Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001317171.2
Sequence Length
571 nt
GC Content
0.4028
GCCAGACGCAAGACGCCGGGCCUACAGCGGGAGCGUGAGGAAAGCCGUGCGUUGCGUUCCAAGGCAUCUGUGAGCCCGCGGAGUAUACACCAUGAGCAAAGCUCACCCUCCCGAGUUGAAAAAUGAAAUUAAAUGGUGGCAGACAUGUCCAAGGAAUAUUGCGGGGAUUUGAUCCCUUUAUGAACCUUGUGAUAGAUGAAUGUGUGGAGAUGGCGACUAGUGGACAACAGAACAAUAUUGGAAUGGUGGUAAUACGAGGAAAUAGUAUCAUCAUGUUAGAAGCCUUGGAACGAGUAUAAAUAAUGGCUGUUCAGCAGAGAAACCCAUGUCCUCUCUCCAUAGGGCCUGUUUUACUAUGAUGUAAAAAUUAGGUCAUGUACAUUUUCAUAUUAGACUUUUUGUUAAAUAAACUUUUGUAAUAGUCAAAAAUGCUUUCUCAGAUGUUCUGAAUAUAGAAUAUCAGCUCUCAUUCCAGUUUUUUCUAACAUGAAUUUUCCUGGUUGACAUUGAUUUCAAAGGGUUUUAUGCAUUAAAGUGAAAGAAUCUUAUUAAAUGUGAAACAUGGCAAGGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-141.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -155.53
Frequency: 0.0000
Diversity: 113.46
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((..(((.((.(((((...((((..((((((.(((((....((((((.(((((........)))((((((....))))))......)))))).))....))))).)))))).........................(((..(((((((((((.....((.((((((...)))))).))....))))).)))..)))..)))))))...))))).)).)))...............(((((((((((.....((.((((((........((((((((((((..((((((.((((........((((((((..((((((.....((.(((((........))))).))...(((.(((((.(((...))).))))))))........((((.(((.....))).))))...))))))))))))))..............(((((((((....))))))))).))))...))))))...))))))))))))..)))))).))...)))).)))))))...(((((..(((((..(((((.......))))).)))))))))).)))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((..(((.((.(((((..,(((({.((((((.(((((....((((((.(({({.{{{{..(((.,{...|.}}},,.)))},....}))))).))....))))).)))))).,,{...........,.........,{{..|{(((((((((..,,.,{.((((((...)))))).,),...))))).)))}..,,..}})))))...))))).)).))).......,,,,....(((((((,(((.,...((.((((((........((((((((((((..((((((.(((,........{(((((({.,{,(((((.,,....||..}})}}..,,|.||((({{(((((......))))}}..)))))),}}},........{(({.(((.....))).})}}.....,)),)))))))}.....,.,......(((((((({....})))))))).))})}}.))))))...)))))))))))),,)))))).))...))}).))))))),,,|||||.,{(((,..,|||{..,,,}})),,,.,}})),..,}.)))).....
Back