Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001291896.3
Sequence Length
5431 nt
GC Content
0.4038
GCCGCCGCUCCCGAGGCCCCUGCCGCCGCCGCUCCCGCUGCUGUCGCCGCGCAGAGCCGGAGCAGGAGCCACGGCCGAGAGGAGGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGUGGAGGAGGUGGAGGAGGUGGAGGAGGCGCCGGACCGGGGGGGUGAGUAAGGGGCGGGGAGCUCCAGACGGCCCCAGAGGGAGCGGGGGGCGCGGGUCGGCCGAGCCGAGGGUGAGGCGGCUCAUGUCGCCGGUCAGUCGCCUGGCUCCCCCUUCCUCCUCCGCGUUCCAUCGGUGUCGGGGCGGCGGCCCGGGGGCCUGGCCGGCGGGAGGGGCCGGAGAUCUGGGAGGCCCGGCCGCCGCCAGGGCCAGAGCCAACCACGCCCGCGGACCGACCCGGUCGACUGUAGGCCUGCGGGAGACCGUCGGGAGGGGCCCCGGCCGGCUGUGGGAGAGAAAGAGGACAUUGUGUCCCCCACCCUUCAGCUCCCCGAGGUGUCAUAGCACAAGCCCAUUUCCCUCGCCGUCUCCCCAGACACGGUGCCCUCGUACCUCACUGCCUGAGAGAAGUAGAAGAUCGUCAGUAUUUAAACAGAUCACAUCAUGCGUGAGUACAAGCUAGUGGUCCUUGGUUCAGGAGGCGUUGGGAAGUCUGCUCUGACAGUUCAGUUUGUUCAGGGAAUUUUUGUUGAAAAAUAUGACCCAACGAUAGAAGAUUCCUACAGAAAGCAAGUUGAAGUCGAUUGCCAACAGUGUAUGCUCGAAAUCCUGGAUACUGCAGGGACAGAGCAAUUUACAGCAAUGAGGGAUUUGUAUAUGAAGAACGGCCAAGGUUUUGCACUAGUAUAUUCUAUUACAGCUCAGUCCACGUUUAACGACUUACAGGACCUGAGGGAACAGAUUUUACGGGUUAAGGACACGGAAGAUGUUCCAAUGAUUUUGGUUGGCAAUAAAUGUGACCUGGAAGAUGAGCGAGUAGUUGGCAAAGAGCAGGGCCAGAAUUUAGCAAGACAGUGGUGUAACUGUGCCUUUUUAGAAUCUUCUGCAAAGUCAAAGAUCAAUGUUAAUGAGAUAUUUUAUGACCUGGUCAGACAGAUAAAUAGGAAAACACCAGUGGAAAAGAAGAAGCCUAAAAAGAAAUCAUGUCUGCUGCUCUAGGCCCAUAGUCAGCAGCAGCUCUGAGCCAGAUUACAGGAAUGAAGAACUGUUGCCUAAUUGGAAAGUGCCAGCAUUCCAGACUUCAAAAAUAAAAAAUCUGAAGAGGCUUCUCCUGUUUUAUAUAUUAUGUGAAGAAUUUAGAUCUUAUAUUGGUUUGCACAAGUUCCCUGGAGAAAAAAAUUGCUCUGUGUAUAUCUCUUGGAAAAUAAGACAAUAGUAUUUCUCCUUUGCAAUAGCAGUUAUAACAGAUGUGAAAAUAUACUUGACUCUAAUAUGAUUAUACAAAAGAGCAUGGAUGCAUUUCAAAUGUUAGAUAUUGCUACUAUAAUCAAAUGAUUUCAUAUUGAUCUUUUUAUCAUGAUCCUCCCUAUCAAGCACUAAAAAGUUGAACCAUUAUACUUUAUAUCUGUAAUGAUACUGAUUAUGAAAUGUCCCCUCAAACUCAUUGCAGCAGAUAACUUUUUUGAGUCAUUGACUUCAUUUUAUAUUUAAAAAAUUAUGGAAUAUCAUCUGUCAUUAUAUUCUAAUUAAAAUUGUGCAUAAUGCUUUGGAAAAAUGGGUCUUUUAUAGGAAAAAAACUGGGAUAACUGAUUUCUAUGGCUUUCAAAGCUAAAAUAUAUAAUAUACUAAACCAACUCUAAUAUUGCUUCUUGUGUUUUACUGUCAGAUUAAAUUACAGCUUUUAUGGAUGAUUAAAUUUUAGUACAUUUUCAUUUGGUUUGUGUGUUUUUGUUAUUGUUUAUAGAUUAAAGCGUUUAUUUUAUAAUGACCACAUUGUUUUAAAUGCGACAGUAGCUCCUUUCUGCCUAGUAUCUGCAGAACACUGGCUUUAAACUAUACUAAGUAACUGGUGAUUUCUCUAGGAACAGACCUCGCACUUUCUGUUCUAAAUAUAUUUAUUCCUACUAUACAGUAAAAUACAUCAGACAACAUAGAAUAGUUUUGUAUAUUCUCUCUUGAUCUUAAAGAUUGUAUCUUAUUGAAUAUCCCACUGUAUAUUAUUUUUAUAUGUAAAAAGAUAAGUUUAAUACUGUAUCAGGGUUUAACUUUUACUAUUUCAGAUCUUCCACAGCUUGUAAUUUCAUCAAGGGAAUCCUUUUGCAUUGUUAAUUUGUUGGGUGUGAGUCCACCAAUGAAGUGUUAUGUGAAAAAUUUCAAACUUGCUUUAUAAUAGAUUGAAGAAUUUGAGAGAAGUGAGAGAAAGUUAAAACACAUAAAAGGAAUGUGUUACUUUUGCUUAAACUACUUAUGAAAUAGUAUGGUAGUAGUAAUAUGGAAGAGAUUGCUAAGUUAAAAUUGUAGCUUCCUAUAUAGUGGUGCUUUUUCUUUUCCUUCCCAGUUAUUUUCCUCUUUACAAAAGAUAGGGCUUAAGUAAGACAUGGACCCAGGGUGAUACUACUUAUGUAGUCUCUAUAAAGAGAGGUAGAACAAAAAGCUUGUUAGCCAAUUAAGUUCUGGAAAAGGAAAGAAACAAGCUUAGAAAACCCUGUGCCUUGUCCUCAAAUAUUAAGGAGGAGACAGACCAGUCCUAGAAAGUCUAAGUCAUUGCUCAGGGAUCUCUAGAUACUGUCUCUUUGCAACUAGGUAUGAAGAAGUGUUCAUGCCUUGCUGAGAUUUUCCAGGCAUGUGGUCAGCCUGUCACUUACUAAACUGAAAUUUUAAAAUCAGGUUUCAAAUGUUAAGCUUUGACCAACCUGAGAAAAUGUUAAAGUAUUGUUUUUAAAAAAAUGGAAAUUUUUUUUGUUUGUGUUUUUGUUUUAGUUUCGAAUAAACUUAGUUACCUUACACUUCCCUUCUACUUAUCCAAUUAUGCAUAUGUCUGGGAUUGAGGGGCCAAAACUAUAGCGAACUUGAAUGAAGUAUUAGGGCCAGUUGUCAGGUCAGGGUGGCAUCUUUUAUUUUAAGGUCCUCUAAAGUCAUUCUGCUUUAAAACACCCCUCAAACAUACCUUUAAACUUAAGAUCAUAGACAGACAUCUCAUCAACCAGUAAAACUUUCUAAAUACUACCUUGUCACAUCUAUUGUGUAGUUAUUUAACAGAUUAAAUAGAAGUCAUUUAAUAAGACUCCAAGUCUCAGUCUGCUUGACUAGUAGCAUAAACUCAGUCUAUUCUAUUUUAGAAUGUGGUGGAGAAAGAUGAUAGUUAUUAGAUUCCUUUGUCACAUCUUAUACAGUCCACUUGGGUUAAAGGUGGAACUGUCAAGAAAAACGCCUUUCUGGCACACAGUGAUAUGCAGAGCAGGACCAGCUGAAGUCAGAUGUGCAAGGAAAUCUGUGGUUGCUGAGCAGGAUGAAAAGUAUCCUGUUAGAAAGUGAGAUAGGUGUGUUUUUAUAUUGUCCUAAUGUGAACUCCUUAGUCUUGGUUCCAAAGGGAAGGGUACCUGAAAAUAAAUGUAUUUUUAUAGCUGAAAAAUCAAGAGUUUCUAGGAUAUUGUGUGAAUGUCAAAUGAUAAAUAUCUAGAAACUGAUUUCAUAUUAGUAUGUGUGGCUAUUUAAAGUAUAAUGACUUUGGUUUGGUUAUAUGAGUGACACAGAAUUUAAGGAGGCUUCAUGCCAUAGUUCAUAGUUUGCUCUAAUGGCUUGGUGGUAUCCCUGAACAGUCUACUUUUAGAAAUUAACAGUAAAUACACAAUCCAGCUGUAAUCUUACCCUCCACCAGGGGGAGCUUCAACAUCGGUUAAUACUUUUUUUUUUUUUGAGAUGGAGUCUCGCCCUGUCGCCCAGGCUAGAGUGCAAUGGCUCAGUCUCCGCUCACUGCAACCUCUGCCUCCCGGGUUCAAACAGUUGUGCCUCAGUCUUCCAAGUAGCUGGGAUUACAGGCACCCGCCACCACGCCCAGCUAAUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGACGGGGUUUCAUCAUGUUGGCGAGGCUGGUCUUGAACUCCUGACUUCGUGAUCCGCCCCCCCCUCAGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCGUGAGCCACCGCGCCUGGCCCGGUUAAUACUUUCAUAAGCAUUGAAGUAACUAUUUAAGUCCUAGUACAUAAACACUGUGUGGUUCACAAAAAGGCAUAGAGACAUUCUCUCAAGAGUUUACAAUCUAAUUGGGCAGGGAAGAUACUACAGUUCAUCAAAGAUAUGAAUAACACCCUAGUUUUCUGAACUGCAGCUGCAUGGGUAAUUAUCUUAAGAACUUUUGGCAAAAUAUGGAUGUUGGUGUGUUACUCUCUUCUCCCUACAACUCUGAACUAAUCUGUGUUUGGCACCUUGAUUUGCCAUCAUAAAUGGCCACCAUUUACUCCUCACUGAAAUAUUCUUCUUCUUUGAGGUUAUAAUGUACUUGGAAAAGUUAAUACUUAUAGAAAAUAAUGAUCUUUAUUACCAACUUUAUUAAAACAGGCUUGGAACAUUUUUCUCCAUAGAAGAAUAGUAAUAAGACAUUCUACAUUUCCUGGACAUGGCCAGUUUAAAAUAUUUUGCCCCAUUACCCUUGUAGAUACACAUGUAUUUGUCAGUUUAUGUGCCUCAGUUUUGUCUUAGGCACUGAGGGACAGAAAGAGAAAUAAGGAAUACCUUGGUAUUUUCCUUUGCAAGCAAUCACAGCAGAAUGCUAGAAAACAUAAAAUAUACUCUUAUAAAUUGUAUGUGUGUUGAAACCAAAGUGUGAAGAAAUUGUCAGGUAUUUGGAGGAGGAAAAUAAUUUGUAAAAUAACCUUUUUAAGAAUUUGGAUUUUGUACUUAUUUAAGGUGCUAAAUAUGUGUUAAAAUAUCCCCUCUUGAAUCAGCUCCAGGCUUAAAAGGGCAGAGUGGUUUGGAUUCUUGUCCAGGGUCUGGAAAGAGCUCAUCUUGCCGAGAGGGAAAUAAAUGUGAGCUUUGAG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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1528.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1636.53
Frequency: 0.0000
Diversity: 1536.86
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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