Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001318138.2
Sequence Length
1357 nt
GC Content
0.4982
ACUGGAAAAGAUAGUGACCUUACCAGGGCCAAAGUUUGUAGACACAGGAAUUACGAAAUGGAGAAGGGGGAGAAGUGAGCUAGUGGCAGCAUAAAAAGACCAGCAGAUGCCCCACAGCACUGCUCUUCCAGAGGCAAGACCAACCAAGAUGAGUGCCCUGGGAGCUGUCAUUGCCCUCCUGCUCUGGGGACAGCUUUUUGCAGUGGACUCAGGCAAUGAUGUCACGGAUAUCGCAGAUGACGGCUGCCCGAAGCCCCCCGAGAUUGCACAUGGCUAUGUGGAGCACUCGGUUCGCUACCAGUGUAAGAACUACUACAAACUGCGCACAGAAGGAGAUGGAGUAUACACCUUAAAUGAUAAGAAGCAGUGGAUAAAUAAGGCUGUUGGAGAUAAACUUCCUGAAUGUGAAGCAGUAUGUGGGAAGCCCAAGAAUCCGGCAAACCCAGUGCAGCGGAUCCUGGGUGGACACCUGGAUGCCAAAGGCAGCUUUCCCUGGCAGGCUAAGAUGGUUUCCCACCAUAAUCUCACCACAGGUGCCACGCUGAUCAAUGAACAAUGGCUGCUGACCACGGCUAAAAAUCUCUUCCUGAACCAUUCAGAAAAUGCAACAGCGAAAGACAUUGCCCCUACUUUAACACUCUAUGUGGGGAAAAAGCAGCUUGUAGAGAUUGAGAAGGUUGUUCUACACCCUAACUACUCCCAGGUAGAUAUUGGGCUCAUCAAACUCAAACAGAAGGUGUCUGUUAAUGAGAGAGUGAUGCCCAUCUGCCUACCUUCAAAGGAUUAUGCAGAAGUAGGGCGUGUGGGUUAUGUUUCUGGCUGGGGGCGAAAUGCCAAUUUUAAAUUUACUGACCAUCUGAAGUAUGUCAUGCUGCCUGUGGCUGACCAAGACCAAUGCAUAAGGCAUUAUGAAGGCAGCACAGUCCCCGAAAAGAAGACACCGAAGAGCCCUGUAGGGGUGCAGCCCAUACUGAAUGAACACACCUUCUGUGCUGGCAUGUCUAAGUACCAAGAAGACACCUGCUAUGGCGAUGCGGGCAGUGCCUUUGCCGUUCACGACCUGGAGGAGGACACCUGGUAUGCGACUGGGAUCUUAAGCUUUGAUAAGAGCUGUGCUGUGGCUGAGUAUGGUGUGUAUGUGAAGGUGACUUCCAUCCAGGACUGGGUUCAGAAGACCAUAGCUGAGAACUAAUGCAAGGCUGGCCGGAAGCCCUUGCCUGAAAGCAAGAUUUCAGCCUGGAAGAGGGCAAAGUGGACGGGAGUGGACAGGAGUGGAUGCGAUAAGAUGUGGUUUGAAGCUGAUGGGUGCCAGCCCUGCAUUGCUGAGUCAAUCAAUAAAGAGCUUUCUUUUGACCCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-436.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -460.69
Frequency: 0.0000
Diversity: 275.96
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((..(((........))).))))((......(((((((.........)))))))((((...(((((((((....((((.(((((((((..........(((((.(((......))))))))(((((((.((((....((.......))..)))))))))))..(((((((....(((((.(((((...((.((((((((.(((..((.((((..((((((...))))))((........)))))).))(((...(((((.((.(((((....))))).))..)))))...))).))).)))))))))).(((((.(((((.((((..(((((.............((((.....)))).((((((...........))))))..........)))))...))))..))))).)))))...(((.........)))...))))).)))).)((((..(.((((.((((((..((((...))))(((......))).((.....(((((.....))))).......)).)))))))))).).))))......)))))))))))).)))))))).....)))))))))...))))((((..((((((...((((......))))((((((.............))))))......((((((.((((..........((((((((((..(((..(((((((((((((((...(((((((((....((((((((((.....))))))..))))...)))).)))))))))))).(((....))).....(((((((.(((((...(.(((....(((((...(((((((....((((...........((((..........))))..(((((.(((((...((..............))...))))).))))).)))).....)))))))...)))))..))).)...)))))(((.((((...)))).))).............)))))))(((.(((((((..((((.............))))..))).)))).))).((.((((((((.((.....(((((((((((.(((((..(((((((((.........((((((....))))))(((((.......)))))))).))))))...))))).))))).)))))).(((....)))....(((..(((((((.((..(((.((((.(((.....)))...))))....))))).))))))).)))..)).))))))).).))))))))))..))).))))).))))).........))))))))))..((((....)))))))))).))))(((((......((((....))))))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((.,(((...,,..,||}.}})||{.{{...((((({,.........,}})}}}{(((...(((((((((....((((.(((((((((..........(((((.(((......))))))))(((((((.((((....(,.......,,..)))))))))))..(((((((.....,{{(,({(((,...(((((..((({(,(.,{({,{{...((((((...)))))))}.,.})}).)))))..))}||.,,|||||.{({(((,({,..}}|||,||{,||,)||..}}},)))})))},...,,.(((((.(((((.((((..(((((..,.......,,|({{{.....},,,.{(((((...........)))))}.........,)))))...))))..))))).)))))...{{(,..,..||||}},..,}}})}))}},}|{{(..(,((((.((((((..((((...||}|,{{...,,})))}||...,,(((((.....))))}..,,,..,}.)))))))))).).))))......)))))))))))).)))))))).....)))))))))...)))}((((..((((((...((({......))))((((((.............))))))......((((((.{{{{..,.......((((({{{{(,,(((..(((((((((((((((...(((((((((,...((((((((((.....))))))..))))...}))).)))))))))))).(((....))).....(((((((.(((((...(.(((...,(((((...(((((((,{{{(,,,.}}}},.....,,{(,,,.......})}}.}|||(({(((((.{((((.....}}.})|,,||...,,)))})}}}.}))))}},..)))))))...))))),}))).)...)))))(((,(({{...}))).))).............)))))))(((.(((((((..((((.............))))..))).)))).))).((.((((((((.(({....(((((((((((.(((((..(((((((((,....{,,.((((((....)))))),,{{{...,},,))},)))).))))))...))))).))))).)))))).|{{{,,,},,..,,||,..(((((((.((..(((.((((.(((.....)))...))))....))})).))))))).}}}..)).))))))).).))))))))))..))).)))}}.)))))........,))),))))))..((((....)))))))))).))))||,..,,....,,||,,,.))))))}.))).
Back