Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001304423.3
Sequence Length
3694 nt
GC Content
0.3549
AGUUUGGGCUUGGAUGGUAACGUUUAUUUUCCUUGGCAGAGAAGCUGAUCGUCGAAGGGCAUCUAACCAAAGCGGUAGAAGAAACAAAGCUUUCAAAAGAAAAUCAGACAAGAGCAAAAGAAUCUGAUUUUUCAGAUACUCUGAGUCCAAGCAAGGAAAAAAGCAGUGACGACACUACAGACGCCCAAAUGGAUGAGCAAGACCUAAAUGAGCCUCUUGCCAAAGUGUCCCUUUUAAAAGCCCAAUUGCAGAGGUUACACAUCGAUACUGAGAAUCUCCGGGAGGAGAAGGACAGUGAAAUCACAAGUACUAGAGAUGAAUUGCUUAGUGCCCGAGAUGAAAUUUUGCUCCUUCAUCAAGCAGCAGCAAAGGUUGCCUCUGAGCGGGACACUGACAUUGCUUCUUUACAAGAAGAGCUUAAGAAGGUGAGAGCUGAGCUUGAGCGGUGGCGGAAAGCAGCGUCUGAAUAUGAGAAAGAAAUCACAAGUCUGCAAAACAGUUUUCAGCUUAGAUGUCAACAGUGUGAGGACCAGCAGAGAGAAGAAGCAACAAGGUUGCAAGGUGAACUAGAGAAGUUGAGAAAGGAAUGGAAUGCAUUGGAAACCGAAUGCCAUUCUCUAAAAAGGGAAAAUGUUUUGCUAUCAUCAGAACUGCAACGGCAAGAAAAAGAAUUGCACAAUUCUCAGAAGCAGAGUUUAGAGCUUACCAGUGAUCUCAGCAUCCUUCAAAUGUCUAGGAAAGAACUUGAGAAUCAAGUGGGAUCCUUGAAAGAACAGCAUCUUCGGGAUUCAGCUGAUUUAAAAACUCUUCUCAGUAAGGCAGAAAACCAAGCAAAGGAUGUGCAGAAAGAGUAUGAAAAGACACAGACUGUACUCUCAGAACUGAAGUUGAAGUUUGAAAUGACUGAGCAGGAAAAGCAGUCAAUCACAGAUGAGCUCAAACAGUGUAAAAACAACCUGAAGCUGCUCCGAGAGAAAGGAAAUAAUAAACCCUGGCCCUGGAUGCCCAUGUUGGCUGCCCUGGUUGCAGUAACAGCCAUCGUGCUGUACGUGCCAGGUCUGGCCAGAGCUUCUCCAUGAGAGCGUUCCUUGAGUCCGUACACCGUCCUCCCUCUAGAAGCUGGCAUCACACUCAUGCUGGGGACAAACAGAACCAUUUUCUUCCUCUUUACCUCUUAAAACAGCAGAAGUACAAGAAUACAGCUGUAGGGUCAUUGCUUUAAAUUAUAUAAAAUGUAUCUGUCUAUAAAGAAGAUAUAAAAUUGUGACUUUAUUCUACUGUAAGCAAUAAUUUGCUUGCAAUUUUUCAUGUAAUUUUUAAAUUAGUAUGUUAAGAUUCUGAAUAUUAUGGUGGCCUAAAGUAGGCUUCUUGGUACACCAGAUUAUUUAUAACAUUAAAUUUAUGAGUAUUUUACUCUGAAUUCUGAUCACCAGAUAAUUCAUUUUUCUGAUUUGAUAACUACCCAAACCAAACAACCAAUACAUACAUGGGAAGAGAGGCCCUGUGUGCUCAGUGCCUAUCAGUUUGAAAUAUAUACACAUAUAUAUAUUUUUUACAUAUUUACGCCAUUUUUACUUGUUAUGAAACCACUGAGCUAUUGGGAACAAGACUUAGAGACAACUAUUUGCGUGGAUUUUUUUUUUUUUAAGGAAAAAUACGUUUGGAAAAUAAACUGUUAUGGUGAUAAUUUGGGGAAUAUGUGCACGCUUGUUCAGCCUUAAUGUGACUUGAAGAUGUGGAGGACAUCAACUUUGAAAAACUUUCCAUGAGAGUGUAUUUUCUUGAGCAAACUGAAGUAUUUCUGGGAGCAAAAACAUAGUAAUUACACAAUUUCAGUGCAGUCAACCAAAAUGUUGAGUCAAUUGGAAUGUAAUUUAUUAAACCAUGUAUUUAAAGAGAUAUUUUUCUUUAAAAGCCAAGUUACUUUCUCAUAUACAGCAUUUUAGGAAGCAUGAUUUUUUUUUUCUAUCAUCUAUUCCUCCAAGCAUGUUUAAUUGAAGAAAGUAUUAAUAUCUCUUUAGAUAAGCUUGUAUUGACCUAAUUUGGUUUAUGAUGUGUCAGAGCUAAUUCAUGUUCAGGGUGAGCGUUGUACCUACCAACAAAUUUCCUGGUUGGGUAUGCAAAUGGUUAUUUUCUUUUUAUUGUUGUUAAUUGGGACUUUCUGUUAAUGAAAAGCACUAUUCCCAAGAUUAAUAGUGUUCUAUGCACAAUGAAGCACCUAAAAACACUGCUUGAUAUUAUAAAUUUAAAACACAAGUGAAAGUUUAGCCAUGGUUUUGUGCGGCAUCAUAGUUAUGUCAAUAAAGUUUAUUUAGGUCAUAGAAUAUCCUAAAGUAUCACAUAGUUAAAUUUUUCAGUCAGUGAAGACCGGGAGGGAAUGUCAGUGAAUUGGCUUGAAUGUUCUGUGGCAAUCCACAGGUCUAGCCAAAUAUUGAAAUAGGAGUUUAGGGUAUAAUUUGCCUUGUGAUGUUUGGCAGUCACUGUUUAUACUUUAAAGGUUAUAUUUUAAGCUAUUUGAGAUUGCUUUUGGGAAGAUCACUAGAUUUAUGGAGGAAUUAGUCACAAAUGACUUGUAGAAAAUACUGUCAUAUAGUUCAUUUCAUCAUUUUCUGUUGCAGGAAGCCACUCCACCACAGAAUGCUAAUAUGCCAGUGGUACCCAGUACCUCUUGUAUAUAGGUUAUUGCAAAUAUUGUUCUGAAAUGCUUAACUUCAGAAUUACAUUUUUUAAAGUAAAUAAUUGUUUUAAAUCUAUUUUGUAAAGAUAUAAAGUACAAUAGAAUUUCUGGAGUACAGAUUAAACUAUUUGCACUAACACACGUGACGUGCAUGAUUUAAUAAAAUAACUUUACUCUCCCUACGCAUGUUUGAGUUGAAUAUCAUUGAAGUUCUUAAUGCUGACUCUACUAUUGGGUUGUUAAUAGUCUUCUCUUGACAUGACUCUUUAUGCAACAUAACAUACAUUUGGUAUUCUUCAGGGUUUAAAAGAAAACACUGAGCUGUUUCCUCCAAGUUUUAUUAACCUUUUAUUUAACUUACUGCUUUAUUUUUUUCUCUUUUAAUAUGGUUAUUGUUAAAAUGAGAGUCACUUGCUAGACUGGUCUCUUUAAAUGUAAGGUCUAGUAUCAAUAUUUACUUCAUUCAAGUGGAAUAAAUGGCUUUUUGUAGUUACUUCCAGUUUUCCUCAAGAAUAGAAAUAAGUCUGUUCAUAAGCAAUACCUUCAGUUUUGUUCAGUUCACUUCCACGUUAAAUAAAGAAUAGGAUUAUUCACUGGUAAUAAUAGAGUCAUUAAGAAAUAUUAAGCAUUGCAGCUAAAAAUUGAACAACCCUGUAAUGAUACAUUUAAGAAUUAUUCAAAGGUGCUACAUGGCAGGGUUAGAGAAUAAAAAGAACGUGGUGUUUGAAGCAAAACAGAUCUGUAUUGGCAUCUUGGUUCUACCUUUUAUCAGAUGUUGUUGCCUUGUGCAAAUCACAUUUUCUCUGAGUCUCCAUUUUCUCAUUUAUAACAUGCGGAGAAUAAUACUUAUAUUUGUGGUAGUAGUGUGAACAUUAAAAAGAUAAUGUAUGUGAAGUACCAUUCGAGUGGUGAAUACGUUUUUAUGAGAAUGUCAUACUGAAAAAAUAUUGCAAAUAUUAAAGUUUUAGGUAAGCCUAAACUUUAAUCUACUUUAAUUAAAUGAAUUGAUUGACUCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-901.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -980.07
Frequency: 0.0000
Diversity: 969.01
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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