Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001308197.2
Sequence Length
4275 nt
GC Content
0.3916
GUUCCCUGUUCUCGCCUGCAGCUCCGCCAUGGCUCCUAAAGGCAGCUCCAAACAGCAGUCUGAGGAGGACCUGCUCCUGCAGGAUUUCAGCCGCAAUCUCUCGGCCAAGUCCUCCGCGCUCUUCUUCGGAAACGCGUUCAUCGUGUCUGCCAUCCCCAUCUGGUUAUACUGGCGAAUAUGGCAUAUGGAUCUUAUUCAGUCUGCUGUUUUGUAUAGUGUGAUGACCCUAGUAAGCACAUAUUUGGUAGCCUUUGCAUACAAGAAUGUGAAAUUUGUUCUCAAGCACAAAGUAGCACAGAAGAGGGAGGAUGCUGUUUCCAAAGAAGUGACUCGAAAACUUUCUGAAGCUGAUAAUAGAAAGAUGUCUCGGAAGGAGAAAGAUGAAAGGUUUGACUCCUGUUUAAAGUAUGGCCAUCAUAAAAGGGGAAUCUUGUGGAAGAAGAAUGAAGUUGCUGAUUAUGAAGCUACAACAUUUUCCAUCUUCUAUAACAACACUCUGUUCCUGGUCGUGGUCAUUGUUGCUUCCUUCUUCAUAUUGAAGAACUUCAACCCCACAGUGAACUACAUAUUGUCCAUAAGUGCUUCAUCAGGACUCAUCGCCCUCCUGUCUACUGGCUCCAAAUAGACCAUGUCAGCUUCACCCCCUGGCUUUGUGUCUAUGGGUGGCCUGUGGUAUAUGGAAAAGUAGCAGGGUGGUCAGGGUGGGAGACACAAGAUGUUUUUAUAGUCUAGAGCCUUUAAAAAACCCAGCAGAAUGUAAUUCAGUAUUUGUUUAUUGGCUGUUUUUUGACAGAUUGUUGAAAUUAAAUGAAUUGAAAGGGAAACUCAGAGUACUAGGACGUUUAUUAAAAGGAAAAAAAUGUCUUGCAAUGUGCUGUAAUCACAAGAGGAGAAAAUAACUUGUUUCCUUGAUCUGUCAGAGGUCACAGUAACCUGGGCCGAGCUGUUAUUAUUUAUUAUAUAAUAGUAGUAGGAAGUUAAUAACUGGUUCUCUGUGUUCCAAGCACAAUAUUACAACUUCUUUUGAACCGUAAAUAUCAGAAUGAAUCCUCUUCCCAGGGGAUUGAACAGAAGCUUAAUGUUUACAAGUGUUUGAAUUUGUGAUCUGAAAUAACACAAAAUUAAAAACAUGAUUUCUCUAAUUUUCCAACUAGAGGAAGAGAAACUUGUGGAAAAGUUCUUUUUUUUUCUUUUUUUUUUCUUAAAGAAGGGCAGCCAAGGUAGUAACCUAAAAAUAGUGCCCAGGCAUAUGAGAGUUGUCCUACGAGGUUAAAGAACACACUGUUCCACUGUAUGGCUUUGGCCCUGAGUGGCCAGGGAGGUCAACUUGACCCUGCCAUGUUGGUUUGACUUACUAAGACACAGGAAUCACUGUUUUCCUUGACCAGGGUCUCACACCCUGGAGGAAUGUUAAGUAAGAGAAAGAACCUCUUUCCUGAAUAUUGACAUGUAAAAGACCAAAGUAAUUUUUCUGAACUUCUGCAAUUCUGAGAACUCUCCAAGGAAUUUACAGUGAUUUUAGUGCUUGUCAGCAUUUUUCCAUGAGGACUUUCAUACAUUUGACUCUUUAGUUCACAGGUUCCCAUUGAUUGUGAGCAAGAUAUUUAUCUCUUUAGCCCUUGGGGAUCCAGCUGAGAGCAAUCUCUUGCAUUUUUUUACCCGUGUAUGUACAGAUAUCAUUUCUUGUGUAUGCCAUGACUUGAAAAAGUUUGGGAAGCUCUUUAGCAAUAUCAGCUAAAAGGAUAUGAAAUCACAGGUGAUAGCAGUUGUCAUUCAGUAAUUUCCUACAAGCAGCACCCCAAAGGAAAUAUAGUCCUAAUCUUUACUAUCCACUUCUAAAUUUAAUGUGAAUUUCAUACAUGUUAUUAGUUGUUUUCUUUAUAAUUUUAUAAAAAUUAUUCAUCGGGAGUUUAACUUCCACUUCCAUGCUAUCGGAUGUGUUGGGCUCCAUGCAAGAACUUGGAAGAAAAACAGGCAGGAAUGCAUUUGCAUAAUGACCCAGAUCAUCAUUUUCUGCAACUGAGAAUUAUAUUUCAUCAUUGCUUCUAGAAGUCUGCAAUUCUUUACUUUUCUUUGGUGCAUUAUUAUCUAGGUGCCAUCACUGGAUAAUGUGGAGUGACUAGAGAAGUCACAUAUCACUGUAAGGUACAGUUAGGGUAACACUUUAGAGGUUUAUUAUUUUUAAAAAACUUUUCUUGAACUCCUGGCCAACAUGGUGAAACCCCGUCUCUACUAAAAAUACCAAAAUUAGCCAGGCGUGAUGGUGGGCGCCUGUAAUCUCAGCUACUUGGGAGGCUGAAGCAGGAGAACUGCCUGAACCCAGGAGGCAGAGGUUGCGGUGAGUCGAGAUCGUGCUACUACUGCCUGGGUGGCAAGGGUGAGACUCCAUCUCAAAAAAGAAACAAAAAAACCCAAAAAGUUUUCUUUACUGUUGGUUAAAAAAAAAAGCCAGACCAUAGUUUGACUGGUGGCAUGGAAUUUGUGUAUCAAAUAAAUGCAUUUGCUUAUUUGACAAACCAUCAGUGUCCACUAUUUGUUACCAGAGUUGGGCCACUAUCUUUUAAAAUUGCUGGUGAAAACUUGCCACUAGAUGGCAGUGCCUGUAUAGAUGGGGAAAAAAUUGCCACCAUUCUUGGUAUAAUACAGUGUAGCUUAGAUGAGGUGGUGAAAUAGGGGUAUCAGCCGAAUAUUCCUAAUAUAGUUUCUCUUGAAUUAAUAAACUGAAGAUUUGUAGGAAAAUGAGUGAGCAAAAUUUGUUUACUGUUGUGAAUUUUUCCUACAGCACUGUUUUUAAUCUUGAUGUUUUCCAACUUUCUGUACUAAUAGAUACAUUUCUGUGCAUAAGAUUAUAAAGCAUAUACUCACAGUUCAGUAGUUUUCGUUAAGGAUUUACUGUGUGAGUACUUUACUGUGAGGAAUUGCAGAACCUUUUCCCCUCUACUCUUGUCUAAAAGUUCUGUGUGGCACACAGAGAUGCGACCUACUCAAUCUGACUUAGUAAAACCAUGCUGUAGAAUUUUUGUCUUAAAAAGACCACAUACCCAGCACCCAUGAAAUAAAAGAUUCAUCUGUAAUUGGGAUUCAAAGUGAUUAAAUUCCUUUGUUCAUACUCAUAAAUAGCACUAAAGUGUUAUAACAUUUUCAUUUACCUAUUUUUAGUUCCUUCAUUUUAACUUAAUAAAAAUCUUGGAUUGAUAUUCUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUGAGACAGCGUCUCGCUCUGUCACCCAGGCUGGAGUACAGUGGCUCUAUCUUGGCUCACUGCGAGCUCCGCCUCCCAGGUUCACGCCAUUCUCCUGCCUCAGCCUGCCGAGUAGCUGGGACUACAGGCGCCCGCCACCACACCCGGCUAAUUUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGACGGGGUUUCACCCUGUUAGCCAGGAUGGUCUCGAUCUCCUGACCUCGUGAUCCACCUGCCUCGGCCUCCCAAAGUGCUGGAAUUACAGGCGUGAGCCACCGCGCCCGGCCUAGAUUGAUAUUCUUAAGCAAUAAAAGUUUACUGGUUGUCCUAUUUGCCAUAUUAUUGAAACUUGGAAAGGAUAAUUUGAAACAAGGUUUGAAGUUAACUGAAAUAUGGAGAUUGAAUUUAUACUCAAUUCUUGUGAAAAGUCUUGCUUAAUAAGUAUGAUUAAACUUUGCUUCUUAAAAUUUGUAUUUUCCCUACACUUCUUUAUAAGAAUCCUAUGAUGAAGUACGUAAUCUUUAUUAUAUUAUUUUACAUUAACCAUCUUUUUUUUCAAAUUGUUUUAUUUUUUAUUUUACUUUAAGUUCUGGGAUACAUGUGCUGACCAUGCAGGUUUGGUACAUAUGUAUACAUGUAACCAUCAUUUUAAUAUCUCACACAUGUAAAUGCACAUCUUUGUAGUUACCAAUCAAAUGUAUGUGAGGCAAUGAAAGGCAUUGAGCAGUUACAGUAAAGGGCAGACAUCAGGCCUCUGCCAGUAUGUACCUGCUGUGCCUUCCUGCCUGCCCUAUUUCUUUGUUUUCAGUGUGCAUGCCAGUCACUGCUGCUUCUGGAGACAGGAUGGAAGGAUACAUGUAUGUGUACAUUUAUGGAGAAAACCAAUUUAUAGAUGUAUCAGAGCUCUAAGGGAUUCUCUUUCACUUCCUUGGGACUCCCAAGCAGAGGAAUUAAUAGAUUAGGAGGGUCUUUUGGGGGGUUGGUUUAAAUUUUCAGGGCGAUAGAGGCUAACUUCUCGUUGGCCUUCAUGAAUUUUCAAUAUAUCAUCUUUUCGCUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1320.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1399.83
Frequency: 0.0000
Diversity: 964.84
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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