Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001303436.1

Sequence Length

1923 nt

GC Content

0.5413

CAAUCUUUAAGAAGCUGCUACAGCUAUAAUGUAAGGUUAAGAGUUUAUUCUUUCAAAGCAGGUCUCCUCAUCUCUUAAACGCUAUACAUAUGAAGUAGAUAAAAACUGGUUUCUUUUUUGGUAGCAUUUAGGAUCUACAAAAGUGAUCCUUCAAUUACUUGGAAUUUCAAAAAAUUGAGGUUACCUAGUAACAAUGCACCAGUAGAACACAAAAUACUCUGACUUUGUUUAGUCUGUGGGAAAAGAAAAAUCUUUAAACUGGAAAGAUUUUGUAGUCUUACAAAGAUUACAUUGGAAUUGGAAUUACUGUAGUUCGUUUUUCCCUCUAGGAGGGCAGCCAUUUCUCUAAAAGUUGUGUAAAAGUUAAGACUAGGAUUUCAAAAUGCAAGCAGAUGUUGAUGAAGCAUACGAAAUGGGCAACUCCGUUUCUAUUUCGGAGCCGCAGCGACUCCGACUUUGUGCCCCAACCCUGUAAAGGGCAAAACCUCAUCCCUUCGGUGUAAACUUUCAAGAGAAGUGGGGCAGCACACUUUAGGCGUUUCACCAAGAGGCUGGCGACAUGCUAGGUCAGGUUGUCCGGAGAAUCGGGGCUGAAUGGGAGAGAUCUUGAGGGCAAGAGCCUCAGAGACCUUCAGGCACCGAGCUCGUGAAGGUUUCCAAGUGCCCCUCUCUAGCUGCUCCCAGGGGGAAUUAGUGGUUGCUACAGUAGUUUAAGAGGGUCGUGGUUUUUCGCAACCCGGGCGGCGAGAUGGCGCUUUGGUGUAAGCGAGGUGUCACUAGUUCCAGGCGUCUGCUGAAAGAUUUGGAACAGAAGAUGAUGGCCACUCCGAACCAGACCGCCUGUAAUGCAGAGUCACCAGUGGCCCUGGAGGAGGCCAAGACCUCUGGUGCCCCGGGGAGCCCCCAAACACCCCCUGAGCGUCAUGACUCUGGUGGUUCCCUGCCCCUGACACCGCGGAUGGAGAGCCACUCAGAGGAUGAAGAUCUUGCUGGGGCUGUCGGUGGCCUGGGCUGGAACAGUAGGAGUCCCCGGACCCAGAGCCCAGGGGGCUGCUCAGCGGAGGCUGUGCUGGCCCGGAAGAAACACCGUCGGCGGCCAUCGAAGCGCAAAAGGCACUGGCGACCCUACCUGGAGCUGAGCUGGGCUGAGAAACAACAGCGGGAUGAGAGGCAGAGCCAGAGGGCCUCCCGGGUCCGCGAAGAGAUGUUCGCCAAAGGCCAGCCCGUGGCCCCCUACAACACCACCCAGUUCCUGAUGAAUGACAGGGACCCGGAGGAGCCCAACUUGGAUGUGCCCCAUGGGAUCUCCCACCCAGGUUCCAGUGGGGAGAGUGAGGCCGGGGACAGUGAUGGGCGGGGCCGAGCGCACGGUGAGUUCCAGCGGAAGGACUUCUCUGAGACUUACGAACGCUUCCACACCGAGAGCCUGCAGGGCCGCAGCAAGCAGGAGCUGGUGCGAGACUACCUGGAGCUGGAGAAGCGGCUGUCGCAGGCGGAGGAGGAGACUAGGAGGCUGCAGCAGCUGCAGGCGUGCACCGGCCAGCAGUCCUGCCGCCAGGUGGAGGAGCUGGCUGCCGAGGUCCAGAGGCUCCGGACCGAAAACCAGCGGCUUCGUCAGGAGAACCAGAUGUGGAACCGAGAGGGCUGCCGCUGUGAUGAGGAGCCGGGUACCUAGGGGUGCCUCCCAGCCUGGUGGACCCAAGGAGAAGGUCCCAUUUCGUGCACACUCAGGCCAGCUGGGUCUCAAGGAGGCAGGUGGCAGAUGAAAACCACCGUCAACACCCUGUGCGCCCUGAGAACAGCUAAAUCGGUUCAGACUCCCACCUCACCGUUUCCAUAGUUGGCUCUUUUGUGUCAUCUUACCCUUUACAGAGAAAUUAAAUGGCCUUGGUGGGACCAAAUGGGAAAAAAAAAAAAAAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-712.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -749.66

Frequency: 0.0000

Diversity: 448.17

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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