAACAAACACUAUUAGAAAAUGCCCUGGAGGUGGCGGGGAGUUGUUGAUUUGUGAGGACAGAUUGAAAGCAACUCCCAGGGUGGCCUUGUCCACCUCCCCGUCGAGAAUGUGGCUGCCGGCCUCUUUGAAGAUUGUGGUCUGGCAUAAGGAGAGGUGCAGGCGCCUGGUUCUGAGCACCUUGGAAUUUCCAGCCGCACAGCAUCUGGUGCCCUCCCCUCCACCCUCACAAGGAGCUGCCAUCCUGUUUGGAUUUUCUGUUUGUGGACCAGAAACAAACGUUUUUCCAAAGGAUUAGCAAAUAGGGUAAUUUCCUGUGUAACGCUGCUCUGGGGCCUCUUCCUCAUCCUGGCAGAAGGAGCCUGGAGCCCAUGAGGCAGCCAGCACUGUGCCCUUGCUCAGUCGUGCUGUCCCCUCCCUCUCCCUCAGUCUCCUCUCCAUGCCCAAGUCAGUUUCCAGCCGCUGGUCUUCAUGGCAUUCCCAGCACAGCCGGGCACCAAGAGGCAAAACCCAAGGCCUGGCUUGGCCGUGUUAACGAUUGUACAGACAUUUUUUAAAAUAACUUUGUGUAAUACUU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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-2617.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2728.69
Frequency: 0.0000
Diversity: 1445.29
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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