Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001320814.1

Sequence Length

2341 nt

GC Content

0.5305

AGAGCAUGGAAGAUUCAGCUGAAAUCAGAGAGGUGAAGCCAGUUUCCCAGGGUAACAUAGUGAGGCACUGAAAGAAAGGAGACUGCACUGGAGCCCAGGUCCCUGGGCUCCCCAGAGCUCCUUACUCUUCCUCCUCCUCAGCAGUCUUGAGACCCCACAACCUCCAGCCGGAGGCCUGAAGCAUGAGGCCAUGCCAGGAGCAGCGACUGGACCCAGAGCCAUGUGGCUGUGCCCUCUGGCCCUCACCCUCAUCUUGAUGGCAGCCUCUGGUGCUGCGUGCGAAGUGAAGGACGUUUGUGUUGGAAGCCCUGGUAUCCCCGGCACUCCUGGAUCCCACGGCCUGCCAGGCAGGGACGGGAGAGAUGGUGUCAAAGGAGACCCUGGCCCUCCAGGCCCCAUGGGUCCGCCUGGAGAAACACCAUGUCCUCCUGGGAAUAAUGGGCUGCCUGGAGCCCCUGGUGUCCCUGGAGAGCGUGGAGAGAAGGGGGAGGCUGGCGAGAGAGGCCCUCCAGGGCUUCCAGCUCAUCUAGAUGAGGAGCUCCAAGCCACACUCCACGACUUCAGACAUCAAAUCCUGCAGACAAGGGGAGCCCUCAGUCUGCAGGGCUCCAUAAUGACAGUAGGAGAGAAGGUCUUCUCCAGCAAUGGGCAGUCCAUCACUUUUGAUGCCAUUCAGGAGGCAUGUGCCAGAGCAGGCGGCCGCAUUGCUGUCCCAAGGAAUCCAGAGGAAAAUGAGGCCAUUGCAAGCUUCGUGAAGAAGUACAACACAUAUGCCUAUGUAGGCCUGACUGAGGGUCCCAGCCCUGGAGACUUCCGCUACUCAGAUGGGACCCCUGUAAACUACACCAACUGGUACCGAGGGGAGCCUGCAGGUCGGGGAAAAGAGCAGUGUGUGGAGAUGUACACAGAUGGGCAGUGGAAUGACAGGAACUGCCUGUACUCCCGACUGACCAUCUGUGAGUUCUGAGAGGCAUUUAGGCCAUGGGACAGGGAGGAUCCUGUCUGGCCUUCAGUUUCCAUCCCCAGGAUCCACUUGGUCUGUGAGAUGCUAGAACUCCCUUUCAACAGAAUUCACUUGUGGCUAUUAGAGCUGGAGGCACCCUUAGCCACUUCAUUCCCCUGAUGGGCCCUGACUCUUCCCCAUAAUCACUGACCAGCCUUGACACUCCCCUUGCAAACCAUCCCAGCACUGCACCCCAGGCAGCCACUCCUAGCCUUGGCCUUUGGCAUGAGAUGGAGGCCUCCUUAUUCCCCAUCUGGUCCAGUUCCUUCACUUACAGAUGGCAGCAGUGAGGCCUUGGGGUAGAAGGAUCCUCCAAAGUCACACAGAGUGCCUGCCUCCUGGUCCCCUCAGCUCUGCCUCUGCAGCCCACUGCCUGCCCAGUGCCAUCAGGAUGAGCAGUACCGGCCAAGCAUAAUGACAGAGAGAGGCAGAUUUCAGGGAAGCCCUGACUGUGUGGAGCUAAGGACACAGUGGAGAUUCUCUGGCACUCUGAGGUCUCUGUGGCAGGCCUGGUCAGGCUCUCCAGGUGGUCAGAGGGCCCAGUGGUGCCCCAGCACGGUGGUGCCCAAGCCAACCCUGUGACUGACAUGUACGAUUCACUCCUUUGAGUCUUUGGAUGCCAACUCAGCCCCCUGACCUGGAGGCAGCCGGCCAAGGCCUCUAGGGAAGAGCCCCCCACUGCAGACAUGACCCGAGUAACUUUCUGCUGAUGAACAAAUCUGCACCCCACUUCAGACCUCGGUGGGCAUUCACACCACCCCCCAUGCCACCGGCUCCACUUUCCCCUUUUAUUAAUACAUUCACCCAGAUAAUCAUUAAAAUUAACAUGUGCCAGGUCUUAGGAUGUGUCUUGGGGUGGGCACAGUACCCGGUGACUCUUGGGGAUAUUUAUUUAUUUUCCCUGAGCCUAUAUCUUCAUCUGUGAAAUGGGGAUAAAAAUACUUGUUGCUGUCACAAUUAUUACCAUCUCUCCAGCUAGCAAAAUUACUACCAGAGCCGUUACUACACACAAAGGCUAUUGACCGAGCACAUACCAUGUGCCACACACCUUGACAAAAUCUUUUAAUACAGUUUAUUAUGUACUAUUCAAUCUUUACACAAUGUCACGGGACCAGUAUUGUUUACCCAAUUUUUUAUAAGGACACUGAAGCUUAGAGGAGUGAAAUGUUUUGAGUGUUAUUUCAGAGAGCAAAUGGCAAAGACUGGAUCCAAACCCAUCUUCCUGGACCUGAAGUUCAUGCUCCCAGCCACCCCACCCCUGAGCUGAAUAAAGAUGAUUUAAGCAUAAUAAAUCGUUAGUGUGUUCACAUGAGUUUCCAUAAAAAAAAAAAAAAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-845.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -886.95

Frequency: 0.0000

Diversity: 505.10

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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