Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001318520.2
Sequence Length
7647 nt
GC Content
0.4334
CUCCGGCGGCUGCAGAUUGACGGGACGAGAUGGUCCUGGCAGGGCUCAUCAGGAAACUCGGUCAUCAGCUGGCCGAGAUCAGGGAGCGCGCUCUCAAGAGUAUUCUCUGCAAGAUUGAGCACAACUUAAUCUGCUACGCUGAUCUCAUUCAGGAGAGGCAACUUUUUCUUCAUUUGCUGGAAUGGUUCAAUUUCCCGUCCGUUCCGAUGAAGGAAGAGGUUCUGAACCUGUUAAGCAGAUUGGUUAAGUAUCCCCCAGCAGUCCAACAUUUGGUUGACGUUGGUGCAGUAGAGUUCUUAUCUAAGCUUCGGUCUAAUGUGGAGCCAAAUCUGCAGGCUGAAAUUGAUGGCAUUCUGGAUGGACUUUUUCUUCUUCCUUCGGAAGUUCCUGCACUAUCUUCUGCCUCAUACCAAACCAAUCAAACUGAAUUGUCAAAAAACCCUGAAAUCUUAACAGGAUAUUUUCCCCAAGACAAAAGUAAUUUCCAGCAGAUGGAAGUGCCGCCACGACCAGUGGUAAAUCAGACUGUGAAGUGCUUGAAGUUUUCUACAUUUCCUUGGCUACCCCUGACCACCACAGACAGACAUGUCCUCUCCUCUAAUGAAAGCUCUUUAAGAAGUAGUAACCACACUUUAAUCUGGAACACCUGUGAACUAUUGAAGGAUGUUAUCAUGCAAGAUUUUCCUGCUGAGAUUUUCCUUCAAAGGCCAAAAAUUGUUCAGAGCCUUUUAUCUCUGUUGAAACUGGCCUUUGGAGAUGGAAAGCAUCGCCUGGCAUUACAGUCGGUGUCCUGCCUGCAGCAGCUGUGCAUGUAUUUAAGAAACAGACUUAACUUUCACCGAGAUCCAGGUUUUUUCUCCAAUAAACACGACACAGUUUCCCAAAAUUCUUCUUUGUCUUAUUGUCAUGAAGCAAGAGGUACUCAUCAUUCCCAGAAUCCUUCCCCAGGAAGCAGCAGCCCUCGGCCUUCUGUGGUUGGGCGCACAGGCCAGCGACCCAGAGGAGAUGGCCAGGACUGGGAUGCAGCGUCCUCUAGUGGAAGUAGUAGUCAUGCUCAUGUAAACUCCAGGAUAUCCGUUCAUUCACCUUUGGAUAUGGGACACAUAGAUCUGCCAGAGCUGGAAACUGAAGACACAUUGGAACUACAAUUCCAGCAGCUCAGUCUUCCCCAGUUUUGUGUCUCCAUUCUGGAAUCAGCUGUUCCUCUCUUAAGAACAGGUAGCAGACAAGUGAUAAUAAGAGUUCUGGAAUUGCUUACAGAGGAUAUGACACUUAUUGGUGAAGCAAUUUCAACAGAUAUCUGGGAUGACAGCAGCCUUUUUGGUAUAGAUAUGAAGGAGAAACUACUCCUGGUGUUGGGAGCCCUUGGAGAAACCAUGUGCUACCAUAAAAGUAGUAUCAGUUUGGAGCAGCCAGAGGUGAUGCUUGUGCACCACAGAAUGGCCUUUAUCAGCAUUUCCCUGUUUGCAGUUCGACUGCUACAAACGCUUCUCCCUGUUGAAAAGCUGUUGUGGCCUAUUUGGAACAGCUGAAUUCUGAAAACUACAGUAUUUAUAAACGAACUGCAGAGGCCGUUUAUUCAAUUGAAUGCACCUGUAACUUCCUGUCUGAUAUUGGGAAAGAGGGAGAGAAGAAUCUCUUAGAAUUAGUGGAGCUGGCAGACCAAGCCUUGCGUAGCUUUUCCUAUCAUCAGCAUUUCCCGCUAAUAAAGGAAAUCAUCAGCAUUUGUUCAAAGAUCUGGAAAUCUGCUCAGGCCAGUCCAUUACUACAAGGAGAAAGUCAGAAGGUGCUUCUCCAUAUGUUGUCUCACCCAUUGCCACGAGUGAAAGCUGAAACUUACCACUGCUGUCUGGAAAUCACGAAGGAAUGUUUAGGUGUCCAUAAUGUCACUAAACCCGUGUCUUCACUUUGCAAUGGAAUUCAUUUUCUACUUCAUCCAAAAGUUCUGUAUGAAAUCUCUGUAUUUGGCAUUCAAGAGCCCGAAAGUGAGGUGAACACUGCUGCCAAGGCCAUUCUGUUAUACCUGCUUCAGGGACGAUUGAUGAUGACAGCAUUGACCUGGAACAAGUUUAUUGAAUCUCUCUGUCCUGUCAUCCCAAUACUACAGGGCUAUGCCGACACAGAAGAUCCUCUGGGUAACUGCAUUCUCCUUCUAAGCAAAGCAAGUUCUGACACAGAAGAGAUGCUUCCGUGUACUACCCGAUUAAAGUCCAUGCUGCGACUUUUGCUAGUGAAAAAGCCAUCGGUCCGUUCGCUAGCAUUAAAGCUUUUAGCAUUCCAUCUUACCAGUGAAGAAGGGGCUGAUACAAAGCGUCCUCUAAUAGACGCCAGAGUUCUCUCCAGAGUUACUGAUUUAUUCAUUGGGAAGAAACCUAUUGAACUCAGACUGGAUGACAGAAGAGAGCUGGUUAUUAAGUUGGAGACUGUUGAAAAGGUAUAUGAAAUCUUCACCUCAGAUGAUGUUGAUCUCGUUUUGAGAAAGUCAGCUGCUGAACAGUUAGCUGUGAUUAUGCAAGGUUGUAGAAUGUUUGGUACAACCAUGCCUCACACUCUUGAGGAAGGUUUUAUGUGGUGAUCCAGUCAUGCGUGUUUCGCUCUCGCAACAGUCUUCUCUUUUGACCGUGUUAUUCAGAGUUUCCUUAAUAUUUCAUGAAGAUUGUAGUGUCGUGACUGAAGUUGGAGCACUAUUUUGUCUUCUAUUAUUUGAUGAAGUAUCGAGAAUGGAUAUGUGGUCUGUUAAUCCUUCCAAUAAACCUUCUUUGCCAUCGGUCUUCAGUUUGCCUGUUUCCGUUUUUAGAAGGUACCAUCUACCUGUUCAUGUAAUUGGACACCAUGCUGUGAGUCCUUACUCCAUAGUUUUGCCCUUAUCUGCUGAUUGUUUGGCCUUGAAGCCGGUGUCAGAUAUGCUGAGAAUAGCUUGGAACCUGUCAUGGUAUCAUGGGAGUGAUAAUCUGUUGAAGCAAAUGAACUCUGAAACUAAAACGCAAGAAAUUUUAGAUGCAUUGAAGUUAUCUACAGAGGACAUCCUCACUCUGAAGAUAACACACAUGGCUAGUGGGCUGCAGGACUGCCUCCAUUCCAUUGUUCAGGCUGCAACCCACAGGGAAGUUAGGGCUGCUGUCACCAGGAUGAGUUUUUAUCUUCUGAAUGACAGAUUGUCUUUAAAGGGUUGCCCUGGUCCAUGUGGGGUUACCUUGAAGUCCUUGGCUUGGCACACCGCACUAAACAGGUUUUUACAGGUGCUUCCUGCUUGCACUGAAGAUGAGAAACUGCUAAUAGAUAUCAUACAUUUUUUAAAUAAAUUAAUAAAGGAACAAAGAAAAAAUUCUUCACUAGAACUUCUAAACUGGAUUCUCGAAUUACUUCUUAGACAUAGUGCAAACCCACUGUUAGACCUCUUGGUUCUGACAGAGUCACAGGCACGAGAAGAAACAGAUGAUAUCCGGACUGCUGUCAGGCAACAACUUCAGAAAGAACUGAUUGCUCUUUUUGAUACCUUGCUGCUCAAUUUCAUGGAAGUUACUGACAGGAAAUGCUCGGAACUUCUUUACGUUUUUCAAACGCAGCUGGCUCUGAAACUGCUCCAGUGUCUGAAAGUGACGGAUGCGCCUCAUUUCUAUGGCCUGCCGUCCCUUGAGCGGACCUUACGAGGGAUGGCUAACCUCACUGCGUUUCCGGGAUGGAGCUCACACUCUCCUCUCACAAAGCCUCUAGAUAUCUGUGUGAAGUACUUGUCAGGUCUCCUUGAGGUCAUUACUUCUUUUUAUGUGGAGCGUGGAGGAAAUGCUAUGUCCUUCAUGGGAAAAGGUGUUACAAAGAGCACAAUUCUUUGCUUGCUUCACUUAUCCCAUGAGAUGAUGGCCCAGGCUGGGAGCUUGGAGUGGAUGUCACUUUGGUUCUUGCCUUUGGGUAGUCAUAGUGAAGAACAUAUUCCUACUCAACAAGGAUUGGCUUGGUUGAUUCCAUUAUGGGUUGAUCGGGACCCAGAGGUGAGAUUCACUUCACUGGGAUUAGGAUCAGCACUGACCACCCUUGAAACGGGCUGUGUGGCCUUAGCAAACAGUUGUCAGAACAUUUCCGGUGGGCUCUGGGGAACUGUGGUGAACAUUCUUCUGGACCAGUCAGAAUGUAGUAUGGUGCGCCGGGAGGCGGCAUUUAUUCUUCAGAAUCUCCUUGUAAUUCCAAUGCCUACAGAAAUUAUAAAGGAUUAUACUUGGCAGGGUCCCUGUGUUCAUGAUGAGGACUCUGGCCUAUCGCUCAUUGGAAAACCUGCCCUUCAGGCUCUUUUAUAUCACUGCCAUUUUUAUGAACAUUUGAAUCAGAUGGUAAAGCAUUGUUACCUAGGACGGUGUAUGUUUGAUUUGAAUUUUUCUGCUUUUGAUAGAAAUUCAGAAAGCAAUGAUUUAAAUGGUUUAGAUGACUCAUUCAAGUUUUGGAGGGCUCCAUCUAGGACAAGUCAGGAUCGAGAUCCAAGUUCUCUCUCCACCUCAGAAACAACGGUGGCACCUUCAUUGGGGAGUACUGAAUUUCAGCCACUUGUGCAGUCAACAACACUUCUACCUGAAGCCUCCCAUGACCAGUUUGUGGCUCAAGGUCACCAGGAAAGUACAUCACCACGGCCACCUCAUGAUUCAUCUCUUUCUGCUCCCCUGCCCAAACUGUGUGUUUUUGUUACUCCAUCUCUUCUUUCAGCAAUGUGCAGCCUCUUGGACAACCUCUUGACGAUUGCUCCCAGAGACACUGCAAAGGCUUUUCGACAAGCUCAUCUCAUAGAACUUCUCUGUAGCAUUGCAGAUGCUACCCUCAUACAGACAUGUGUCCAGGAACUCAGAGCCCUGCUGCCUUCAUCACCUCCAGCUGAACACACUCAGGCUCAGGUUUCCUUUCUCCUGGAAUACCUAUCCUCUUUGUCCAGGCUUCUGCAGUCAUGUUUAUUGGUGGAGCCUGACCUUGUGAUUCAGGAUGAGCUUGUGAAACCUCUUAUCACCAAUAUCAUUGGA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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-2256.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2401.46
Frequency: 0.0000
Diversity: 2227.52
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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