Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001314025.2
Sequence Length
739 nt
GC Content
0.5291
AACCCGCUCUGUGGCGGGGCUUCCGGUCGGGAGGGUCCGCCCGCUCUCGCGUCCUUUGCUGGGUCCAGACACCGGUUCCGUUGCAAACAUUUUUAAAGGGCUGGUUAUUCUUCCUGAAAUGAGUUUGGUGAUUAGAAAUCUGCAGCGAGUCAUCCCCAUCAGGAGAGCGCCACUUCGCAGUAAGAUCGAGAUUGUAAGGAGGAUUUUAGGAGUGCAGAAAUUUGACCUGGGGAUCAUCUGUGUUGACAACAAGAAUAUUCAGCACAUUAAUAGAAUCUACAGAGAUAGAAAUGUCCCAACCGAUGUGCUUUCUUUUCCAUUUCAUGAGCAUCUGAAAGCAGGUGAAUUUCCCCAGCCUGAUUUUCCAGAUGACUACAAUUUGGGAGACAUUUUCCUAGGAGUGGAGUAUAUCUUCCAUCAGUGUAAAGAAAAUGAAGAUUACAAUGACGUCCUGACUGUGACGGCCACCCACGGACUCUGUCACUUGCUGGGAUUCACACACGGCACGGAGGCAGAGUGGCAGCAGAUGUUCCAGAAGGAGAAGGCGGUGCUGGACGAGCUGGGCCGACGCACGGGGACCCGGCUGCAGCCCCUGACCCGGGGCCUCUUCGGAGGGAGCUGAGGGCCGCGUUCCUUCUGAAAGCGGGACGCGGGAGGGGUGGAGGCUGCGGGGAGCCGGGGUCGCACACGAAUAAAUAACGAAUGAACGUACGAGGGGAACCUCCUCUUAUUUCCUUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-266.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -279.07
Frequency: 0.0000
Diversity: 189.41
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((....)))))).(((((.....))))).(((((((.((((((((((((..(((..((((((.(((((....(((((((...((((((((.(((((.(((..((.....))))).))))).....)))))))).)))))))....((((((((((((....(..((((((....(((((((..............)))))))))))))..)...)))))..)))))))....((((((((............))))))))........((((....))))....(((((......)))))....((((((((..(((..(((((((((....(((((...........))))).((((((((((.......))))))))))......((..((.((((.(((.((((((..((........))....))))))))).....(((((.....).)))).))))))..))((((((((.((((((((........).))))).)).)))))))).....)))))))))..)))))))))))))))))))))).(((((((((.........)).)))))))...(((((......)))))...((((((((((((((.....)).))))))))))))))))))))))))))))))))))((((.(((....))).)))).................(((.(((.(((.((((((...)))))).)))))).))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
..((((((....)))))).(((((.....))))}.(((((((.((((((((((((..(((..((((((.(((((.,,,(((((((...((((((({.,{((({{({,(((.....}}}})}),}}}},}..}))))))).))))))).,,.{((({{{{{{||,...,{{({({((,,,,({(({{(,..,,,,,,.,,.,||}}}}}||}}}}|.,...}))}}..}}}||}},,{,((((((((............)))))))}........,{{{....,||||,..,||||......)))})|}|,|{|{{(((.,(((..(((((((((,,,,((((({........},))))).||||||||||,..,.,,,}}|||||||.,,,||{|,,||,||||}|,|.{|||||},{,..,.,...,,...,)}}},)))),,,..||{{|,.,,,),))})|||,||,..}}((((((((.(,((((((........).))))).),.)))))))),}}.,))))))))|,.}},))))})),))))))))))).(((((((((.........)).)))))))...(((((......)))))...(((((((((((({(.....}}.))))))))))))))))))))))))))))))))))((((.(((....))).)))).................(((.(((.(((.((((((...)))))).)))))).))).
Back