Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001290270.1

Sequence Length

1646 nt

GC Content

0.5656

CACUGAGGGCUCAUCCAUCCGCAGAGCAGGGCAGUGGGAGGAGACGCCAUGACCCCCAUCCUCACGGUCCUGAUCUGUCUCGGGCACCUCCCCAAGCCCACCCUCUGGGCUGAGCCAGGCUCUGUGAUCAUCCAGGGAAGUCCUGUGACCCUCAGGUGUCAGGGGAGCCUUCAGGCUGAGGAGUACCAUCUAUAUAGGGAAAACAAAUCAGCAUCCUGGGUUAGACGGAUACAAGAGCCUGGGAAGAAUGGCCAGUUCCCCAUCCCAUCCAUCACCUGGGAACACGCAGGGCGGUAUCACUGUCAGUACUACAGCCACAAUCACUCAUCAGAGUACAGUGACCCCCUGGAGCUGGUGGUGACAGGAGCCUACAGCAAACCCACCCUCUCAGCUCUGCCCAGCCCUGUGGUGACCUCAGGAGGGAACGUGACCCUCCAGUGUGUCUCACAGGUGGCAUUUGACGGCUUCAUUCUGUGUAAGGAAGGAGAAGAUGAACACCCACAACGCCUGAACUCCCAUUCCCAUGCCCGUGGGUGGUCCUGGGCCAUCUUCUCCGUGGGCCCCGUGAGCCCGAGUCGCAGGUGGUCGUACAGGUGCUAUGCUUAUGACUCGAACUCUCCCUAUGUGUGGUCUCUACCCAGUGAUCUCCUGGAGCUCCUGGUCCCAGGUGUUUCUAAGAAGCCAUCACUCUCAGUGCAGCCAGGUCCUAUGGUGGCCCCUGGGGAGAGCCUGACCCUCCAGUGUGUCUCUGAUGUCGGCUACGACAGAUUUGUUCUGUAUAAGGAGGGAGAACGUGACUUCCUCCAGCGCCCUGGUUGGCAGCCCCAGGCUGGGCUCUCCCAGGCCAACUUCACCCUGGGCCCUGUGAGCCCCUCCCACGGGGGCCAGUACAGAUGCUACAGUGCACACAACCUCUCCUCCGAGUGGUCGGCCCCCAGUGACCCCCUGGACAUCCUGAUCACAGGACAGUUCUAUGACAGACCCUCUCUCUCGGUGCAGCCGGUCCCCACAGUAGCCCCAGGAAAGAACGUGACCCUGCUGUGUCAGUCACGGGGGCAGUUCCACACUUUCCUUCUGACCAAGGAGGGGGCAGGCCAUCCCCCACUGCAUCUGAGAUCAGAGCACCAAGCUCAGCAGAACCAGGCUGAAUUCCGCAUGGGUCCUGUGACCUCAGCCCACGUGGGGACCUACAGAUGCUACAGCUCACUCAGCUCCAACCCCUACCUGCUGUCUCUCCCCAGUGACCCCCUGGAGCUCGUGGUCUCAGCAUCCCUAGGCCAACACCCCCAGGAUUACACAGUGGAGAAUCUCAUCCGCAUGGGUGUGGCUGGCUUGGUCCUGGUGGUCCUCGGGAUUCUGCUAUUUGAGGCUCAGCACAGCCAGAGAAGCCUACAAGAUGCAGCCGGGAGGUGAACAGCAGAGAGGACAAUGCAUCCUUCAGCGUGGUGGAGCCUCAGGGACAGAUCUGAUGAUCCCAGGAGGCUCUGGAGGACAAUCUAGGACCUACAUUAUCUGGACUGUAUGCUGGUCAUUUCUAGAGACAGCAAUCAAUAUUUGAGUGUAAGGAAACUGUCUGGGGUGAUUCCUAGAAGAUCAUUAAACUGUGGUACAUUUUUUUGUCUAUGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-614.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -645.07

Frequency: 0.0000

Diversity: 502.11

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..((((((((((...........))))...((((((((.(((...(((.((.(((((.((((...((((((((......))))).)))......((((((.....))))))(((..(((.(((((.((.....((((..(((((((((...((((((((((((((..(((...(((((.((((.(((((..(((((((((.............(((((((((....(....)...)))))))))(((((((((.((((((.................))))))...(((((.((..(((((((...................((((....))))))))))))))))))(((((((.((((...((.((.....))...))))))...)))))))((((....(((((((.((((.(.((((((.......)))))).).).)))))))))).))))......)))..))))))..........((((((((((..(((((((...((.((............)).))..)))))))(((...)))))))))))))..((((.......))))((((((.....(((((((.((........))))))))))).))))))))))))))))))))))....((((((((.(((((((.((((....)))).)))))..)).))..))))))....(((((....(((.((.((.((((((((((((((((((((.((..((((.((((.........((....))(((((.....)))))....((((((((.......)))))))).)))).))))..))......))))))((((((.((((((..........))))))......))))))))))).))))))))).)).))..)))....)))))...(((.(((....))).))))))))...)).)..))))).)))).))))))))))))))..)))))).))))).)))..)))(((((...)))))....((((((((...((.(......).))...))))))))...((((.(((((.(((.....))).))))).))))..))))))))))))))..)))))))))))..(((((.(((.((..(((.(((((((........))))).....)).)))...)).))).)))))(((....)))..))).))).((((((((..(((((((((((....(((..((((((((((((((..........(((((.(....).)).))).(((((.(((.....(((.(((((((((..((((.(.......(((((....)))))).))))...))))))))).)))))).))))).((((..(((((((((...(.......)...))))).))))..))))..)))))).).)))))))..)))((.((((........)))).))((((((((.((((((.......)).))))..)))))))))))).(((.(((((............))))).))).(((((.((.......))..)))))........)))))))..((....)).(((((((....)))))))...........))))))))..(((((((........))))))).............

Thermodynamic Ensemble Prediction

..((((((((((.{((...((((((((..(((,({((({(((,,,(,(,,(,((,||.|,,,...||||{||,..,,,,))}}}.})),,,,,.((((((.....)))))),,|}},,|}||||}}.,....{((({..,|||||((({{{,,,||,||||||||}}||}}}}),,,,.((((.(((({..(((((((((.......,,{{{,({((((((,....{,.....,{|||||(({|.,.,{.({{{{{{{{,..{{{{{.........))))).....(((((.((,.{((((((...................((((....))))))))))))))))))|||||||,((({...((.((.....))...}}))}).,}}))))))||||},}.(((((((.((((.(.((((((.......)))))).}.).))))))))))|||||{{{{{{{{{{.,,,{(({{{...,...((((((((((..(((((((...((.((............}}.))..))))))){{{...))))))))))))).|((((,,...|.))))|,,,||}||||||||}}.}}})))))}}))),.})),,,,...,,)))))))))))))))))){{{{(((((((((((((,((,,..|}}.})))){((((({,,{{{{{{{,{{,...{(((,(((..((((((({,(,(((((((((((((((((({(.((..((((.((({.......{{((....))|||{{.....}}},,....((((((((.......)))))))).)))).))))..)),,,,,.}}))))((((((.,,{{(({{........,,}}))}}}}}.))))))))))).))))))))).}}..|.{{{.....,))),....,,.,(({{{{},|{||,,,|||{{{.|{|{{,,,,,{{{|,{||||,,,,))))),.}))),,,||,|||.,,},,,}},((((...)))))....((((((((...((.(......).))...))))))))...}}))))))))).|..}}}}.,,.{||{{.,,,..,))))|||||,|},,..}))))),||||.{(((.,..|}|(({.....))}}.}},}.((((.((((({.{((((.((((,.{((......))))))).)))))}.......(((((...((((.....))))......(((..((((((((((((((,,(,{,,,.{{{{{.,,,.,,||||{,||.{{{,{,||||||..,,{.|||||,{{,,.{{(({({......{,|||}}..)))}}},}})),,,}|||}}||}|}},}}},}))}}.{{((..{{({(((((|..|...,,..,.,.))))).)})}..)))),.)))))).),}))))))..))).....))))).}))))).))))((((((((.{((({{,.,,...}),))))..)))))))))))))}...,|))))}))}.......))).)}))..}}.}))}...}}})))))))){{{.(({,...,))).))).{{....}}.(((((((....)))))))})))),.....))),))),..{((((((........,}}}}},.............