Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001308064.2
Sequence Length
804 nt
GC Content
0.4577
GUUGGGGUUGAAAGACGCUGCCCCGCGGAGUGAAUGACUACUCUUUCCCUUCGUUUGGACACAUGGGCUUACAACGCCUUGUGUUGUAAGGAGAGAAGAAGAAGGUAUCAGCAUGGAAGCCAUGAGUGAGAAUAAAAUGGUGCCCUCUGAGUUUAGCACAGGACCUGUGGAAAAAGCUGCCAAACCUUUGCCAUUUAAGGAUCCCAACUUUGUGCACUCUGGCCACGGUGGCGCAGUAGCUGGCAAGAAGAACAGAACCUGGAAGAACCUGAAACAAAUCCUCGCUUCUGAAAGGGCAUUGCCGUGGCAACUGAACGAUCCUAACUACUUCAGUAUUGAUGCUCCUCCAUCCUUUAAGCCAGCUAAGAAGUAUUCUGAUGUUUCAGGUCUGCUUGCCAACUACACAGACCCCCAGAGCAAACUGCGGUUCAGCACCAUUGAAGAGUUUUCCUACAUUCGGAGGCUGCCCUCUGACGUCGUCACCGGCUACCUGGCCCUGAGGAAGGCCACGAGCAUCGUUCCCUGAGCCCCAGAAAGGGAGAUGAAGUGGAAAGCUGUUUCAAAAACAGACUCUGGACUCAUGAUUUUGUUUCACGGAAACAAACUCGUUCUGCUGUCAAUCUGAAAAUGCCAGUGCUGUGCCUUGGAAAGAAUGUUUGGCUUUAAUUUAAGGGUUUUUUUUUUUUUUAGUGUGUGUUUUCCCUCCAAGUGUGAUAUUUCCUGCUGAAUUAAAUUAUACUUCAGUUGUUGCCUCAAGUAAAGGUGUUUGACAAGAAGAUACAAUAAAACCAUACUUUUCAUUUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-221.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -237.17
Frequency: 0.0000
Diversity: 260.32
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((((...........)))))((((((.(((.((....)).))).)))))).............((((((((((...))))))))))..((((((.....(((.((((((.(((((.((((((.(((((((..((.(((.((...((((...(((((((((((((((..((((.(.....).)))).))))...))).)))......))))))))).)).))).))(((((((((.(((((((((.((.((((((.((((((.((((((((((.......((((((.....(((..(((....)))((((((.............))))))...((((......))))......))).....)))))).......))))))))))...))).))).............(((((((....(((......)))...((((((((((((((.((..(((((((....))))))).((((....))))....(((((........)))))....((((..(((((...........)))))))))..)))))))))).)))))).....).))))))......((.((((((((...)))))))).))))))))...))..))).....)))))))))))))))((((((((((.....((((((......))))))....))))))))))....))))))).))).....)))...))))))))))).......(((.((((..(((((((((.......))))....)))))))))))).......)))...)))))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
{.,(((((.{.......,.))))))},(((((({.,..,.|||{(((.((({.,...((((((.((((.......))))))))))..}})))),)}}|,,|,{((((,(((({.((((({((({(,{(((((.({{(,.{,(((({.{(((({.,(({((({{{({((((..{{{{.{{{{{{{{||||.||},..,})).,,}....,,)),)))}}|,,}}})},}}(((((((((.(((((((({.{{.(((({{.{(((((.((((((((((.......((((((.....(((..(((....)))((((((.............))))))...((((......))))......))).....)))))).......)))))))))).,.))).))}......,,|,...((((((,....{({,,....}}}...{(((({((((((((.{{..(((((((....))))))).{(((....})||,...{{({{.....,..))))}.)}}|{((|,(((((...........))))))))),.)))))))))).)))))}.....}.))))))....,,((.((((((((...)))))))).)))))))).,,)}..))).....))))))))))))))).|||,,|||,.,}}}|}}|,.,,,}}})))))...}))),)))))).},}}})})))).,,,.{{{{|{|{{.,|||,,,,,))}....,}}}}}})},.}|||,|||||..,,,,.,|||,,{{|,,..,,})}}}}......,,}.}}))}}))}}}}.
Back