Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001319077.2

Sequence Length

1885 nt

GC Content

0.6149

CUUUUUAAGCUCCCCUGAGCCGGUGCUGCGCUCCUCUAAUUGGGACUCCGAGCCGGGGCUAUUUCUGGCGCUGGCGCGGCUCCAAGAAGAUCCGCAUUUGCUACCAGCGGCGGCCGCGGCGGAGCCAGGCCGGUCCUCAGCGCCCAGCACCGCCGCUCCCGGCAACCCGGAGCGCGCACCGCAGGCCGGCGGCCGAGCUCGCGCAUCCCAGCCAUCACUCUUCCACCUGCUCCUUAGAGAAGGGAAGAUGAGUGAGUCGAGCUCGAAGUCCAGCCAGCCCUUGGCCUCCAAGCAGGAAAAGGACGGCACUGAGAAGCGGGGCCGGGGCAGGCCGCGCAAGCAGCCUCCGAAGGAGCCCAGCGAAGUGCCAACACCUAAGAGACCUCGGGGCCGACCAAAGGGAAGCAAAAACAAGGGUGCUGCCAAGACCCGGAAAACCACCACAACUCCAGGAAGGAAACCAAGGGGCAGACCCAAAAAACUGGAGAAGGAGGAAGAGGAGGGCAUCUCGCAGGAGUCCUCGGAGGAGGAGCAGUGACCCAUGCGUGCCGCCUGCUCCUCACUGGAGGAGCAGCUUCCUUCUGGGACUGGACAGCUUUGCUCCGCUCCCACCGCCCCCACCCCUUCCCCAGGCCCACCAUCACCACCGCCUCUGGCCGCCACCCCCAUCUUCCACCUGUGCCCUCACCACCACACUACACAGCACACCAGCCGCUGCAGGGCUCCCAUGGGCUGAGUGGGGAGCAGUUUUCCCCUGGCCUCAGUUCCCAGCUCCCCCCGCCCACCCACGCAUACACACAUGCCCUCCUGGACAAGGCUAACAUCCCACUUAGCCGCACCCUGCACCUGCUGCGUCCCCACUCCCUUGGUGGUGGGGACAUUGCUCUCUGGGCUUUUGGUUUGGGGGCGCCCUCUCUGCUCCUUCACUGUUCCCUCUGGCUUCCCAUAGUGGGGCCUGGGAGGGUUCCCCUGGCCUUAAAAGGGGCCCAAGCCCCAUCUCAUCCUGGCACGCCCUACUCCACUGCCCUGGCAGCAGCAGGUGUGGCCAAUGGAGGGGGGUGCUGGCCCCCAGGAUUCCCCCAGCCAAACUGUCUUUGUCACCACGUGGGGCUCACUUUUCAUCCUUCCCCAACUUCCCUAGUCCCCGUACUAGGUUGGACAGCCCCCUUCGGUUACAGGAAGGCAGGAGGGGUGAGUCCCCUACUCCCUCUUCACUGUGGCCACAGCCCCCUUGCCCUCCGCCUGGGAUCUGAGUACAUAUUGUGGUGAUGGAGAUGCAGUCACUUAUUGUCCAGGUGAGGCCCAAGAGCCCUGUGGCCGCCACCUGAGGUGGGCUGGGGCUGCUCCCCUAACCCUACUUUGCUUCCGCCACUCAGCCAUUUCCCCCUCCUCAGAUGGGGCACCAAUAACAAGGAGCUCACCCUGCCCGCUCCCAACCCCCCUCCUGCUCCUCCCUGCCCCCCAAGGUUCUGGUUCCAUUUUUCCUCUGUUCACAAACUACCUCUGGACAGUUGUGUUGUUUUUUGUUCAAUGUUCCAUUCUUCGACAUCCGUCAUUGCUGCUGCUACCAGCGCCAAAUGUUCAUCCUCAUUGCCUCCUGUUCUGCCCACGAUCCCCUCCCCCAAGAUACUCUUUGUGGGGAAGAGGGGCUGGGGCAUGGCAGGCUGGGUGACCGACUACCCCAGUCCCAGGGAAGGUGGGGCCCUGCCCCUAGGAUGCUGCAGCAGAGUGAGCAAGGGGGCCCAAAUCGACCAUAAAGGGUGUAGGGGCCACCUCCUCCCCCUGUUCUGUUGGGGAGGGGUAGCCAUGAUUUGUCCCAGCCUGGGGCUCCCUCUCUGGUUUCCUAUUUGCAGUUACUUGAAUAAAAAAAAUAUCCUUUUCUGGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-760.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -794.26

Frequency: 0.0000

Diversity: 468.95

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((((((.(((.((((..((.(((((.((((((((((..(((((...(((.(((((.((((....)))).))))).))).)))))..))).((((...........))))(((..(((((((.((..((((........).)))..)).)))))))..))).......)))))))))))))).(((.(((((((((((((((((......))..((((((.((..(((.(((....))).)))...)).))))))).))))))))..).)).))).))).((((((.((.((.......(((..((((((.....((.(((((..((.((((.((....)).))))))....).)))).))..))))))....))).......)).))))))))....)))).)))........((((.((....))))))((....)).....((((.((((.(((((((((.(((((((.((((.....((((.(((((.((....((.((((..(((....))).....((((((((.(((........))).......(((((((((....)))))))))))))))))(((((.((((((....)).)))).)))))..)))))).))))))).))))(((((((.(((.....(((...)))....................(((((....................)))))...((.((((((((((((...(((((((.((((((.(.((((.....(((....))).....)))).))))))).)......((((......)))).(.(((((((((((((((........)))))).....((((((((((((((((((((((((...)).)))))))))...((((...))))....((((.(((((.((((((((.(((((...((((.......(((....))))))))))))..))))))))))))).))))......(((((....))))).......((.((((.............))))..))..)))))))))))))....(((.(((((((.((((...)))).)))))))...))).((((((((((((((((((.((((((((((((((..((((((((((....((((((......))))))))))..((((......))))...))))))...)))))))))))))))..............((((..(.(((..(((..((.....))..)))..))).)..))))..))))))))))))..)))))......))))))))).).)))))).)))))))))))).))....)))))))))))))).)))))))(((((((((...........((......)).....((((.((....)).))))............(((((...........)))))....((((((..((((((((.((((...((.(((..(.((((((((((((((((((((((...........)))))))..((((((.....((..........)).....))))))........((.((((....))))))..((((........))))....((((((.(((((.((..(((((((((((.((......)).)))))..)))))).))))))).))))))(((((.(........))))))....)))))))))))))))..)..))).)).....))))..))).)))))))))))................))))).))))(((.(((.(((((((..........)))))))))).))).......((((((...))))))........))))))))).)))).)))).......)))))).....(((......)))

Thermodynamic Ensemble Prediction

.,{{{{,.(((.((((..{{((((((.((((((((((..(((((...(((.(((((.((((....)))).))))).))).)))))..))).{{((....{,....,))}}{{(..(((((((.((..((((,.......},)))..)).)))))))..}}),,.....)))))))))))))}.(((.((((((((((((((,((......}}..((((((.((..(((.(((....))).}))...)).))))))).))))))))..},)}.))).))).{(((((,({.,{..{{...(((..((((((.....((.(((((..((.((((.((....)).))))))....).)))).))..))))))....))}......,)).)))))))}....)))).)))........((((.((....))))))((....}}..,..((((.((((.((((((((({((((,((.((({.....{{((,({(((,((..,,(({((({..,,,{,,,(||{|||{{{{{({(((((((,,......|||.,.}}}|||||||||...,|}||||||||.,,,,,,(((((.(((({{....}).)))).)))))..}}},},.}}}}}}},||||{({{{{{.{{,...,,(((..,|||.|,,................(((({..................,,)}}},...({.{{{(((((((((...(((((((.((((((,(.(({{.....(((....))).....})))}})))))).},.....((((......)))),(.(((((((((((((((........)))))),...,((((((((((((((((((((((((...)).)))))))))...((({...||||,{..((({.(((((.((((((((.(((((..,(((({......,{{....}}))))))))))..)))))))).))))}))))..,,..(((((....))))).......,,.(({{.,...........})))..))}}))))))))))))),...{{{.{((((((.((((...)))).)}}))))}.,))}.((((((((((((((((((.((((((((((((((..((((((((((....((((((......))))))))))..|{{(......))}|...)))))).,.)))))))))),)))},,},.........,||||},|.(((..(((..((.....))..)))..))).}..,,,,..))))))))))))}.,))))......))))))))).).)))}}}.)))))))))))).)),,..})))))))))})))|})))}}}||{,,{{{,.....{|,,,,},.,,,,.)).....,{|||||,...}}.)|}}............(((((.......,...)))))....{{{|||,,|{{|||{(.((((,,{({.{((..,.((((((((((((((((((((((...........||||}}}..{,{{{{.....,|..}}||,...},.....,|||,...}}}.,{{{(((((....))))|||,|{{(........}}}}{{,,((((((.(((((.({..(((((((((((,((.....,)).}))))..)))))).})))))).)))))){{|||||....,,|.,}}}))},..}))))))))|||||}..),,))}.)).,}..)))),,))).)))))})))))........,,,,....,)))},))))|((.(((.(((((((,......,..)))))))))).))}..,,...||||||,..))))})}.}})}}.))))))))).)))).)))}...},..,,,,,,.....{((......))}