Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001318188.2

Sequence Length

2829 nt

GC Content

0.4182

GUUUUCUGUCUAGCUCCGACCGGCUGAGGCGGCGCGGCAGCGGAGGGACGGCAGUCUCGCGCGGCUACUGCAGCACUGGGGUGUCAGUUGUUGGUCCGACCCAGAACGCUUCAGUUCUGCUCUGCAAGGAUAUAUAAUAACUGAUUGGUGUGCCCGUUUAAUAAAAGAAUAUGGAAACUGAACAGCCAGAAGAAACCUUCCCUAACACUGAAACCAAUGGUGAAUUUGGUAAACGCCCUGCAGAAGAUAUGGAAGAGGAACAAGCAUUUAAAAGAUCUAGAAACACUGAUGAGAUGGUUGAAUUACGCAUUCUGCUUCAGAGCAAGAAUGCUGGGGCAGUGAUUGGAAAAGGAGGCAAGAAUAUUAAGGCUCUCCGUACAGACUACAAUGCCAGUGUUUCAGUCCCAGACAGCAGUGGCCCCGAGCGCAUAUUGAGUAUCAGUGCUGAUAUUGAAACAAUUGGAGAAAUUCUGAAGAAAAUCAUCCCUACCUUGGAAGAGGGCCUGCAGUUGCCAUCACCCACUGCAACCAGCCAGCUCCCGCUCGAAUCUGAUGCUGUGGAAUGCUUAAAUUACCAACACUAUAAAGGAAGUGACUUUGACUGCGAGUUGAGGCUGUUGAUUCAUCAGAGUCUAGCAGGAGGAAUUAUUGGGGUCAAAGGUGCUAAAAUCAAAGAACUUCGAGAGAACACUCAAACCACCAUCAAGCUUUUCCAGGAAUGCUGUCCUCAUUCCACUGACAGAGUUGUUCUUAUUGGAGGAAAACCCGAUAGGGUUGUAGAGUGCAUAAAGAUCAUCCUUGAUCUUAUAUCUGAGUCUCCCAUCAAAGGACGUGCACAGCCUUAUGAUCCCAAUUUUUACGAUGAAACCUAUGAUUAUGGUGGUUUUACAAUGAUGUUUGAUGACCGUCGCGGACGCCCAGUGGGAUUUCCCAUGCGGGGAAGAGGUGGUUUUGACAGAAUGCCUCCUGGUCGGGGUGGGCGUCCCAUGCCUCCAUCUAGAAGAGAUUAUGAUGAUAUGAGCCCUCGUCGAGGACCACCUCCCCCUCCUCCCGGACGAGGCGGCCGGGGUGGUAGCAGAGCUCGGAAUCUUCCUCUUCCUCCACCACCACCACCUAGAGGGGGAGACCUCAUGGCCUAUGACAGAAGAGGGAGACCUGGAGACCGUUACGACGGCAUGGUUGGUUUCAGUGCUGAUGAAACUUGGGACUCUGCAAUAGAUACAUGGAGCCCAUCAGAAUGGCAGAUGGCUUAUGAACCACAGGGUGGCUCCGGAUAUGAUUAUUCCUAUGCAGGGGGUCGUGGCUCAUAUGGUGAUCUUGGUGGACCUAUUAUUACUACACAAGUAACUAUUCCCAAAGAUUUGGCUGGAUCUAUUAUUGGCAAAGGUGGUCAGCGGAUUAAACAAAUCCGUCAUGAGUCGGGAGCUUCGAUCAAAAUUGAUGAGCCUUUAGAAGGAUCCGAAGAUCGGAUCAUUACCAUUACAGGAACACAGGACCAGAUACAGAAUGCACAGUAUUUGCUGCAGAACAGUGUGAAGCAGUAUUCUGGAAAGUUUUUCUAAGACUAGUGAAGAACUGAAGGAGUCCUGCAUCUUUUUUUUUUUAUCUGCUUCUGUUUAAAAAGCCAACAUUCCUCUGCUUCAUAGGUGUUCUGCAUUUGAGGUGUAGUGAAAUCUUUGCUGUUCACCAGAUGUAAUGUUUUAGUUCCUUACAAACAGGGUUGGGGGGGGGAAGGGCGUGCAAAAACUAACAUUGAAAUUUUGAAACAGCAGCAGAGUGAGUGGAUUUUAUUUUUCGUUAUUGUUGGUGGUUUAAAAAAUUCCCCCCAUGUAAUUAUUGUGAACACCUUGCUUUGUGGUCACUGUAACAUUUGGGGGGUGGGACAGGGAGGAAAAGUAACAAUAGUCCACAUGUCCCUGGCAUCUGUUCAGAGCAGUGUGCAGAAUGUAAUGCUCUUUUGUAAGAAACGUUUUAUGAUUUUUAAAAUAAAUUUAGUGAACCUAUUUUUGGUGGUCAUUUUUUUUUUAAGACAGUCAUUUUAAAAUGGUGGCUGAAUUUCCCAACCCACCCCCAAACUAAACACUAAGUUUAAUUUUCAGCUCCUCUGUUGGACAUAUAAGUGCAUCUCUUGUUGGACAUAGGCAAAAUAACUUGGCAAACUUAGUUCUGGUGAUUUCUUGAUGGUUUGGAAGUCUAUUGCUGGGAAGAAAUUCCAUCAUACAUAUUCAUGCUUAUAAUAAGCUGGGGAUUUUUUGUUUGUUUUUGCAAAUGCUUGCCCCUACUUUUCAACAAUUUUCUAUGUUAGUUGUGAAGAACUAAGGUGGGGAGCAGUACUACAAGUUGAGUAAUGGUAUGAGUAUAUACCAGAAUUCUGAUUGGCAGCAAGUUUUAUUAAUCAGAAUAACACUUGGUUAUGGAAGUGACUAAUGCUGAAAAAAUUGAUUAUUUUUAUUAGAUAAUUUCUCACCUAUAGACUUAAACUGUCAAUUUGCUCUAGUGUCUUAUUAGUUAAACUUUGUAAAAUAUAUAUAUACUUGUUUUUCCAUUGUAUGCAAAUUGAAAGAAAAAGAUGUACCAUUUCUCUGUUGUAUGUUGGAUUAUGUAGGAAAUGUUUGUGUACAAUUCAAAAAAAAAAAAGAUGAAAAAAGUUCCUGUGGAUGUUUUGUGUAGUAUCUUGGCAUUUGUAUUGAUAGUUAAAAUUCACUUCCAAAUAAAUAAAACACCCAUGAUGCUAGAUUUGAUGUGUGCCCGAUUUGAACAAGGGUUGAUUGACACCUGUAAAAUUUGUUGAAACGUUCCUCUUAAAAGGAAAUAUAGUAAUCUUAUGUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-798.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -860.52

Frequency: 0.0000

Diversity: 780.59

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((((.....((.(((.((......))))).))(((.(((..(((((....))))).))).)))...((((.(((((((((((.((((......))))...).)))))))))).))))((((((.((...........(((.(((((....((((.............))))..))))).)))...((((....))))............(((((........))))).....)).))))))........(((((((((((.(((((...((...........))....))))).)).......((((((((((....))).))))))).(((((((((.(((.(((((.(((((((((.....((((((.(((.((.((((((..((((((((....((..((((..(((..(((((((....(((((((.(((((((....))))))).))......((((..((((((............((......)).((((..((((.((((..(((((..(((((.((((((((..((((.(((.((.(((((((...((((((......))).))).((((........))))...(((((.((........)).)))))..))))))).)).))).)))).((..((((((((((.(((.(((............(((((((((((((................(((((..((((((((.......))))))..))..)))))))))))).))))))...(((((....))))).....((((((.(((((((....)))))))........((((.........)))))))))))))))).))))))))))..))....(((((((............)))))))(((......)))(((.((((((..(((.(((.(((((....)))))..)))....(((.(((.((.....)).))).)))((((((.(((((...))))).))..((((.............))))....((((((((...))))((((((((..((.((((......)))).))..))))))))......))))((..(((((((((((((((.((..(........)..)))))).((....)).........)))))))))))))....))))))).))))))))))))))))).))))).))))).)))))))).))))..........((((.((((.(((.........))))))))))).....))))))..))))(((((....))))).)))))..)))))))..)))...(((((...((((((((...........)))).))))..)))))..((((....))))))))..))..))))))))...)))))).(((((((.....))))))).....)))))))))))..((((....)))).(((...((((..(((((((...)))))))...(((((((.((((((((((((((((((((..........))))))).(((((((((.((((((((((.....((....((((((...(((.((((((((((..((((((........)))))).))))))).)))..))).....))))))...)).....))))))))))..))))))))).....(((((((((((...)))))))..))))...(((((.(........).)))))....((..(((((((((((((((((((((.......((((((...(((((((.(((..((..((.((((((((((((((((((.((.(((((................(((((((.....((((.((((.(((........))).)))).))))....)))))))...))))).)).)))))))))....)))))))...)).)).))..))))))))))))))))......))).))))))))).((((((....))))))...((((((((.(((...((((((((.......)))..)))))))).))))))))((((((((.......))))))))..........))).))))))..)).....(((((((..(((((.....(((.((((.((((...............)))).)))).))).))))))))))))........))))).))).)))))))))))).......))))..))).((((....))))...........((..(((((...)))))..))...))))))))).))))).))).))).))))))....(((((((((.(((((((.((((((......)))))).))))((((((............((((..(((((((....)))))))..)))).((((((((((((((.(((((......))))).))))).((((((..((((..(((.((((((((((.....)))))).))))...)))..)))))))))).......))))))))))))))).(((((.....(((((..((((((........(((((.(((.((((((.(((.......))).))))))..)))))))).((((((.(((..(((........))).))))))))).(((.(((((..((((................((((..(((...)))..))))((.(((((((.(((.((((((.(((..(((........)))..))))))))).......))).))))))).))))))..))))).))).....))))))..)))))))))).....))).))))))))).)))))))))...)))))))................

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((((((((...{({(((.(({{{{{.},)))},)||,.{||},(((((....))))),|||.||,.}})).}}.,.((((((((((((((((((((....((((((......))))))....,...))))...))))))))),,((((((..{,(({{.,,,......,)),,,,}).,.,},}))}((((....))))............(((((........)))))..,)))))))))))))))....((((((((({(((((((....(((((((..{{((,((.((((((((,,.,....((((((((((....))),,)))))).(((((((((.(((.(((((.(((((((((..,.,((((((,(((.,,.((((((..((((((((.{{{(({{(((,..(((..(((((((..,,({{{{{(.(((((((....))))))).)}......((((..,{{{{{..{,...||.||{({,,,{{|}.,{((,,((({.((((..(((((..(((((.(((((((({.((((.(((.((.(((((((..((.((..(({{.,|||.,||.(({(....,,..}}}}.|||||,,,}..}))}.})))..)).)).))))))).)).))).)))),((..((((((((((,(((,{{{............((((((((((((({{{.............{,,{{,...((((((.......))))))..,},.,)))}})))))).))))))...(((((....))))).....((((((.(((((((....)))))))........{{{{.........)))})))))),))))).))))))))))..)}....{((((((..,......,|,))))))}{{,....,,|}}|{{,{{{{({,{{,{{{{{.(((((....))))),.((((..((((((((((((((.({..((({{,,||,.((,(((((...))))).)).,|{{{|,,...,,.,|,.}}}}....},}}.,)}))))))))))))))))))),|{{(((((.(,...,},)))))|{,|{(((.{..(((.(..(((((((((((((((.((..(........)..)))))).,,{{{{|,..,}}},..))))))))))).,).))).,))))})}))))),))))))))).))))).))))).))))}))).)))).,........((({{(({{{(((.,.....,.))))))))))).....))))))}}}}}}((({{....},})),}})))..)))))))..)))...,|||,,{{((({(,(({...,,..{{,||,,.,,))}}),}))}}||{|,}}}),))))))}.},..))))))))...)))))).(((((((.....))))))).....}|||}},,,}|||{{{{....}))}))}}}}}...,..(((((((...)))))))...(((((({.((((({{({{{(((((({{{.{..,,{.,.||}||||,(((((((((.((((((((((.....{({,.,((((({,..{{{.,{({{(((({..((((((,.......)))))).}}))))}.},|,,},}.....))))))...,,.,,,.))))))))))..))))))))}...,.(((({((({{,...}))}))}.,||}}{{{{{{{,,({,,,,{,.|,|,},,.,,}{({,(((({{(((((((((((((((.......((((((...(((((({{(((..((((.(,({((((((((((((((((.({.(((((................(((((((.{{..((((.((({.(((........))).}))).)))).},.)))))))...))))).}).)))))))))....))))))).},}),)),|}..))))))))))))))))......))),})))))))|{((((((....))))))},.((((((((.{((...((((({((.......}},},)))))})}.))))))))((((((((.......)))))))).....,,,..))),))))}}},}||||{.,,,{|||},.,.{{{{({..,,.,|||}||{{.....{|,||,},..,)})}}))}.,})}}}}.,.}})}}))}..}},,))))))))).}))))))))))).{{{{{.{{{.,{,.,,{|{|,,..))))}.........,((,.(((((...))))),})}}},))))))))).))))).))).)))}})))))...{(({(|{((({{..{,,,.,,||||}}}}}}),||||{||||((({{{,{{{{.{,...,||||,.(((((({....}))))))..(((((((((((.{,......,|.}))))))))))..,,.{(((((((....)))))))}}}{{{{,{{{{,...,,||||}}.}})),,,,))}))))))).))},|||...||,|{{{{||||,||{(({,,,}}}}|||...,{..{{,{,,{{{...,.,,.,,|}||||,,}|,|}|,.}}})))})).})...,,},,..)})}))))}}.},})}.,.})))))).,.,,..))))))))}}(((((..((({................{{{{..(({...))),.)))}{(.(((((((.(((.{(((((.(((..(((........)))..)))))}})),,,....))).))))))).))))))..))))).{{,(((.{(((((((({....}}),)))....,..))))).}}},)})))))))........{{{{{{.....}}}}}}.