Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001300795.2
Sequence Length
3656 nt
GC Content
0.3632
GUAGUUGCAGCUUUUCACCCGAAGCUAUUUAUCCGAGGGACACCGGGAACUGAUGUAAAAGGCAUUCUGGAAGCUCCCUUUUCCUUUUGGCUGGAGAGUGGGGGUGGAUAAGGGGUGCGAUGGCAAGGGUGGAGUGUUUACAGCUAACUUGAAAAAAAUGUCAUGGAAUAAAUUCAGCCUUACUAGAAAAAUUGUGGAGUGUCGGAACUUAGUGAUUUGGCCCGUGACCCUCCAGCACAAUGUUCUGCAGGUCCAGUUGGGGAUGAUAUGUUUCAUUGGCAAGCCACAAUUAUGGGACCUAAUGACAGCCCAUAUCAAGGCGGUGUAUUCUUUUUGACAAUUCAUUUUCCUACAGACUACCCCUUCAAACCACCUAAGGUUGCAUUUACAACAAGAAUUUAUCAUCCAAAUAUUAACAGUAAUGGCAGCAUUUGUCUCGAUAUUCUAAGAUCACAGUGGUCGCCUGCUUUAACAAUUUCUAAAGUUCUUUUAUCCAUUUGUUCACUGCUAUGUGAUCCAAACCCAGAUGACCCCCUAGUGCCAGAGAUUGCACGGAUCUAUAAAACAGACAGAGAUAAGUACAACAGAAUAUCUCGGGAAUGGACUCAGAAGUAUGCCAUGUGAUGCUACCUUAAAGUCAGAAUAACCUGCAUUAUAGCUGGAAUAAACUUUAAAUUACUGUUCCUUUUUUGAUUUUCUUAUCCGGCUGCUCCCCUAUCAGACCUCAUCUUUUUUAAUUUUAUUUUUUGUUUACCUCCCUCCAUUCAUUCACAUGCUCAUCUGAGAAGACUUAAGUUCUUCCAGCUUUGGACAAUAACUGCUUUUAGAAACUGUAAAGUAGUUACAAGAGAACAGUUGCCCAAGACUCAGAAUUUUUAAAAAAAAAAAUGGAGCAUGUGUAUUAUGUGGCCAAUGUCUUCACUCUAACUUGGUUAUGAGACUAAAACCAUUCCUCACUGCUCUAACAUGCUGAAGAAAUCAUCUGAGGGGGAGGGAGAUGGAUGCUCAGUUGUCACAUCAAAGGAUACAGCAUUAUUCUAGCAGCAUCCAUUCUUGUUUAAGCCUUCCACUGUUAGAGAUUUGAGGUUACAUGAUAUGCUUUAUGCUCAUAACUGAUGUGGCUGGAGAAUUGGUAUUGAAUUUAUAGCAUCAGCAGAACAGAAAAUGUGAUGUAUUUUAUGCAUGUCAAUAAAGGAAUGACCUGUUCUUGUUCUACAGAGAAUGGAAAUUGGAAGUCAAACACCCUUUGUAUUCCAAAAUAGGGUCUCAAACAUUUUGUAAUUUUCAUUUAAAUUGUUAGGAGGCUUGGAGCUAUUAGUUAAUCUAUCUUCCAAUACACUGUUUAAUAUAGCACUGAAUAAAUGAUGCAAGUUGUCAAUGGAUGAGUGAUCAACUAAUAGCUCUGCUAGUAAUUGAUUUAUUUUUCUUCAAUAAAGUUGCAUAAACCAAUGAGUUAGCUGCCUGGAUUAAUCAGUAUGGGAAACAAUCUUUUGUAAAUGCAAAGCUGUUUUUUGUAUAUACUGUUGGGAUUUGCUUCAUUGUUUGACAUCAAAUGAUGAUGUAAAGUUCGAAAGAGUGAAUAUUUUGCCAUGUUCAGUUAAAGUGCACAGUCUGUUACAGGUUGACACAUUGCUUGACCUGAUUUAUGCAGAAUUAAUAAGCUAUUUGGAUAGUGUAGCUUUAAUGUGCUGCACAUGAUACUGGCAGCCCUAGAGUUCAUAGAUGGACUUUUGGGACCCAGCAGUUUUGAAAUGUGUUUAUGGAGUUUAAGAAAUUUAUUUUCCAGGUGCAGCCCCUGUCUAACUGAAAUUUCUCUUCACCUUGUACACUUGACAGCUGAAAAAAAACAACAUGGGAGUAAUAAUGGGUCAAAAUUUGCAAAAUAAAGUACUGUUUUGGUGUGGGAGUUGUCAUGAGGCUGUGUUGAAGUGACUUAUCUAUGUGGGAUAUUGAGUAUCCAUUGAAAUGGAUUUGUUCAGCCAUUUACAUUAAUGAGCAUUUAAAUGCAACAGAUAUCAUUUCAGGUGACUUAACAUGAAUGAAUAAAAGUCAAUGCUAUUGGAUUGUUUUUUGUUUGACAAGUGCUAUCUGUGCCACUGAUUUAACUUCUGUAGUAACAAGGGCAUUACCAUUCUUCACCUUUCCUAAUUCUGAUCCCAUAGUUUUACAUUUUUCCUGUUUAUUUUGAUUUUGUUCACUGCUUUAUUUCUUAAAGUUCUAGCACAUCUGUGACUCCUCCACUUCCACAUUUUUGCACUGCUUACACUUACGUGCAAUCUUAUUCCUUGUCUGCACACACAUGUGGAAAGCUAGAAAUAAAUGUUAAAACUUACUUUUUAUAAACAUUUUAAUAUGUAGUUUGGACAUGAUUUAUUGACUUAAGGUUCUUCUCUAAACUGGAAGUGAAAUGCAUGCCUUCUGAAGAUGUUCUGGCUUUGUUAAUUCUGUAAUCAUUUCAUUGGGGAAAAAACCAGCUACGCAGUUUUUCCAAUGAGUGAAUUUUUUCAUUUUGUGUUUUGCUUAAAACGGCUCCUUCAGGGUAGAUGUCAUACUGCAUAACUUUUUUGGAUUCAAAUUAUGAAUGAGAAAUUAGUUAACAUUCUGCUCCACAAGGUAAGAAAAACUGCUCUUUGGCUCUAUUUUCAAAAUUACUUCUGAGAUGCAUAUAGUCUCAAAAUAACAGCUUUAGUAGGCAUAUCACUUCUUGAAAGCCAAACAUGAGUGUAAGACACUUUUAUGAAACACGGUGGAUCCCUAACUGGCUUUCAAAUUGACCUUUAUAGCCUUAGACAACCCUUAGGUAUUUACGGAGAUGACUUCUUUGAUUGUCAUAACAAUUAGUGGAUGUGUCCAGUUCUCUGUAUCUUUGACUUGAUGCUUUAUACAUCAUUUCAUUUGUUGCUUCUAAGGGAAUAAGCCAUAGAGGCUUCUCCAGGUUUAAAAGAACAGUAAAGUACCUGGAAAACCAACAUUUUUGAAUGUAUGGACACUGGACAUGAGAUAUGUACAAUGAAAUCUUAAAAGAAUCUAAGAAUUUGCCCUCUUUGCCCCACUCCACCCAGUAAUUUGACAUUACUAGUGCCAUGUAUAGGACCCAACUGAGUAUUAGAAUCAGUUUUGACUAUGUCUUUGUAUUUCCUAAAUCUUUUAAUGCAUAAACCGAAUUAGGGUCCAGUUGGCCUGUUAAUGGUAAAUUUACAUUUUAAAUGACUCAGUUUGUUUUUCCUGGGCGAGUUUGCAAUGUGAUAAUCAGAUUUUUUAAAACUGAUUAAUUUGCUUUCUUGUGUGGGUGUACUCACAUUUUAAAGUAUGAACCACAGUUAACUAGUGGUCUCAGGGGUAGUGAAACACUCACUUUUUUUUUUGUUUGUUUUUUUUUGUUUGUUGAAAUGGCUUAGUUGAAGUAUACUUAAGGUACUGAUCAUGCUGUGUUAGUAAUUUGGGCGGGGAGGGGGGUAACUCAGCCAUGUUUUGUGUUGGCAUAACAAAACUGUUAAUGAUUGUUGAUUACACUUUUAAGUGAAUUUGUCUUUUAUGAGGAACCCAGUGCAAGUCACUAAAUAUUGUCUAAUAGUGACAUCUGCAUAAGACUUGUAAUAGCUGAAGUUAAUUGAGCUUAAAGGAAUUGUUACCAUUAAAGUCUGUGUUUAAAGACA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-931.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1001.69
Frequency: 0.0000
Diversity: 882.66
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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