Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001301069.2

Sequence Length

1644 nt

GC Content

0.6308

AGUCGCUAUCGGAGGCCGCGCGGGUGGCUGAGCAGCGGCCUGGUGCGCUCGCUUAGCGGGCGACGGAAUCAGACGGACGUGGACGCCCCCGGAGUGGAAGCCGAAGCAGGAGUUGUUGUUGCUGAGGGGCUGCCGCAGCCGCCGCGAGCCUCCGGACAGACGCCAGAGCGAGGAGGGCGCUACGCGACUUGGCAAGAUGACCCAGUUCCUGCCGCCCAACCUUCUGGCCCUCUUUGCCCCCCGUGACCCUAUUCCAUACCUGCCACCCCUGGAGAAACUGCCACAUGAAAAACACCACAAUCAACCUUAUUGUGGCAUUGCGCCGUACAUUCGAGAGUUUGAGGACCCUCGAGAUGCCCCUCCUCCAACUCGUGCUGAAACCCGAGAGGAGCGCAUGGAGAGGAAAAGACGGGAAAAGAUUGAGCGGCGACAGCAAGAAGUGGAGACAGAGCUUAAAAUGUGGGACCCUCACAAUGAUCCCAAUGCUCAGGGGGAUGCCUUCAAGACUCUCUUCGUGGCGAGAGUGAAUUAUGACACAACAGAAUCCAAGCUCCGGAGAGAGUUUGAGGUGUACGGACCUAUCAAAAGAAUACACAUGGUCUACAGUAAGCGGUCAGGAAAGCCCCGUGGCUAUGCCUUCAUCGAGUACGAACACGAGCGAGACAUGCACUCCGCUUACAAACACGCAGAUGGCAAGAAGAUUGAUGGCAGGAGGGUCCUUGUGGACGUGGAGAGGGGCCGAACCGUGAAGGGCUGGAGGCCCCGGCGGCUAGGAGGAGGCCUCGGUGGUACCAGAAGAGGAGGGGCUGAUGUGAACAUCCGGCAUUCAGGCCGCGAUGACACCUCCCGCUACGAUGAGAGGGACCGGGACCGGGACCGUGAGCGGGAGCGCAGAGAGCGGAGCCGGGAGCGAGACAAGGAGCGAGAACGGCGACGCUCCCGCUCCCGGGACCGGCGGAGGCGCUCACGGAGUCGCGACAAGGAGGAGCGGAGGCGCUCCAGGGAGCGGAGCAAGGACAAGGACCGGGACCGGAAGCGGCGAAGCAGCCGGAGUCGGGAGCGGGCCCGGCGGGAGCGGGAGCGCAAGGAGGAGCUGCGUGGCGGCGGUGGCGACAUGGCGGAGCCCUCCGAGGCGGGUGACGCGCCCCCUGAUGAUGGGCCUCCAGGGGAGCUCGGGCCUGACGGCCCUGACGGUCCAGAGGAAAAGGGCCGGGAUCGUGACCGGGAGCGACGGCGGAGCCACCGGAGCGAGCGCGAGCGGCGCCGGGACCGGGAUCGUGACCGUGACCGUGACCGCGAGCACAAACGGGGGGAGCGGGGCAGUGAGCGGGGCAGGGAUGAGGCCCGAGGUGGGGGCGGUGGCCAGGACAACGGGCUGGAGGGUCUGGGCAACGACAGCCGAGACAUGUACAUGGAGUCUGAGGGCGGCGACGGCUACCUGGCUCCGGAGAAUGGGUAUUUGAUGGAGGCUGCGCCGGAGUGAAGAGGUCGUCCUCUCCAUCUGCUGUGUUUGGACGCGUUCCUGCCCAGCCCCUUGCUGUCAUCCCCUCCCCCAACCUUGGCCACUUGAGUUUGUCCUCCAAGGGUAGGUGUCUCAUUUGUUCUGGCCCCUUGGAUUUAAAAAUAAAAUUAAUUUCCUGUUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-689.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -718.61

Frequency: 0.0000

Diversity: 511.85

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((....(((((((((((((((((.(((....))).)))))((.(((((((...))))))))).........(((..((((..((((((((........))).(((((.(.....).)))))..)))))..))))..))).)))).))))))))...)))(((((((((((..(((((((.((((..((.(((((..(((((...((((((((..(((.(((((.(((...((((((((((..........(((((..((.(((....)))))....(((((((.........................)))))))(((((((((.((.((....((((......((((...((((..((((((....(((.(......).))))))))).))))...))))...)))).......)).)).)))))).)))......)))))....((((........(((((...(((...))))))))..)))).)))))(((((((..((((((((((((.(((..(((((........))).......))...))).)))))))))))))))))))..(((((..................)))))...((((((((.......((((....))))(((.(((..(((.((....)).)))..))).))).....))))))))......))))).))).))))).))).)))))))))))))))))).))))))....((((((...((......)).....)))))).((.(((..((((...))))))).))(((....(((((.(((((.(.(((..((((((((......)))).))))....((((((((.........((..(((....)))..))...)))))))).........(((..(((((((((......((((((..........)))))))))))))))..)))((((..(((.((((((..(((((((..((.((((((....)))))).....((...))...........(((...((((...((((......))))...))))...))).(((((((.(..((.(..(((..((.((..((((((.((..((((.((((....(((..((((.(....).))))..)))((((((((..(......)..)))))).))..(((((....)))))...((((((.........))))))...)))).))))...)).)).))))..)).))...)))..).))..)..))))))).))..).)))))))))))).)))..))))..((.(((...(((((((.((((((((((((.(((((((((((.((((((..((...(((....)))...))..)))))).....((((.(((.......))).))))...........(((((((.((((((.((((...(.(.(((((..((((....))))..))))).).).))))..(((.(((((....))))).))).)))))).))))))).))))))))))).))...)))))))...))))))))))....)))))))).).))))).)))))....))).)))))))..))))))))))).....(((.((((........))))..)))......

Thermodynamic Ensemble Prediction

.(((....(((((((((((((((,(,(((({{{{(({,|,,..,.||||,||}}}))||||||{{...,,...,,|.,||,{.}||}},,,,.{{{{.,{||..(((((.(,...,).)))))..,,)))}.))))}.)))})))).))))))))...)))((((((((((({{(((((((,{{(..(((((.,.{{{{{{,(,(((((((((.((,...(({(((.(((.((,,.((((((({{.((((.{(((...((((((,(((((((((....(((((((,.{..................,,,.))))))},{{((((((.{{{(((((.(((....))).))))),.,|(((((((((,..{({((({{....,,{{{..||||,||||||.},}}.....{{|||......,||,}||||}.}}},,,,..,({....}}..,))}....{{((((,..,||},,..,|||||,...,}}}})))||{(((((({((((((((((((.(((..(.{((..,..,,......,,..,)},..))).))))))))))))))))}))..(((((..................)))))...{{{{{||{,,||,...,,|}}}}}})}|||}|||,.{(|.{|....,).))),,}}}.}}}}}.}|))})))}}......{{.....}}.......,,,.}))))))}}{(((({{.{|,.,,|,,).})))|||...((,,...|||(({,.|({{{|(({{{((..,.{{.||||}}||,}}}.||},..}}}},|}}||....(((..((((((((......)))).)))).))),((((,((.,....,,.}}},((((..((((..(((((((((....(((......(((..(((((((((......((((((.,.....,..)))))))))))))))..))))))....))))))))}..{(((..(..,,.({{(({....))))))..)..)))}..,........,..))))..))))..,{{{{......}))),.(((({(..,,,.||||||,.,,}||}},,|||..(((((.(((.(((.(.,,((,,.|}|.}.}.))}.}}|}}}}}..,||||||..}})})}||||,.,..,,)}}))))})))).))|,({{({,..,))))),.,||||{{...}}},.})))))),,.{(((..((((..((..{...},.))..)))).)))}{}{|,.{|{{||||||,.,|||...,.,,.))),,.})))}.)))),.}).}..}})))})))).))).))).}}).)))))))))}},.(({((((((((((((.((.((....(((,...{((.{(.(((.((((((({{(.{.,((,({((({(((.(((((,...(((((((((..((((...{.(.(((((..((((....))))..))))).).}.))))..,,......)))))))))))))).))),))}))))).,,)))}..)))))))))))),))))))..)))).))))),,)))))))).,.}}.},}}})),}))))).)),)))))))}.))))))))))).....(((.((((........))))..)))......