Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001320986.2

Sequence Length

904 nt

GC Content

0.4137

AUCUCCAAAACCCCACUUUCUCCUUCCUUUGAGCCUCCGUACCAGCUGGGGCGUCCGGCAAGAUGUGAGUUGUCACUCUGCUGCGGCACAGACCUGAAUUAACAACUCUAGCUAGGGCUGACUUCAAAAAGCACUUUCGUUUUUUAAUAACCAACAUCAGCUCAGCAGGCUUCAUUUGGGAAAAGAAACCUUGUCGGAUUACCCCGACAUUCUCCACCUCCUGGGAGGCCAGCCAUUCCCAAAUGCCCCAAGGAUGAAGAACGGAGACGGUAGACGCACCCUCUGAAGAUGGUGACUCCCUCCUGAGAAGCUGGACCCCUUGGUAAAAGACAAGGCCUUCUCCAAGAAGAAUAUGAAAGUGUUACUCAGACUUAUUUGUUUCAUAGCUCUACUGAUUUCUUCUCUGGAGGCUGAUAAAUGCAAGGAACGUGAAGAAAAAAUAAUUUUAGUGUCAUCUGCAAAUGAAAUUGAUGUUCGUCCCUGUCCUCUUAACCCAAAUGAACACAAAGGCACUAUAACUUGGUAUAAAGAUGACAGCAAGACACCUGUAUCUACAGAACAAGCCUCCAGGAUUCAUCAACACAAAGAGAAACUUUGGUUUGUUCCUGCUAAGGUGGAGGAUUCAGGACAUUACUAUUGCGUGGUAAGAAAUUCAUCUUACUGCCUCAGAAUUAAAAUAAGUGCAAAAUUUGUGGAGAAUGAGCCUAACUUAUGUUAUAAUGCACAAGCCAUAUUUAAGCAGAAACUACCCGUUGCAGGAGACGGAGGACUUGUGUGCCCUUAUAUGGAGUUUUUUAAAAAUGAAAAUAAUGAGUUACCUAAAUUACAGUGGUAUAAGGUAAUUUUAUUUUAAAUAUGACAUUUCACUUUUCCAGAAAAUAAAAUAGUUCCCUGGACAAUAGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-228.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -243.54

Frequency: 0.0000

Diversity: 261.32

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

...(((..(((((((((((......((((((.(((((.((....)).)))))((((((((.((.((((....))))))))))).)))..(((..((......))..))).(((.(((((((....(((((((......)))))))...........))))))))))....((((((((((..((((.....((((((......))))))...((((.((.((((((((...((((((........((....))........(((((..(((......))))))))..)))))).....)))))).)).)).))))..(((((........)))))....((((((((((((......((.((((...((((......))))..)))).))......))))))).)))))((........))..(((....((.(((....((((((((.(((.....)))..))))))))...))).))....)))))))..))))))))))..)))))).((((.....))))....(((((.(((........)))))))).(((((((((((...(((.(((.((........))))).))).)))))))).)))..))))))).)).))..))).....((((((.(((((((((......))))))))).(((...((((((((.(((((....((((((...(((((.....))))).)))))))))))...((((((....(((.(.....((((((......))))).)......).)))....)))))).((((((.......))))))...(((((((((....(((....)))..)))))))))))))))))...)))...........(((((..(((......)))..)))))))))))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

.,,{{{,......{{{{({,{{,{{{{((({(((((({({.,,.||{|||||(((((((,,((.((((....))))))))))).)))..,,,..{{......,,..|||.(((.(((((((....(((((((......)))))))...........)))))))))),||.,,{((((((({{.{{,.....((((((......)))))).|{{{{......,{|}}||.......})))))}}})}))),.}},,|.,,...((((,.((,{(,..((((.((....)).)))).}}}}}}}|,,,,.}}.,)),..(((((........))))).|,|||||,(((((((.,,...((.((((...{(((......)))).,)))).))..,...))))))),}))))||}.......,,,}}|||,|,||,|,,....,,,{{{{(,((({,,..|||..}}},,}||||||||(((.(((((.((({..,({{{.,,........,..........}))),...}})).)))))...))).{((,(||||.{{(((((((((...{((.(((.((........))))).))).))))))))}})).,.))))),))).,,,,)))}},,,,,,|||,(((((((((......))))))))),|||...,,...{{{|{{|,,...,||||||},,,{{{{.....}}}||{|||||,,||||{{{(({{,{....(,{.{..,,.,(((((......))))).)}.}}}})})}|,,..,,}})).||{{{{......,}|||||{..{((((((((....(((....)))..))))))))))))))}...,)))))}},||..,,.(((((..(((......)))..))))).,,..),.