Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001304382.1
Sequence Length
609 nt
GC Content
0.4220
GCAGUUGUCUUUGGUAGUUUUUUUGCACUAACUUCAGGAACCAGCUCAUGAUCUCAGGAUGUAUGGAAAAAUAAUCUUUGUAUUACUAUUGUCAGAUGGAGCCAACCCUGAAAAUUCUGGGAGAAGAGGACAGAAGGCAGAGGGAAGAGCAAGAGCAAAAAUUCUGAAACAGGAGAAAUUGUGAGCAUAUCAGCAUUAAGUACCACUGAGGUGGCAAUGCACACUUCAACCUCUUCUUCAGUCACAAAGAGUUACAUCUCAUCACAGACAAAUGGAGAAACGGGACAACUUGUCCAUCGUUUCACUGUACCAGCUCCUGUAGUGAUAAUACUCAUUAUUUUGUGUGUGAUGGCUGGUAUUAUUGGAACGAUCCUCUUAAUUUCUUACACUAUUCGCCGACUGAUAAAGGCAUGAGGAUGUGGCCUGCAUGCUGCCUGAUCUUGCCUAGAACCGGCUGCACCUGCUGUUCUCUUGUUUAUGCAAACUGGCUGCACCUGCUAUUCCUUUGCUUAUGCCCCUACCCCUGGCUAUCCUAAUUCCCUGUUCUCCUGCCUCACUAUUACUGUAUUCUCUACUUCUAAAUAAAAAUAAAACAAAAUACAAACCGUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-153.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -163.73
Frequency: 0.0000
Diversity: 182.14
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.......(((((..(((((.((.....((((((.....((((...((((.(.((((((((.(((.......))).)).))).))).).)))).))))....)))))).....)).)))))((((((((.(((((((((((..((((..(((.......(..(((((((((((.((((((((......))............(((((((((...)).))))))).............))))))((.((((((((((((((((.(((((....(((((((((((...)))))..)))))).(((...))).....(((((((......)))))))))))).)))))))(((..(((((((((..(((......................))))))).)))))..)))....)))))))))))((((((.(((.(.(((.....))).).))).)))..)))..)))))))))))..).......))).....)))).)))))))))))..(((.........)))............)))))))))))))........)))))...........................................
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((.,.....(((((,.,{{{{.{{..,..((((((.....((((...((((.(.((((((((.(((.......))).)},})).))).).)))).))))....)))))).....}|,|||||{(((({((.(({((({((({,,{(((.(((({,.....{..(((((((((((,{{{,({(,,..,{,|{,....{,,,,,.(((((((((...}|.))))))}..{{{(({{({{{{{....,({(......}}|{{{{{{,||,,,}|||||{{,{(((({...})))),,||||||,,,({{{{{{{{...(((((((......))))))).,}}}.})}}}}))})))))},,.})|}}}}}}.},,.,,,,,,,,,.........{{{,,.,,,...,))},.}|||,}}|||,,}||||||,|||,{.{{{.,,..)}}.,.})).}},..})),}}))))))))))..},,....,}})}}...)))).}}}}))))))).,||{.,,.,,,,,)}),..........,))}))))))))))........)))))...........................................
Back