Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001316888.2

Sequence Length

1177 nt

GC Content

0.4724

GAGGAAACAGCCCUAGCUAUUCCUGAGGCCCCCAUUACUGCCUGGUCAAGGGCUUUGGGGCACAUACUGCCUGUGCGUCCAUCCUCAUGAACUCCAAAUCUCCCCGCUACUCCACAGGACAAAGAAAACGAGACUGACAACGAAGUCUGAAGGAGAAAGGCAAGUAUCUUUCUGCUGGACUGGCCCUCAAGACUUAGCACAACUGCCUUCACCAGUGAGCACAAAGCCACAUUUCAAAGGAAACUGACAAAUUAUCCCCAGCUGCCAGAAGAAGAAAUCCUCACUGGACGGCUUCCUGUUUCCUGUGGUUCAUUAUCUGAUUGGCUGCAGGGAUGAAAGUUUUUAAGUUCAUAGGACUGAUGAUCCUCCUCACCUCUGCGUUUUCAGCCGGUUCAGGACAAAGUCCAAUGACUGUGCUGUGCUCCAUAGACUGGUUCAUGGUCACAGUGCACCCCUUCAUGCUAAACAACGAUGUGUGUGUACACUUUCAUGAACUACACUUGGGCCUGGGUUGCCCCCCAAACCAUGUUCAGCCACACGCCUACCAGUUCACCUACCGUGUUACUGAAUGUGGCAUCAGGGCCAAAGCUGUCUCUCAGGACAUGGUUAUCUACAGCACUGAGAUACACUACUCUUCUAAGGGCACGCCAUCUAAGUUUGUGAUCCCAGUGUCAUGUGCUGCCCCCCAAAAGUCCCCAUGGCUCACCAAGCCCUGCUCCAUGAGAGUAGCCAGCAAGAGCAGGGCCACAGCCCAGAAGGAUGAGAAAUGCUACGAGGUGUUCAGCUUGUCACAGUCCAGUCAAAGGCCCAACUGCGAUUGUCCACCUUGUGUCUUCAGUGAAGAAGAGCAUACCCAGGUCCCUUGUCACCAAGCAGGGGCUCAGGAGGCUCAACCUCUGCAGCCAUCUCACUUUCUUGAUAUUUCUGAGGAUUGGUCUCUUCACACAGAUGAUAUGAUUGGGUCCAUGUGAUCCUCAGGUUUGGGGUCUCCUGAAGAUGCUAUUUCUAGAAUUAGUAUAUAGUGUACAAAUGUCUGACAAAUAAGUGCUCUUGUGACCCUCAUGUGAGCACUUUUGAGAAAGAGAAACCUAUAGCAACUUCAUGAAUUAAGCCUUUUUCUAUAUUUUUAUAUUCAUGUGUAAACAAAAAAUAAAAUAAAAUUCUGAUCGCAUAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-344.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -368.57

Frequency: 0.0000

Diversity: 328.41

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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