Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001301289.2

Sequence Length

1577 nt

GC Content

0.4845

AGCCAGGACAGCCGCGGCAGCCGGGUCCGCAGGGCAGCAGCCGGCCUCUCCCACUGCAGCCCUCCCGCCCGCCUACCGUCCGGCGCGAUGGCGGGGAGUAGCUCGCUGGAGGCGGUGCGCAGGAAGAUCCGGAGCCUGCAGGAGCAGGCGGACGCCGCUGAGGAGCGCGCGGGCACCCUGCAGCGCGAGCUGGACCACGAGAGGAAGCUGAGGGAGACCGCUGAAGCCGACGUAGCUUCUCUGAACAGACGCAUCCAGCUGGUUGAGGAAGAGUUGGAUCGUGCCCAGGAGCGUCUGGCAACAGCUUUGCAGAAGCUGGAGGAAGCUGAGAAGGCAGCAGAUGAGAGUGAGAGAGGCAUGAAAGUCAUUGAGAGUCGAGCCCAAAAAGAUGAAGAAAAAAUGGAAAUUCAGGAGAUCCAACUGAAAGAGGCCAAGCACAUUGCUGAAGAUGCCGACCGCAAAUAUGAAGAGGUGGCCCGUAAGCUGGUCAUCAUUGAGAGCGACCUGGAACGUGCAGAGGAGCGGGCUGAGCUCUCAGAAGGCAAAUGUGCCGAGCUUGAAGAAGAAUUGAAAACUGUGACGAACAACUUGAAGUCACUGGAGGCUCAGGCUGAGAAGUACUCGCAGAAGGAAGACAGAUAUGAGGAAGAGAUCAAGGUCCUUUCCGACAAGCUGAAGGAGGCUGAGACUCGGGCUGAGUUUGCGGAGAGGUCAGUAACUAAAUUGGAGAAAAGCAUUGAUGACUUAGAAGAGAAAGUGGCUCAUGCCAAAGAAGAAAACCUUAGUAUGCAUCAGAUGCUGGAUCAGACUUUACUGGAGUUAAACAACAUGUGAAAACCUCCUUAGCUGCGACCACAUUCUUUCGUUUUGUUUUGUUUUGUUUUUAAACACCUGCUUACCCCUUAAAUGCAAUUUAUUUACUUUUACCACUGUCACAGAAACAUCCACAAGAUACCAGCUAGGUCAGGGGGUGGGGAAAACACAUACAAAAAGGCAAGCCCAUGUCAGGGCGAUCCUGGUUCAAAUGUGCCAUUUCCCGGGUUGAUGCUGCCACACUUUGUAGAGAGUUUAGCAACACAGUGUGCUUAGUCAGCGUAGGAAUCCUCACUAAAGCAGAAGAAGUUCCAUUCAAAGUGCCAAUGAUAGAGUCAACAGGAAGGUUAAUGUUGGAAACACAAUCAGGUGUGGAUUGGUGCUACUUUGAACAAAAGGUCCCCCUGUGGUCUUUUGUUCAACAUUGUACAAUGUAGAACUCUGUCCAACACUAAUUUAUUUUGUCUUGAGUUUUACUACAAGAUGAGACUAUGGAUCCCGCAUGCCUGAAUUCACUAAAGCCAAGGGUCUGUAAGCCACGCUGCUCUUCCGAGACUUCCAUUCCUUUCUGAUUGGCACACGUGCAGCUCAUGACAAUCUGUAGGAUAACAAUCAGUGUGGAUUUCCACUCUUUUCAGUCCUUCAUGUUAAAGAUUUAGACACCACAUACAACUGGUAAAGGACGUUUUCUUGAGAGUUUUAACUAUAUGUAAACAUUGUAUAAUGAUAUGGAAUAAAAUGCACAUUGUAGGACAUUUUCUAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-472.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -503.25

Frequency: 0.0000

Diversity: 526.40

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((((((..(((..((((...((((..(((((((.((((..((......)).)))).)))))(((((((.(((((((((((((.((...((((((.((.((.((((...(((((((..(.(((...)))...((((((....)))))))..)))))))....)))).))..)).))))))....)).)))))))..........(((((.((....)).(((..(((..(.((((((((.....(((((((.(((.(((((((.((......)).))))).))...))))))))))....(((((((...)))))))..)))))))).)..)))..)))......((((.((.((..(((((((..((.((.((((..(.(((...(((((.......((((...(((((.........)))))........((((...))))......(((.(((.............)))))))))).......))))).))).)..)))))).))...((((((((((((((((((((.(((....((((....))))...(((....)))...........(((((............)))))..)))))))))((.(((.....)))))(((((.((((((((...(((..(((((....(((((((((((.((((((.(....(.((((...)))).)).)))))))))))))....(((.((((...((((...(((((((((((((.((.........((((....))))...........)).)))...))))).))))).........(((((((..((...))..)).)))))...)))))))).)))))))....)))))..)))...)))))))).))))).....))))))....))))...))))........))))))))).)).))))...................))))).))).))))))))))..................))..)))).))))..)))..)))))))...(((((((...((((.(.((((((...((.(((((.(((.............))).)))))))...)))))).).))))....................(((((((....(((((((((.......((((((..........))))))..((((......))))..)))))))))...((((((((((((.((......))))))))))))))(((((((((((((((((((((((((............(((((((((((((...))).)))))))))).(((((((((.((.....((....)).....))...)))))))))(((((((.((((..((.((((..........)))).))..))))..))))..)))..(((((...((.(((((.......((.((((....)))).)).....))))).)))))))...........((((........))))...)))).........))))))))............)))))))))))))..))))))).....))))))).(((((....)))))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

.(((,((,..{||..|||,...((((,,(((((((.{(((,,((,,,,,|}|.||}|.|||||((((((({((,,,,,,,,|||},,..}||||((.,(,(({((((,.,(({(((({.{.(({...}))...((((((....)))))),..}||||||....)))).))}.)),))))}),,}})),)))),,)}....||}|.,||||.((,,..}},(((..(((..(.(((((((({{,..(((((((.(((.(((((((.((......)).))))).))...)))))))))).,..(((((((...))))))),})))))))).)..))).,)}|.,,,.|{{{,|||||{|{({,..{{|.{(((((((..(((((.......,,.........{((...{(({(.....,,..||}||.,,{{{{|{((,...|||}......(((.,((.|...........))))))|,},.,,}})))),)).}}.,,.((..((((.......))).)..)))))))..))))))),..((({....)))){(((((................{.(((((...,....,,..)))))...})))))}))}}{((,,,,.,||{{(((((,({({({(({{,({.({{{{{{,...{({((((((((.((((((.{..,{(.{{{,..,))}}.}).)))))))))))))},{{(({.,,,,.,,|({,...(((((((((({((.,,.........((((....))))...........)),}}}...)))))}}))))...}}.{.,{{|,|||},|||..,|..,,,)).....,})))))}}})))))}}...,)))))),)),})})))})))),)}}}}...,.,}|}|,,,|||,,,..{{||,.,,|,|||},,,}|,..,||,|||,,|,..,,{{,....,,|,{|||,,.})}.}}}))}||||{{{{.{{{{{......{{|,..||||.,,,,.))))..,))),,},...|||||...}||||}{,((((({...({{((((({(((.{,..,,,..||.}||,}||||||..,|||||}.},||||{.,,{,.....{{{,..{{{,,,,,.|}}...{|||{{{{,...((({{....(((((({{{.(((((((....,...{{({{,{(.(({{{({(....((((((((((((.((......))))))))))))))....}}}}}}},)},,}},}})))))))).)}},...(((((((((((((...))).)))))))))).(((((((((.((.....{{....}}.....))...)))))))))(((...}}}}|||}}}}}})}))},,,,}}}}},))))))))))),}}|||,|}},.,|||..,})}}|,|{,...,,,,||,||||...,))))|)},..,.|||||,,,}|||,......,.,,}|{{{........)))).,})))}}}}}},,}})}})),,}.,{,,,,,}},.,,|||}}}},,}}..}}}}}}}..,,|}}}}}}},||||,,.,,)))),..