Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001321092.3
Sequence Length
1841 nt
GC Content
0.6165
AGUGGACGGCACGCCGCGGCGGGGUGGGUGCAAGAUGCCGCUGCCGGUUCAGGUGUUUAACUUGCAGGGGGCCGUGGAGCCCAUGCAGAUCGACGUGGACCCCCAGGAAGACCCGCAGAAUGCACCUGACGUCAACUACGUGGUGGAGAACCCCAGCCUGGAUCUGGAACAGUACGCGGCCAGCUACAGCGGCCUGAUGCGCAUCGAACGGCUGCAGUUCAUUGCUGAUCACUGCCCCACGCUGCGGGUGGAGGCCCUGAAGAUGGCCCUCUCCUUCGUGCAGAGAACCUUUAACGUGGACAUGUACGAGGAGAUCCACCGCAAGCUCUCAGAGGCCACCAGGGAGCUGCAGAACGCACCCGACGCCAUCCCUGAGAGCGGCGUGGAGCCCCCAGCCCUGGACACGGCCUGGGUGGAGGCCACGCGGAAGAAGGCGCUGCUGAAGCUGGAGAAGCUGGACACAGACCUGAAGAACUACAAGGGCAACUCCAUCAAAGAGAGCAUCCGGCGCGGCCACGACGACCUGGGCGACCACUACCUGGACUGUGGGGACCUCAGCAACGCCCUCAAGUGCUAUUCCCGGGCCCGGGACUACUGCACCAGCGCCAAACACGUCAUCAACAUGUGCCUCAAUGUCAUCAAGGUCAGCGUCUACUUGCAGAAUUGGUCUCAUGUGCUCAGCUACGUCAGCAAGGCUGAGUCCACCCCAGAGAUUGCCGAGCAGCGAGGAGAGCGUGACAGCCAGACCCAGGCCAUCCUCACCAAGCUCAAGUGUGCCGCAGGCUUGGCAGAGCUGGCCGCCAGGAAGUACAAGCAGGCUGCCAAGUGCCUCCUGCUGGCUUCCUUUGAUCACUGUGACUUCCCUGAGCUGCUGUCCCCCAGCAACGUGGCCAUCUACGGUGGCCUGUGCGCCUUGGCUACCUUUGACCGGCAGGAGCUGCAGCGCAAUGUCAUCUCCAGCAGCUCCUUCAAGUUGUUCUUGGAGCUGGAGCCACAGGUCCGAGACAUCAUCUUCAAAUUCUACGAGUCCAAGUACGCCUCAUGUCUCAAGAUGCUGGACGAGAUGAAGGACAACCUGCUCCUGGACAUGUAUCUGGCCCCCCAUGUCAGGACCCUGUACACCCAGAUUCGCAACCGUGCCCUCAUCCAGUAUUUCAGCCCCUACGUGUCAGCCGACAUGCAUAGGAUGGCGGCAGCCUUCAAUACCACGGUGGCCGCCCUGGAGGACGAGCUGACGCAGCUAAUCCUGGAGGGGCUGAUCAGUGCCCGUGUGGACUCACACAGCAAGAUCCUAUACGCCCGGGACGUGGAUCAGCGCAGCACCACCUUUGAGAAGUCUCUGUUGAUGGGCAAGGAGUUCCAGCGCCGCGCCAAGGCCAUGAUGCUGCGGGCAGCUGUGCUCCGCAACCAGAUCCAUGUCAAGUCCCCGCCCAGAGAAGGGAGCCAGGGGGAGCUGACUCCAGCCAACAGCCAGUCCCGGAUGAGCACCAACAUGUGAGGGGUGAACCUUGGCCUCCAGGACAUCUGCACCCCCUCCCCACCUCCACGGACCUCGGACCUCCAGGCGGCUCAGUGCUGCCUGCGGCCCAGCUAAGGGGCCUGGCCACUGGGUGCCACCCAGCCUGUGUGCCCUCCCUGGGGCUGAGGAGGCAGGCGGCUGCUAGUUGUGGCCCUUCCUGGAAGGAGAGGCCUGCAGGGCUCGACCCUGUGGGUUUCUGUCCCCAGGGAGCAGACUGUGCGGCACCCAGGCCCAGUGGCACCAUUUCCCAGACCCCUCCUGUUCCCGCCUCAGUCAGGUGCAGACAAGUGGGCGGUGUCCAUUAAAGAGCAGACUCAGCGUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-757.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -787.46
Frequency: 0.0000
Diversity: 396.97
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((..((..(.((.((((.(((((((.((((..((((..(((((((((((.....((((.(((..((..((.(.(((((........))))).).))..))....)))))))...)))))))((((.....))))(((((......))).))(((((((((........((((..(((.(((((.(((((....((((((...((((((((((((....)))..))))).....(((((((.((((((((........)))).((((((.((((((.....((........))...)))))))))))))))))))).)))((((((.(((.....(((.((........)).)))...)))....))))))((((((((((((.((..((((....((((.((((((((..(((((((.((..((((((((((((...(((((((..((((((......(((...........)))((..(((.......))).))....(((((((...(((....(((((.(((.....((((.((.((((((...........((.((...((((...(((((....))))).....)))).)).)).......((((...((((((.((......(((((..(..(((((((((((((.((((((((((((.((.((((((((..........)))))))).)).....))))))((((((((((.(((.(((.((.((((.........(((((..(((.(((((((...(((...))).)))))))..))).)))))...(((((((...((((((..((.....))..)))))).))))))).......)))).))))))))..))))))(((.....(((.((.(((((((...)))))))))))).....)))..........))))(((((((((..................)))))))))..(((.((.(((((((.(((......))).)))))))...)).)))..)))))).))))).....................))))))))..)..)))))((((........))))))))))))...)))).)))))))))))).....)).).)))))..)))...)))))))....)))))).))))))).((((((((((....))))))..))))..)))))).))))))....)).).))))))(((((..((((..(((((...)))))..))))...))))).((((..(((..(((((....))))).))).)))).....)))))))).)))).(((((((.((.((............)))).)))))))))))..)).)))))).)))))).....)))).))))))..))))).))))))))))))..))))))))).((((..(((((((((.......)).))...)))))..))))...))))..))))((.(((((.(((........))).)).))).))...(((((...))))).)))))))))))...)))).)).)..))..))..((.((..((((((((.....)))))))).))))(((...(((((.((((......((((((((...(((((.(((((.(((((((((((.((((((..(((.((........)).))))))))).)....((((((((((((((.....))))))))))))))).)))))))))(((.....)))))))).)))))...)))))))).....)))).))))).)))...((((((..(((.......)))....)))))).)))))))...(((....)))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((({,{.((((((((.((((.((((((,,(((({({{{{.,{{{{(((((((....,{(((.(((..((.{((.(.(((((,.......))))).},})),})....)))))))...)))))))|{{{.....}}}}(((((.{,.,.,,,{|,(((((((((........((((..(((.(((((.(((((..,,((((((...((((((((((({....}))..))))).....((((({{{((((((((........)))).((((({{((((((.....((........))...)))))))))))))))))))),,))((((((.(((.....(((.((........)).)))...)))..,.))))))((((((((((((.((..((((....((((.((((((((..(((((((.((..((((((((((((...(((((((..((((((....,.(((...........})){{..(((,......)}),),....(((((((...(({..,.(((((.(((.....((({{{(.((((((.....,{,..,{{.,,...|||||..(((((....))))).....|}}}.,),}|.......((({...((((((.({......(((((..(.,(((((((((((((.((((((((((((.,(,((((((((..........)))))))}.)),....))))},(((({(((({{(((,{{(,{({{{{{.......}}{||{,,}|||.{{{((({,,,({(,,.|||{|||}}}}..|||.|||||{,.(((((((.{.{(((((..((.....))..))))))})))))))..,.,,.}))).}}}}}}}),.))||||(.....}}|||,{|,|||||{|...})))))))))))},}}}))),..,.,}}..))))(((((((((..................)))))))))...,(.((,(((((((.(((......))).)))))))}}.},.,,...}})))}.))))}...|,.,,,.....,}},...)))))))),.)..)))))(((({,...,}.))))))))))))...)))).)))))))))))).....)).).)))))..)))...))))))),,..)))))).))))))).((((((((((....))))))..))))..)))))).))))))....)).)}})))))(((((..((((..(((((...)))))..))))...))))).((((..(((..(((((....))))).))).)))).....)))))))).)))).(((((((.((,,{,......,,|..}})).)))))))))))..)).)))))},)))))).....)))).)))))).}))))).))))))))))))..))))))))).||,,..||{|||||{......,||,||,,{|||||{.||,)..},||,....}}((.(((((.(((........))).)).))).))..,|}|||,.,)),)).)))))))))))...)))).)).{..,||..,,.((.((..((((((((.....)))))))).))})||}...(((((.((((......((((((((...(((((.(((((,((((((((({(.((((((..(((.((........)).))))))))).}..,.((((((((((((((.....)))))))))))))).,)))))))))|{{.....}}}))))).)))))...)))))))).....)))).))))).,{{{{.,(((((.....)))))..))),.))))))))))))))))...(((....)))......
Back