Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001319197.1
Sequence Length
546 nt
GC Content
0.4890
GAGAAACCAGAGACUGUAGCAACUCUGGCAGGGAGAAGCUGUCUCUGAUGGCCUGAAGCUGUGGGCAGCUGGCCAAGCCUAACCGCUAUAAAAAGGAGCUGCCUCUCAGCCCUGCAUGUCUCUUGUCAGCUGUCUUUCAGAAGACCUGGUUCUGUUUUUCAGGUGGGGCAAGUCCGUGGGCAUCAUGUUGACCGAGCUGGAGAAAGCCUUGAACUCUAUCAUCGACGUCUACCACAAGUACUCCCUGAUAAAGGGGAAUUUCCAUGCCGUCUACAGGGAUGACCUGAAGAAAUUGCUAGAGACCGAGUGUCCUCAGUAUAUCAGGAAAAAGGGUGCAGACGUCUGGUUCAAAGAGUUGGAUAUCAACACUGAUGGUGCAGUUAACUUCCAGGAGUUCCUCAUUCUGGUGAUAAAGAUGGGCGUGGCAGCCCACAAAAAAAGCCAUGAAGAAAGCCACAAAGAGUAGCUGAGUUACUGGGCCCAGAGGCUGGGCCCCUGGACAUGUACCUGCAGAAUAAUAAAGUCAUCAAUACCUCAAAAAAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-172.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -182.02
Frequency: 0.0000
Diversity: 147.49
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((....(((((((...(((..((((.....))))..)))))))))).(((((...(((((....))))))))))(((......)))......(((.((((.....)))))))((((((((...(((..(((.....)))..))).(((((...((((((((((((((.((.(((.(((((((((((((((....(((......))).((.((((((...((((((((((.......(((((((((((((..(((((((((((..((..(((.((((.....)))).)))....))..).))...))).)))))....))))))).....))))))))))))).)))....)))))).))..))))))....)))))).........)))))).))))))))).((((........(((((......)))))........)))))))))))))))).....((((((...))))))((((((((...))))))))..))))))))............................)))..........
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((....,,((((({..(,,..,(((,,{{{||||..||||))))}},{((({...{((((.{{{||||||||},{||,.....}}}......,||,||||,,...))))}}|((((((({...{(({((({{({{{|||..,||{{((,,.,,,,,,|||||{((((.((.(((.(((((((((((((((.{{,(((......))),||,((((((,,,({{(((((((.......(((((((((((((..{((({..,|||..,{..(((.((((.....)))).)))...,||{.{,||{...,.}))))),}},))))))).....))))))))))))).)))....)))))).},..)))))).,}}))}}}}........,)))))).))))))}||,((((........(((((......)))))........)))),)))}},,})},.,,}}|{||||},,}}},,,((((((((...))))))))..)))))))),}})))})}.......}))).}}.....)))..........
Back