Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001319667.1
Sequence Length
3052 nt
GC Content
0.3961
AAACUGGGCGAUCAGGCAGCGACCCUAGAGGCGUCUGUAGGGUAAAGCUGGGGGUUCUGUAGCCGGAGGCGGCGGCGAGUCCAGAACGUCCUGGCCUUACAGGGAGAAGGCGUCACUCGCGGUUACAAGUGCCUGACCCUCACUCCAGUUGGCGGAGGAGGAGAAGGAAGGGGCCGGGCCGGGUCCCCUCCCCUCGCGCCCCGGAUGGAUGUGCCCGGCCCGGUGUCUCGGCGGGCGGCGGCGGCGGCGGCCACUGUGCUCCUGCGGACCGCUCGGGUCCGUCGCGAAUGCUGGUUCUUGCCGACCGCGCUGCUCUGCGCCUACGGCUUCUUCGCCAGCCUCAGGCCGUCCGAGCCCUUCCUGACCCCGUACCUGCUGGGGCCGGACAAGAACCUGACCGAGAGGGAGGAACCCAAGCCAGACCGUCUCCUUGUAUUGAAAGUACUAUGGAAUGAUUUCCUGAUGUGCUACUCCUCUCGCCCUCUUCUCUGCUGGUCUGUGUGGUGGGCCCUCUCUACCUGUGGCUAUUUUCAAGUUGUGAACUACACACAGGGCCUGUGGGAGAAAGUGAUGCCUUCUCGCUAUGCUGCUAUCUAUAAUGGUGGCGUGGAGGCCGUUUCAACCUUACUGGGUGCUGUUGCUGUGUUUGCAGUUGGUUAUAUAAAAAUAUCCUGGUCAACUUGGGGAGAAAUGACAUUAUCUCUCUUUUCUCUCCUGAUUGCUGCUGCAGUGUAUAUCAUGGACACUGUGGGUAACAUUUGGGUGUGCUAUGCAUCCUAUGUUGUCUUCAGAAUCAUCUACAUGUUACUCAUCACGAUAGCAACUUUUCAAAUUGCUGCAAACCUCAGCAUGGAACGCUAUGCCCUAGUAUUUGGUGUAAAUACCUUCAUUGCCCUGGCACUGCAGACGCUGCUCACUCUAAUUGUGGUAGAUGCCAGUGGCCUUGGAUUAGAAAUUACCACUCAGUUUUUGAUCUAUGCCAGUUAUUUUGCACUCAUCGCUGUGGUUUUCCUGGCCAGUGGUGCAGUCAGUGUUAUGAAGAAAUGUAGAAAGCUGGAAGAUCCACAAUCAAGUUCUCAAGUAACCACUUCAUAAUAUACUGCUGAAGGGCUUCUUCUUAUAGCAAGAACUCUGCACAGCAACUGCCUGGAUGUGUUUGAUUUUUUAAAGCGUAGACAUAUAUUUAUGAAUGUGCAUUUCUUGACUUCACAGCAGCCACUUGACUAAUACCUUGUGUUCCGGGAAUAACAUGAUACUAUUCAGAGGAGCCAGAAGUAAAGUUUAUUUCAUGGAUUAUUUAUGAGAGCUAAUUUAAGGAUGACUUUUUUUCUGAUUCAAAAGUGAACUUGAUUUUAAAAACCAGUCAAGAGCAAUCAAAGCAGCACAUGGUGUUGUAUACUUCAUUAGCAAGUGAGUUUGGUGUUUUAUAGGUCACAUAUGUCUGUAUCUACUUAGCCAGAUGCUUGGCCUGGUGGGACCAGGGCUCCACAGAGGCCACAAAAUGUUGCAAGUCAUGAUGGAUGGAAAUAUGUUCUAACAGCAUCUGCCUCUAUUCAAUUUAAUUCUUAUUUCUGUGUUACUCAUGUACAUUGGUCUUUCUACAUAGUUAUUCUAUCACUGGCAAUAUUUGUUCUGGUUUAGUGUUCUGUAUUUUAAGGUGUACGUAUCAUUUCUAAUUUUAAGUUAUUUUAAAAAAAUUCAUCAUAUGAAUGUUCUUGGUUCCCAUUGUGACGAUUAUUUAUUUCUGUAAAAUUUGUUUAGAAGUACGUUUUUGCAUUAUUCAUAUGCUUCCCAGAGAAGCUCAUUUAGUUAGAAAAUAAGGCAAGUUUUGAAGCCUGCUAAAUGAAGAGACUUAAGAAAGCUUAAGGUACGCUUGCUUGUCUUUAAAUCUUCAAUAUGAAGGACUAUUAAUUCCAAGAUUAAAAGUUCAUAUAUAGGCUAAAGAUGUAACUAGGCCAUUUGUAUUUGUAUUCCCUUUUAUUUCCAAAAUAAAAUGAAAAAUCUUUUUUUAAUAAUUUCAUCCCUAUUUAUAGUUUUUAUAUUAAUUUGUUUUUCUUAUCCAAGUAAAGAUGUCAAUAGGAAUUGCAUUAGUCCAAGGCCUUUUUCAUAAACUGAGCCUCUUUUCAAUUAUUUCAAUGGGACAGGAACUAGGAUAGAUGUGAUUCCUGCAUUUUUUUACCUUAAAUCUGCCUUUGUUUCUAAAGGUAGAUCAUCUUGAAUAUUUGCUUAAAAUUGCUAGUGAUUUCAUUACCAAGUUACUUGAAAAAAUGUUCUAUAUGCAUUUAAUUCUGAAAUCAGUCUACCAAGGGGCUGCUAGUAUAUGUCAGACAUGAAAACUAUUUUAAAGCUGACUUUGUUGCCUUAUCUUGAAAAGAAUCUAGAUAGGUGCUUUUAACUGGGGUAUUAACUUUUUUAGAAUGACACAGCUGAACAGUGUUAAUAAUAGUGUGUCAAGAUUGCAAAGUCGACAUACUCAUUUGGUUUAAGCAGGAAUCCUAGAAGCAAAUGGAUGGGGAUAAGAAUAGGUCAUUUUCUAUUCACCAUCCUUUACUAUUAAGGGAAAGGAAAAGAACACUAGCUAAGGAAGGGAAAGGGAAGUGAUAUCAUAAAAGUAGCAACCUUCAUUUUACAUUCUGUCUGUUUUUCUUUUUUUGCUUUGUUUUGUUUGUGCUAAUUUGGGAAUUGUGUACUCCGAAACAAGUAGAAAAGUGCUGUUUGAGGGAUUUUAUUAAAUCUUUUUUUAAUGGAAUGUGGUACAAAUUGUUCAUGUUACCAAAGCAAUAUUUCCCUGGAAUUUAAUUCAAAGUUUGUGGCAUACAACCUGAGCCUUUUCUUAUAUAAGACAAGAAUAUGUUCACAUCUUGGUAUGUGGCCAUAUUUAUAGAAUGCUGAACUCAAUGUGCAAGUUGUACUGUAUGCAGUUUUGUAAAUAAGUGAAAAUAAUUUGUUGUACUUUUUAUUCAAUUCUGUAUAGAUUAUAAAAUUAUUUUUAUUAAAUAAAUAUUUUACAGUAUAUUUUCUCUUUUUAAUCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-867.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -927.02
Frequency: 0.0000
Diversity: 973.34
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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