Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001300926.2

Sequence Length

2120 nt

GC Content

0.5340

GGGGCGAGCCGUGAAGAUGGCGGCAGUGGUGGAGGUGGAGGUUGGAGGUGGUGCUGCUGGGGAACGGGAGCUGGAUGAGGGUCGAGCACGCACGCAUGCAUGCCAAGCACCGUGGCCAUGAAGCUAUGCAUGCUGAAAUGGUCCUCAUCCUCAUCGCAACCUUGGUGGUGGCCCAGCUGCUCCUGGUGCAGUGGAAGCAGAGGCACCCACGCUCCUACAAUAUGGUGACCCUCUUUCAGAUGUGGGUUGUUCCCCUCUAUUUCACAGUGAAGCUGCACUGGUGGAGGUUCCUAGUGAUCUGGAUCUUGUUCUCUGCUGUCACAGCCUUUGUUACCUUCCGAGCCACCCGAAAACCUCUAGUACAGACAACCCCAAGGUUGGUUUAUAAGUGGUUCCUGCUAAUCUAUAAAAUCAGCUAUGCCACUGGCAUUGUUGGCUACAUGGCUGUCAUGUUUACCCUCUUUGGUCUUAACUUAUUAUUCAAGAUCAAACCAGAAGAUGCCAUGGACUUUGGCAUCUCCCUUCUCUUCUAUGGCCUCUACUAUGGAGUUCUGGAACGGGACUUUGCAGAAAUGUGUGCAGACUACAUGGCAUCUACCAUAGGGCGGUGCUCAGCUUCCACGAGUUCUGCAUCCGUGGCUGGUGCAUCGUGGGAAAGAAGCAAACGUGUCCCUACUGCAAAGAGAAGGUAGACCUCAAGAGGAUGUUCAGCAAUCCCUGGGAGAGGCCUCACGUCAUGUAUGGGCAACUGCUGGACUGGCUUCGAUACUUGGUAGCCUGGCAGCCUGUCAUCAUUGGUGUAGUCCAAGGCAUCAACUACAUCCUGGGCCUGGAAUAGUGAUGAAGAGCAUCAGUGGAAAACCCACCCCACACGCCAUGGACCUCAGGGCACUCUCCUCCCUGCCCACAAAGACCUCCUGGGUGGGAAAGACUCAAAGGGGUGCUUGGGCCACUCAGGACCCCUCUGGCUGUGUCGGACUGGGGAGGGAUAUGAUGGAGAGCCAGCCAGUGGGGCUGUCAGCAGUGGGGGGCUUUUUAAAAGAAAACUAUUUUGAUGAAUAUAUUUAAAAAACCUUUUUUUAUUGUGGAGCAUAGGAAUUGCCCCCCUCCAGGCUUCACCCUCCCUGCCUAAGCAGGGUGGGGGCAGAGCCAUGACAUUUUUGGUUUAAAGGAGCCUUCUCAUCUCUGGCCGAGAACACUGCUGGGCUCCCAGGUAGCUGAAGGCCUCAGCCCACCCACUCCCUUCUUCCCUGUGUGGGGCUCAAGCCUGGUGCACUUAGUAUAGAAGAGCUAACGUACUCAGGCUUGUGCCACGGGUGAGCACUGAGGCCCCAGGUGUCCUCCCUCCCCCACUGUCUGGGACACAGGACAGGUGUUGCGUCUGACUCUGUCUCCCCCUGUCCAAGAGCUAUAGGCUGGUUGAGGCAAGUGGAACCUUAUCAGUGACUUGGCCAACAAGGGAAGCCUUGGGGCCUCAGAAUUCAUUGAAGAUUUGUUUUGGGACAACUGGAAGAAUCAGCACCAUGGAUACUCGCCCGUGGGCAGGGCUGUGGUCAGCCAAGAAUAGAGGUCAUAUAGUUGGGCCAUGGGGCAAUUGUUGGCAGCCAUGACUGACGGCCCCUUGUGCAAGCUCAUUCUUCAGUGGAUCCUUCAGUGGAGUGGUGACACGUGCCAGCGGUCACUCUGCCACAUCACUUCCUUCUUGAAAGCCUAAGAGUGCGUAUGCGUGUGUGUGUGUGUGUGUGUGUGUACGUGAGGCAGAAGAAUAUGACAGAUGUCAGCUUCUCCCUGUGUCAGAUGAUAUGUCCUUGAAGCUGGCAGGGGAUUCCCAGUCCAGGGAAUAUCCCUACAUGAUUUUUGUCAUUCAUGGGUCCUCCCUGGGCCUGACAACGGGAGUGGUGGGUGGGUGAGAACAGGUUCUGAGAGGGGGCUUCUAGGAAGGCCCCAGCCCUAGUCCUAGGCGACUUGAAUAAAGUGGGAGGUCAAACAUGGGCCUUCGGCAUUGGGUUUCUAGGGAAUAUGGCUCAGUAGGGCCUGCCCCUUCAAGGGCAGCAAGAACGAAGCAGGAUGUUGUCACUCCCGUCUGAAUAAAGCUCCAUGAGCUGGGUUGGAAAGCUGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-814.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -853.27

Frequency: 0.0000

Diversity: 565.04

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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