Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001297740.2

Sequence Length

574 nt

GC Content

0.3833

CUAAAUAGCCGCAGCCUCUGCGCGUCGCCCUCCACGGUUACCCCGGCUCUCCGCCCCUCCUUCUCGCGGCGCUCGAGGGACCAUGGCCGAUCCUCGCGUGAGACAGAUCAAGAUCAAGACCGGCGUGGUGAAGCGGUUGGUCAAAGAAAAAGUGAUGUAUGAAAAAGAGGCAAAACAACAAGAAGAAAAGAUUGAAAAAAUGAGAGCUGAAGACGGUGAAAAUUAUGACAUUAAAAAGCAGGAAAAUGAAAAAGACUUGGAAGAAGCUGAGGAAUAUAAAGAAGCACGUUUAGUACUGGAUUCAGUGAAGUUAGAAGCCUGAAACUUUUCUCGUAUGGGGUGGUUUUUGCAUUAAAUCCUGGGGUCCAUUUUACAAUCCAUUAUUUUUGACCACUGCUAUGUGUUCAAGUAGUAUGAGAAUGUGAUUGUUUUUAUCUGGUUACAUAUAUAUUUCUUUGUCUAAUUUAAUAUGUCAAAUAAAUGAGUUCAUCUAAUAAAAUUGUUUAUUUUAUACUUUACAAAAUUUUUAAAUUAACCUUUUAUCAUUAAACCACAUAGACUUUAUGACAGAGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-113.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -126.53

Frequency: 0.0000

Diversity: 163.65

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.....((((((..((((((..(((((((...(((.(((..(((((((...((((...........)))).)).)).)))))).)))..(((((((....)))...))))........(((((((((......)).))))))).........))))))).......)))))).......((((((.....(((((..((((((.((.((.(.((..(((((((((((..(((......((.((((((......((.(((..((...((((((.....((((........))))........))))))....))..))).)).....)))))).)))))..)))))))))))......)).).)).)))))))).))))).....))))))...((((((.((....))))))))(((((((((....))))))))).)))))).........(((((((((........(((((......(((((.......((((((((((....................))))))...))))........))))).....)))))........)))))))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

.......(((((,({{{||||{{({,(,,..({{.(((..(({((((...((((...........)))).)).)).)))})).})}.,|.,|..}}}}}||},..{,|,....,,..}}.,))))))))..{(((({{(((((((({...,(({,(({.,........,}},...}.............(((((..((((((.((.((.{.{,..((({{{{{{{{..{{{......{({(({.{{,{....,{.(((,,.....{|||||.......,,,.,.,...|}},,|{{|{..,,)))),...}},.,.,,)),...})))))}.}})))..)))))))))}),,,...)),),)).)))))))).)))))}})).))))))))))))))|((((((..((.(((.(((((((({....}))))))))))).)))))))),...{((((((((,,,.....(((((......(((((.......,,{{((({({{{..|,},,,......,,,,..,,,,,,.},,}.....,,.))))).....)))))....,,,.)))))))),