Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001321605.2

Sequence Length

1785 nt

GC Content

0.5966

AGAGAAGGACUCGGAGCGCACCGGAGUGGUCCGCUGGGAUGCUGGGGACAUGGGGGUCAAGGGGGAGACGGAGACAGAGAGAGGGGUAUUGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGUUAAGAGACUGAGCGCGAUGGAGAAAGGGAAACUUGAGAAAGGCAGAAGGAGAUGGAGAGAAGAGAGAGGGAGAUGCGGGUGCCCGUGAACACCGGGAGAGAAUCUUGCAUGGAGUUUGAAAAGGGAUAGACGUAGAAAGGUGGAAAGAGAUUAGGAGAGGUCUCCUUCUGAGCCCAGAGAGUGGACAAAAAGUGGAGGGACCUUCAGAGAGACCCCUGAGAGGGACAAAGAUAGGAGGGACUGAGACAGAGGCCCUCAGGGAGUCUGAAAGGGACCGCAGGGGAGGCGGAUGGAUGAGAAGUCCUGAGGAUCAGGAAACAAGGACAGCACAGGGCUGCAGCAGAAGAGACACAGCGUUAGCUACAGAGUGCUGGGAGGCAGAAAGGAGGUGCCAGUGUCCUCAGCCUGCGGGGGCUGCGUGGAGGUGGACUCGGAGACCGAGGCCGUGUAUGGGAUGACCUUCAAAAUUCUUUGCAUCUCCUGCAAGCGCCGCAGCGAGACCAACGCUGAGACCUUCACCGAGUGGACCUUCCGCCAGAAGGGCACUGAGGAGUUUGUCAAGAUCCUGCGCUAUGAGAAUGAGGUGUUGCAGCUGGAGGAGGAUGAGCGCUUCGAGGGCCGCGUGGUGUGGAAUGGCAGCCGGGGCACCAAAGACCUGCAGGAUCUGUCUAUCUUCAUCACCAAUGUCACCUACAACCACUCGGGCGACUACGAGUGCCACGUCUACCGCCUGCUCUUCUUCGAAAACUACGAGCACAACACCAGCGUCGUCAAGAAGAUCCACAUUGAGGUAGUGGACAAAGCCAACAGAGACAUGGCAUCCAUCGUGUCUGAGAUCAUGAUGUAUGUGCUCAUUGUGGUGUUGACCAUAUGGCUCGUGGCAGAGAUGAUUUACUGCUACAAGAAGAUCGCUGCCGCCACGGAGACUGCUGCACAGGAGAAUGCCUCGGAAUACCUGGCCAUCACCUCUGAAAGCAAAGAGAACUGCACGGGCGUCCAGGUGGCCGAAUAGCCCUGGCCCUGGGCCCCGCCUCAAGGAAGAGCCAGCCGUAAUGGGGACUCUCCAGGCACCGCCUGCCCCCAGCGUGGGGGUGGCCACUCCUGGGCCCCAGAAAGCCUCAGAGUCCUGCCGACGGAGCCACUGGGGUGGGAGGGGGCAGGGGGCUUGGCUCGCACCCCCACUUUCGCCUCCUCCAGCUCCUGCCCCGCCGGCCGCGCACCGCCAUGCAUGAUGGGUAAAGCAAUACUGCCGCUGCCCCCACCCUGCUUCUGCUGCCUGUUUGGGGAGGGGGGCGGUGAGGUGGGGGCAGCGGCCCCGCACCCCUCCUCCUUGCUGAUUUGCACACAUUGGCCGCUUCAGACACGCACUUCUGGGGCCAGCCCCUCCCCGCCUCCUCCCUGCCUGGCGGCAGGGGUCGCGAUGAUGGGCUGGAGCAGUUUGGGGCAGGGGGUUCUGGGACCCACUCCGACUCCCCCUCCCCGGCAUCAUUUCCCCUCCCGCUUCCUCCGGCUGGACCUGGGGUCCCCCCUCCCUGUAAUGCACUCCUGCCCCGGCCCAACCUCGCCCUCUCUCACCAGCCUUGAACUGUGGCCACCUAGAAAGGGGCCCAUUCAGCCUCGUCUCUUUACAGAAGUAGUUUUGUUCAUGAAAUAAAGACUCUUGGACUUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-712.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -744.56

Frequency: 0.0000

Diversity: 308.75

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((((....(((.(((......))).)))(((((((.(..((((.(..(((((((..((((.(...((((((((.(.((((((..........................((((....)))).(((.((..(((..(((.....))).....((((((.(((((.(((.(((..(((.(((((.(.((((((..((((.......)))).....(((.(((((((.(((((........))))).......((((..........((((((((.((..(((((.((((((.((((((.......(((((((..((((.....(((((((((((.((........(((......))).........))))))))).))))..))))..))..((((.((((((.((((((.....((((((...))))))........((((((..(((((..((............))..))))).....))))))...((((....((((((..((((((.(((.((.(((((.(..((((.((((..((.(((((...))))).))(((((.(((((..........))))).)))))))))))))..).))))))))))....))))))..)))))).((((((((.(((((.....)))))....((((((....(.((.(((((((((..........((((((((.((.((......)).))))))))))..(((((.((.(.(((......))).))).))).)).......))))))))))).)..))))))...................)))))))).((....))..)))).)))))))))))).))))(((((.......((((((.........)).))))...)))))))))).((((((..((((.(((.((((.(((.((....((((.(((((((........))))))).))))..)).))))))).))).)))).....(((((((.(((.((((((.((......)).)))))))).).)))))))....((((.((.(((.((..(((..((....)).)))..)).))).))..))))............((((.(((((((..((((........)))))))))))))))))))))(((.(((((..((.....)))).))))))((((...))))(((((((...)))))))..))))))))))))..)))))))))))....))))((((.(((.((....(((((.(((((((((((((((..((.....)).)))).))...))))))))).))))).)).))).))))....)))).))))))).))).((((......))))(((((((((((((((((((((((.((.(((....))).))))))))))...))))))))))))))))))))))))))))))..(((......)))......(((.((((((((........))))))))..))).))).))).)))))..))))))(((((.(((((....((((((((((((...)))))(((((.((((((...((((......))))...))))))))))).))))))).))))).))))))))..)))))(((((...))))))))))))))))......))))).)))))))))..))..)))))..))).))))).(((((.((.((((.(((....)))))))))))))))))..)))))......(((.((((((............)))))))))........

Thermodynamic Ensemble Prediction

{(((((((....(((.(((......))).)))(((((((.{..((((.,..(((((((..((((,({..({{{((((.(.((((((..,(((((.{{,..............((((....)))).,{{{{{..((({...(({{,.|||.....|{(({{.{((((.{((.({{..({(.(((((.(.((((((..((((.,....,)))).....(((.(((((((.(((((........))))).......((((....,...,,{(((((((.{{..(((((.((((((.((((((.{.....(((((((..((((({{,.,,,{(((((((.((........(((......))).........))))))))).})))),))))..))..((((.((((((.((((((.....((((((...))))))........((((((..(((((..((.,........,.))..})))).....))))))...(((,....((((((..((((((.(((.(,{(((((.(.,((((.((((,,((.(((((...))))).)){{(((.(((((..........))))).))))))))))))).,).))))))))))....))))))..)))))).((((((((.(((((.....)))))....((((((,...(.(,{(((((((({.........,((((((((.{{.((.....,),.}})))))))),.(((((.((.(.(((......))).))).))).)).......})))))))))).)..})))),,,.....,||.....,,..)))))))),{,....,,,})))).)))))))))))).))))(((((.......((((((.........)).))))...)))))))))).{((((({.((((.((,.((({,(((,((,,,,((({.(((((((,,...,..))))))).)))).})).}}))))).,)).)))).,|,|{((((((.({(.((((((.((......)).)))))))).).)))))}},}.,{(((.({.(((.((..(((..({....)).)))..)).))).))..}}}}........,...{(((.(((((({.{((((........))))))))))))))))))))}((,,((({(..((,...,)))).))))))((((...))))(((((({...})))))),,))))))))))))..)))))})))))....))))((((.(((.((....(((((.((((((((({(((((..{(.....)}})))).,,...))))))))).))))).)).))).))))....)))).))))))).))).((((......))))(((((((((((((((((((((((.((.(((....))).))})))))))...)))))))))))))))))))))))))))))),}|{|,..,,,}),......{||.((((((((........)))))))){{|||{,||.,||{,,|}|{{{||||....}}))))})..))},,||,|}||||...}}}}|{((((.((((((...,(((......)))),..)))))))))))}),))})))))))))))))))})))))}..(((((...))))))))))))))))......))))}.)))))))))..))..,))))..})).))))).,((((.((.((((.(((....)))))))))))))))))..)))))...,..{{{.{{{{{{{((,.....,,.}}}}}))}),,,,....