Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001321089.3

Sequence Length

2057 nt

GC Content

0.6193

AGUGGACGGCACGCCGCGGCGGGGUGGGUGCAAGAUGCCGCUGCCGGUUCAGGUGUUUAACUUGCAGCAGCCAGCCAGCUCUGUGUCAGGGUCGGGGGGUGCAGAAAGUCAGGACAGAAUGAGGGAUAGCUCGGCCCCCAGCUCGGCCUCCUCGUCAGUGACAGAUCUGUACUGCACCCCUCACAGCAGUAGGUCAGACCUCGUCCUGCCCGGCACGGCCGGGGACUUCAGCCUGAGCGCCAGCCUGUCGGCCUGUACGCUGCUCUACGAGGGGGCCGUGGAGCCCAUGCAGAUCGACGUGGACCCCCAGGAAGACCCGCAGAAUGCACCUGACGUCAACUACGUGGUGGAGAACCCCAGCCUGGAUCUGGAACAGUACGCGGCCAGCUACAGCGGCCUGAUGCGCAUCGAACGGCUGCAGUUCAUUGCUGAUCACUGCCCCACGCUGCGGGUGGAGGCCCUGAAGAUGGCCCUCUCCUUCGUGCAGAGAACCUUUAACGUGGACAUGUACGAGGAGAUCCACCGCAAGCUCUCAGAGGCCACCAGGUCCUCUCUCAGGGAGCUGCAGAACGCACCCGACGCCAUCCCUGAGAGCGGCGUGGAGCCCCCAGCCCUGGACACGGCCUGGGUGGAGGCCACGCGGAAGAAGGCGCUGCUGAAGCUGGAGAAGCUGGACACAGACCUGAAGAACUACAAGGGCAACUCCAUCAAAGAGAGCAUCCGGCGCGGCCACGACGACCUGGGCGACCACUACCUGGACUGUGGGGACCUCAGCAACGCCCUCAAGUGCUAUUCCCGGGCCCGGGACUACUGCACCAGCGCCAAACACGUCAUCAACAUGUGCCUCAAUGUCAUCAAGGUCAGCGUCUACUUGCAGAAUUGGUCUCAUGUGCUCAGCUACGUCAGCAAGGCUGAGUCCACCCCAGAGAUUGCCGAGCAGCGAGGAGAGCGUGACAGCCAGACCCAGGCCAUCCUCACCAAGCUCAAGUGUGCCGCAGGCUUGGCAGAGCUGGCCGCCAGGAAGUACAAGCAGGCUGCCAAGUGCCUCCUGCUGGCUUCCUUUGAUCACUGUGACUUCCCUGAGCUGCUGUCCCCCAGCAACGUGGCCAUCUACGGUGGCCUGUGCGCCUUGGCUACCUUUGACCGGCAGGAGCUGCAGCGCAAUGUCAUCUCCAGCAGCUCCUUCAAGUUGUUCUUGGAGCUGGAGCCACAGGUCCGAGACAUCAUCUUCAAAUUCUACGAGUCCAAGUACGCCUCAUGUCUCAAGAUGCUGGACGAGAUGAAGGACAACCUGCUCCUGGACAUGUAUCUGGCCCCCCAUGUCAGGACCCUGUACACCCAGAUUCGCAACCGUGCCCUCAUCCAGUAUUUCAGCCCCUACGUGUCAGCCGACAUGCAUAGGAUGGCGGCAGCCUUCAAUACCACGGUGGCCGCCCUGGAGGACGAGCUGACGCAGCUAAUCCUGGAGGGGCUGAUCAGUGCCCGUGUGGACUCACACAGCAAGAUCCUAUACGCCCGGGACGUGGAUCAGCGCAGCACCACCUUUGAGAAGUCUCUGUUGAUGGGCAAGGAGUUCCAGCGCCGCGCCAAGGCCAUGAUGCUGCGGGCAGCUGUGCUCCGCAACCAGAUCCAUGUCAAGUCCCCGCCCAGAGAAGGGAGCCAGGGGGAGCUGACUCCAGCCAACAGCCAGUCCCGGAUGAGCACCAACAUGUGAGGGGUGAACCUUGGCCUCCAGGACAUCUGCACCCCCUCCCCACCUCCACGGACCUCGGACCUCCAGGCGGCUCAGUGCUGCCUGCGGCCCAGCUAAGGGGCCUGGCCACUGGGUGCCACCCAGCCUGUGUGCCCUCCCUGGGGCUGAGGAGGCAGGCGGCUGCUAGUUGUGGCCCUUCCUGGAAGGAGAGGCCUGCAGGGCUCGACCCUGUGGGUUUCUGUCCCCAGGGAGCAGACUGUGCGGCACCCAGGCCCAGUGGCACCAUUUCCCAGACCCCUCCUGUUCCCGCCUCAGUCAGGUGCAGACAAGUGGGCGGUGUCCAUUAAAGAGCAGACUCAGCGUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-856.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -889.98

Frequency: 0.0000

Diversity: 428.66

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((((((..((..(.((.((((.(((((((.(((((((((((.(((((((((.....)))))....)))).).)))).........(((((((((((((((((..((((.(((.((..((((...((((.((...))))))...)))).)))))..))))...)))))))).(((((((((((...((.(((.....(((((((....((((...))))((((((...((.((((((.(((((....)).)))..))))((((((((.(....)))))))))(((((........))))).(((((.((....((((((...))).....((((.....))))(((((.((......((.(((((((((........((((..(((.(((((.(((((....((((((...((((((((((((....)))..))))).....(((((((.((((((((........)))).((((((.((((((.....((........))...)))))))))))))))))))).))).....((((((....)).))))((((((((((((((.....)))......))..)))))))))((((((((((((.((..((((....((((.((((((((..(((((((.((..((((((((((((...(((((((..((((((......(((...........)))((..(((.......))).))....(((((((...(((....(((((.(((.....((((.((.((((((...........((.((...((((...(((((....))))).....)))).)).)).......((((...((((((.((......(((((..(..(((((((((((((.((((((((((((.((.((((((((..........)))))))).)).....))))))((((((((((.(((.(((.((.((((.........(((((..(((.(((((((...(((...))).)))))))..))).)))))...(((((((...((((((..((.....))..)))))).))))))).......)))).))))))))..))))))(((.....(((.((.(((((((...)))))))))))).....)))..........))))(((((((((..................)))))))))..(((.((.(((((((.(((......))).)))))))...)).)))..)))))).))))).....................))))))))..)..)))))((((........))))))))))))...)))).)))))))))))).....)).).)))))..)))...)))))))....)))))).))))))).((((((((((....))))))..))))..)))))).))))))....)).).))))))(((((..((((..(((((...)))))..))))...))))).((((..(((..(((((....))))).))).)))).....)))))))).)))).(((((((.((.((............)))).)))))))))))..)).)))))).)))))).....)))).))))))..))))).))))))))))))..))))))))).))....)).))))).......)))..)).))))).((((....))))...)))).))))))))))))).))).)).)))))))))))..)))))))))...)).)))))))))))...)))).)).)..))..))..((.((..((((((((.....)))))))).))))(((...(((((.((((......((((((((...(((((.(((((.(((((((((((.((((((..(((.((........)).))))))))).)....((((((((((((((.....))))))))))))))).)))))))))(((.....)))))))).)))))...)))))))).....)))).))))).)))...((((((..(((.......)))....)))))).)))))))...(((....)))......

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((((({,(.((((((((.((((,(((((({,({((({(((((.{(({{(({(.....)))))}}})})}}.}},,}}{{{{{{...((({,((((((((((((..((((,{((,({,,(((({..,(((.(({..,,,))).}})}))}))))}..}}}}...)))))))),(((((((((((...((.(((.....(((((((..,{((((...}}}||(((((,,.{({((,({{.{{|{{{{{{||.{||{{,|,,((((((((.(....))))))))),|,||}}}.}})}))})).{{{{|.{{....{{{(((...,))..|||((((.....))))(((((.{,.,....((.(((((((((........((((..(((.(((((.(((((..,.((((((...((((((((((((....)))..))))).....((((({({((((((((........)))).((((({{((((((.....((........))...)))))))))))))))))))),}))....,((((((....)).))))|(((((((({{{((.....}},......))..))))))))}((((((((((((.((..((((....((((.((((((((..(((((((.((..((((((((((((...(((((((..((((((....,.(((...........})){{..(((,......)}),),....(((((((...(({..,.(((((.(((.....((({{((.((((((.....,{,..,{{.,,...|||||..(((((....))))).....|}}}.,),}|.......((({...((((((.({......(((((..(.,(((((((((((((.((((((((((((.,(,((((((((..........)))))))}.)),....))))},(((({(((({,(((,{{(,{(,{{{{.......},{||{{,}|||.{{{((({,,,({(,,.|||,||||}}}..|||.|||||,,.(((((((.{.{(((((..((.....))..))))))})))))))..,.,,.}})).}}}}}}}),.))||||(.....}}|||,{|,|||||{|...})))))))))))}}}}}))),....,}}..))))(((((((((..................)))))))))...,(.((,(((((((.(((......))).)))))))}}.},.,,...}})))).))))}...,,.,,,.....,}},...)))))))),.)..)))))(((({,...,}.))))))))))))...)))).)))))))))))).....)).).)))))..)))...))))))).,..)))))).))))))).((((((((((....))))))..))))..)))))).))))))....)).)}})))))(((((..((((..(((((...)))))..))))...))))).((((..(((..(((((....))))).))).)))).....)))))))).)))).(((((((.((.{{,........|..)})).)))))))))))..)).)))))},)))))).....)))).)))))).,))))).))))))))))))..))))))))).))...})),)))))|......)))..)).))))).((((.,..)}))...,,)),})))},))))))).))).)).)))))))))))..}|||||}},}},)).)})))))))))}},}))).}}.,||}}},.|,.((.((..((((((((.....)))))))).))})|,}...(((((.((((......((((((((...(((((.(((((,((((((((({(.((((((..(((.((........)).))))))))).}..,.((((((((((((((.....)))))))))))))).,)))))))))|{{.....}}}))))).)))))...)))))))).....)))).))))).,|{{{.,(((({.....}))})..))),.))))))))))))))))...(((....)))......