Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001291823.2

Sequence Length

836 nt

GC Content

0.3325

AUUUCAUGUUAUACUUAAUAAAACAAAACAUACCUGUAUACACACACAUUCACUCACAUUGAAGAUGCAAGAUGAAGAAAGAUACAUGACAUUGAAUGUACAGUCAAAGAAAAGGAGUUCUGCCCAAACAUCUCAACUUACAUUUAAAGAUUAUUCAGUGACGUUGCACUGGUAUAAAAUCUUACUGGGAAUAUCUGGAACCGUGAAUGGUAUUCUCACUUUGACUUUGAUCUCCUUGAUCCUGUUGGAUUCUUCAUAAAGGGACCAGCUAAAGAAAACAGCUGUGCUGCCAUUAAGGAAAGCAAAAUUUUCUCUGAAACCUGCAGCAGUGUUUUCAAAUGGAUUUGUCAGUAUUAGAGUUUGACAAAAUUCACAGUGAAAUAAUCAAUGAUCACUAUUUUUGGCCUAUUAGUUUCUAAUAUUAAUCUCCAGGUGUAAGAUUUUAAAGUGCAAUUAAAUGCCAAAAUCUCUUCUCCCUUCUCCCUCCAUCAUCGACACUGGUCUAGCCUCAGAGUAACCCCUGUUAACAAACUAAAAUGUACACUUCAAAAUUUUUACGUGAUAGUAUAAACCAAUGUGACUUCAUGUGAUCAUAUCCAGGAUUUUUAUUCGUCGCUUAUUUUAUGCCAAAUGUGAUCAAAUUAUGCCUGUUUUUCUGUAUCUUGCGUUUUAAAUUCUUAAUAAGGUCCUAAACAAAAUUUCUUAUAUUUCUAAUGGUUGAAUUAUAAUGUGGGUUUAUACAUUUUUUACCCUUUUGUCAAAGAGAAUUAACUUUGUUUCCAGGCUUUUGCUACUCUUCACUCAGCUACAAUAAACAUCCUGAAUGUUUUCUUAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-160.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -177.88

Frequency: 0.0000

Diversity: 220.72

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

......((((((((.....................))))).))).(((((((.........(((((((((((((.((((((((((((((..((((((((((((((((((.(((((((...((......)).)))............((((((..((((((......)))))).....))))))..((((((((((.............))))))))))))))..))))))).((((((((((....)))))........))))).(((((.........)))))((((.((.....))..)))).......((((((...(((.(.(((((((.....(((((((((((((.........))))))))......(((((............)))))..(((((((...((((((.(.......(((((.........))))).......).))))))..)))))))..................)))))....))))))).).)))..))))))((((....))))...........)))))).))))).....((((((....(((((((.....(((((.......((((........)))).......)))))....)))))))...)))))).....)))))..))))))))).))))))))))))).........((((((..............))))))........(((((((..........((((.............))))......(((((........)))))......(((....))).........)))))))............))))))).........

Thermodynamic Ensemble Prediction

......{((((,,,.,,,.,....,,,,,,....,|||||.||.,((((({{..,..{{{,(((((((((((((.((((((((((((,.......}}}}|.((((((((....{({(,...,......,..},,...,,.......(((((({{((((((......)))))).}},.,)))))..((((((((((.............))))))))))))))))))..((((.....))))..(((((.(((((.....))))})))))....(((((({,({{((({{{..{{,{(((((,.....}))))},}}}.....)))}))})))))))...{(((((((((((.........))))))))})))}{((,(..{({{{...(((((((....{(((((.{({,(((..{.{{{{..{({{{..,(({({,(((((((...(.(({......)))}))))}}}........................||{,.,|||,.,|,..,,|}|,,|,..,}}}}............}})}}},}}........((((((((.{(((((......}))}|}})))))))}..,,.....)))))..)))).)..))).....,}.)))))),))))))).})))),,}))))))))).))))))))))))).........,,{(((......,,,,....}}||||,.{{{....,...))}.,,,}}}}}|,||.,}}}}}......,,,|{,,,...,|||}}......,}})),,,..,|||,...|||.........,,||,.............,))))))),,,......