Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001302821.2

Sequence Length

1185 nt

GC Content

0.5384

AGUUCCCCAAAGAUAACACAGCUUUGCACAGUGGAUGUUUACUUGCUGGUGGUCUUAUCUAAGAUCAACAUUGGCAGCUGUGCCCGGAGAGGCCUCCAGGGUCCAGGUCCAAUGCACUUCCCUCUCAGAAGAGGCAUCCGCUAAAAUAGGGACCAAAGCUGCUGGAGGGAGGCAAGGCAAGCUGCUAUGUGAAAAAACGCCAGGCCAGGCAGUCAUGUCACACCUGGCAGAAAUGACUGAAGCAUAGCCACUGGCUGAAGUUAUCCCCACACCCACUCUCUGGAGAGGAUGAUCAGGAGCAGUCUGCUCAACCGGGAGGGCCAUGCCCACUUGGGGCACCCCGCCACCGUGUUCCAGGGACAGCUGGAGCACAUGCUUCUUCCCUCGCCAACCCAGCAAUUCCGCAGGGCAUCUGACCUCCACUGUUGACUUCUACCCAGAGGACAAGAACAUUUUUAGUUCCCAAGGAAUGUACAUCAGCCCCACGGAAGCUAGGCCACCUCUGGGAUGGGGUUGCUGGUUUAGAACAAACGCCAGUCAUCCUAUAUAAGGACCUGACAGCCACCAGGCACCACCUCCGCCAGGAACUGCAGGCCCACCUGUCUGCAACCCAGCUGAGGCCAUGCCCUCCCCAGGGACCGUCUGCAGCCUCCUGCUCCUCGGCAUGCUCUGGCUGGACUUGGCCAUGGCAGGCUCCAGCUUCCUGAGCCCUGAACACCAGAGAGUCCAGCAGAGAAAGGAGUCGAAGAAGCCACCAGCCAAGCUGCAGCCCCGAGCUCUAGCAGGCUGGCUCCGCCCGGAAGAUGGAGGUCAAGCAGAAGGGGCAGAGGAUGAACUGGAAGUCCGGUUCAACGCCCCCUUUGAUGUUGGAAUCAAGCUGUCAGGGGUUCAGUACCAGCAGCACAGCCAGGCCCUGGGGAAGUUUCUUCAGGACAUCCUCUGGGAAGAGGCCAAAGAGGCCCCAGCCGACAAGUGAUCGCCCACAAGCCUUACUCACCUCUCUCUAAGUUUAGAAGCGCUCAUCUGGCUUUUCGCUUGCUUCUGCAGCAACUCCCACGACUGUUGUACAAGCUCAGGAGGCGAAUAAAUGUUCAAACUGUAUGCUGAUGUUCCAAAUGGGAAUUUAUUUCAAAGAGGAAAAGUUAAUAUUUUACUUUAAAAAAAUCAAAAUAAUACAAAUAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-424.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -445.38

Frequency: 0.0000

Diversity: 303.95

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((((((.......((((((((..((((..((((.((.((((((((((((((((((....))))))).((((((.(.(((.((((((((....)))).)))).))).)))))))..((((((((((((....((..(((.(((...))))))))....)))..)))))))))...((((.((((((.(.(((......((((((...((((....))))...))))))....((((((..(((.(((...))))))..)))))).....((.((.(((....))).)).)).))).))))))).))))((((.((((((...((((((....(((((.....))).))(((((((((......))))))))).......................((......)).))))))....))))).).))))...(((.(((((((((..........(((((((((...((..((.....))..))...)).))))))).....(((((..((..(((((((((...((((..((....))..((((.....))))(((((((((.....((((...((((.((..((...(((((((......))))))).))..)).))))...)))).(((....)))...(((((.((((((.((((.(((((...(((((.(((((((((((((.((.((((....)))))))).)))(((.....))).)))))))))))))......))))).).)))..((((((..((((.(((.....))).)))).)))))).(((....)))....))))))...))))).(((((....(.((((((((....)))))))).))))))..(((((......)))))))))))))).))))...))))))))).)).))))).((((((((....))))))))...))))))))).)))((((.....)))))))))....)))))).)).))))(((((........(.((.((((....)))))).).......)))))(((((((((((.(((((((..((....)).))))))).)))).....))))))).............)))).)))).))))......))))))..........((((.(((((....))))).))))............................

Thermodynamic Ensemble Prediction

,((((((.......((((((((..((((..((((,((,((({((((((((((((((....})))))}.((((((.(.(((.((((((((....)))).)))).))).)))))))..((((((((,{{(.{{,{{..(((.(({...}))))),,....}||}|||}||||||...((((.((((((.{{({,.....,((((((...((((....))))...)))))).,..{{(({{..(((,(((,..}}))))..}}||||,{,..,,.({.,{{...,),).)),)),)}}.|||||},.))))}..({(((.((({..,||||.}}}})(((.....)))...(((((((((......))))))))).,||||||||||,.,,,...|}|||,.,{{{,|,({|{..,{{.|||,,.|,||||.,,{((.((((((((,...,.,,,,,{(({{{{{{..,||,,||,....}},,))...))}}}))}}},..}}}||||}.||||(((((((((...((((..,,....}}..{(((.....)))}(((((((((.....((((...((((.((..((...(((((((......))))))).))..)).))))...)))).(((....)))...(((((.((((((.{((({{{(((...((((,{((((((((.....(({((((((,,((....)))))))}))....})}..)))))))))))))...,,.}}}},.}.,}}..((((((..((((.(((.....))).)))).)))))),|||,,,.))).,..))))))...))))).(((((....,.((((((((....)))))))).))))))..(((((......)))))))))))))).))))...))))))))).}},}}}))}||||{|||.,,,)))))|||...,)))},)))}))}||{{.....))))}}})),,.,}})))}.}}.}))).,{{{,,..,,.{{{{{.{,,{{{,.,|||{|{.,......)))))}|,||||((((.(((((((..{{....}}.))))))).))))...}})))})),}}},,}}}},...)))).)))).))))......))))))}...,,....({({.((({{....,)))}.))))............................