Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001301226.2

Sequence Length

1036 nt

GC Content

0.5840

AGUCCCGCUCCGUCCUCCUCGCCUGCCACCGGUGCACCCAGUCCGCUCACCCAGCCCAGUCCGUCCGGUCCUCACCGCCUGCCGGCCGGCCCACCCCCCACCGCAGCCAUGGACGCCAUCAAGAAGAAGAUGCAGAUGCUGAAGCUGGACAAGGAGAACGCCAUCGACCGCGCCGAGCAGGCCGAAGCCGACAAGAAGCAAGCUGAGGACCGCUGCAAGCAGCUGGAGGAGGAGCAGCAGGCCCUCCAGAAGAAGCUGAAGGGGACAGAGGAUGAGGUGGAAAAGUAUUCUGAAUCCGUGAAGGAGGCCCAGGAGAAACUGGAGCAGGCCGAGAAGAAGGCCACUGAUGCUGAGGCAGAUGUGGCCUCCCUGAACCGCCGCAUUCAGCUGGUUGAGGAGGAGCUGGACCGGGCCCAGGAGCGCCUGGCUACAGCCCUGCAGAAGCUGGAGGAGGCCGAGAAGGCGGCUGAUGAGAGCGAGAGAGGAAUGAAGGUCAUCGAAAACCGGGCCAUGAAGGAUGAGGAGAAGAUGGAACUGCAGGAGAUGCAGCUGAAGGAGGCCAAGCACAUCGCUGAGGAUUCAGACCGCAAAUAUGAAGAGGUGGCCAGGAAGCUGGUGAUCCUGGAAGGAGAGCUGGAGCGCUCGGAGGAGAGGGCUGAGGUGGCCGAGAGUAAAUGUGGGGACCUAGAGGAGGAGCUGAAAAUUGUUACCAACAACUUGAAAUCCCUGGAGGCCCAGGCGGACAAGUAUUCCACCAAAGAAGAUAAAUAUGAAGAGGAGAUCAAACUGUUGGAGGAGAAGCUGAAGGAGGCUGAGACCCGAGCAGAGUUUGCCGAGAGGUCUGUGGCAAAGUUGGAGAAAACCAUCGAUGACCUAGAAGAGACCUUGGCCAGUGCCAAGGAGGAGAACGUCGAGAUUCACCAGACCUUGGACCAGACCCUGCUGGAACUCAACAACCUGUGAGGGCCAGCCCCACCCCCAGCCAGGCUAUGGUUGCCACCCCAACCCAAUAAAACUGAUGUUACUAGCCUCUCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-359.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -378.52

Frequency: 0.0000

Diversity: 297.09

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..(((.((((((((((((((((((....(((((....((..(((((((...(((((..(.((.(((((.((((.(((((((((((((.((((.....(((((.((.((.((..(.((.((..........(((((..(((..((((.............((..(((.((((.....)).)).))).))............))))..)).)..)))))(((..((...(((((.((.....)))))))...))..))))).)))..))..)).)).)))))...(((.(((((..(((.....)))....)))))...))))).)).)))))......(((((((...(((....)))...))))))).(((.((((((........)).)))).)))(((.((((..((((((........))))))...)))))))))))..)).))..))))))).)).))))))))....))))).))..)).((((...)))).....))))).......))).)))))))..))))))...)).)))..(((.((((((.....(..(((.....)))..)..))))).).))).......((.(((.(((((....))))).))))).....(((((((((((((.((((...(..(((.((.(((((((.(.(((.....(((((.(((.....)))((((.....((.(..((((((..((((..(((((((....)).((.(((.......))).)).................)).)))..))))..))))))).))..))))..(((..(.((((..((.(((((.(((((....(((((((((((......(((......)))((((((.(((........(((((((....))))))))))....))))))...))).))))))))....))))).)))))))..)))).)..)))(((.(((....))))))))))).....))).).)..)))))).)).)))..)....)))))))).)))).)))))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

..{{(.,,((((((((((((((((,,,.(((((....((..(((((((...(((((..({((.((((({((((.{{(((((((((((((,,......((({,.(({({,(,..,,{({((........))}||,,,}|||}..|,|}|....{{......}}.,,|.))}.}}}}.))}))}|}..|{},.......,,..)})},)),)},||}|,,,({{((...(((((.((.....)))))))...,..,)))}..)})}.}}..|},|}.}}}}}....,..,,||,..(((.....))).{{((((......)))).)).||||,......{((((((...(((....)))...)))))))}(((.{{{({|,,|..,,.))})))).))){{{.((((..((((((.,....,.))))))...))))|||,|||..})})},,),}|||}.,,.))))))))....))))).))..)).,{{,...})}),....))))),,.....))).)))))))..)))))).{({((,,...}}|}|(({{,...,,({.{{{.....)))..},.})))).,.,,........,{.(((.(((((....))))).))))))},.,((({(((((((((.((((...{..(((.((.(((((({.,.(((.....(((((.(((.....)))((((.....,{.{{.((((((..((((..(((((((....)))||.(({.......})).}}..................,.)))..)))}..)))))),}})..))))..,((.{({((,(.,((.{((((.(((((,,.,({(((((({(,,,..,,(((.,,...}},((((((.(((........(((((((....))))))))))....))))))..,))})))))))))}...))))).))}))})..)))}.}..}))||{.|||,}}})))),}))))).....))).}.}..)))))).)).)))..,....)))))))).)))))}))))..