Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001322794.2
Sequence Length
5777 nt
GC Content
0.3895
AUGCGCAGUGCGCAGGGCCGGCUCGAAGCGCAAGCAGGAAGCGUUUGCGGUGAUCCCGGCGACUGCGCUGGCUAAUGCGGUACCGGCUAGCGUGGCUUCUGCACCCCGCACUGCCCAGCACCUUCCGCUCAGUCCUCGGCGCCCGCCUGCCGCCUCCGGAGCGCCUGUGUGGUUUCCAAAAAAAGACUUACAGCAAAAUGAAUAAUCCAGCCAUCAAGAGAAUAGGAAAUCACAUUACCAAGUCUCCUGAAGACAAGCGAGAAUAUCGAGGGCUAGAGCUGGCCAAUGGUAUCAAAGUACUUCUUAUCAGUGAUCCCACCACGGAUAAGUCAUCAGCAGCACUUGAUGUGCACAUAGGUUCAUUGUCGGAUCCUCCAAAUAUUGCUGGCUUAAGUCAUUUUUGUGAACAUAUGCUUUUUUUGGGAACAAAGAAAUACCCUAAAGAAAAUGAAUACAGCCAGUUUCUCAGUGAGCAUGCAGGAAGUUCAAAUGCCUUUACUAGUGGAGAGCAUACCAAUUACUAUUUUGAUGUUUCUCAUGAACACCUAGAAGGUGCCCUAGACAGGUUUGCACAGUUUUUUCUGUGCCCCUUGUUCGAUGAAAGUUGCAAAGACAGAGAGGUGAAUGCAGUUGAUUCAGAACAUGAGAAGAAUGUGAUGAAUGAUGCCUGGAGACUCUUUCAAUUGGAAAAAGCUACAGGGAAUCCUAAACACCCCUUCAGUAAAUUUGGGACAGGUCGAGAAUCUUUAGAUGACUUGACUAAUCUGGUGGUAAAGUUAUUUUCUGAAGUAGAGAACAAAAAUGUUCCAUUGCCAGAAUUUCCUGAACACCCUUUCCAAGAAGAACAUCUUAAACAACUUUACAAAAUAGUACCCAUUAAAGAUAUUAGGAAUCUCUAUGUGACAUUUCCCAUACCUGACCUUCAGAAAUACUACAAAUCAAAUCCUGGUCAUUAUCUUGGUCAUCUCAUUGGGCAUGAAGGUCCUGGAAGUCUGUUAUCAGAACUUAAGUCAAAGGGCUGGGUUAAUACUCUUGUUGGUGGGCAGAAGGAAGGAGCCCGAGGUUUUAUGUUUUUUAUCAUUAAUGUGGACUUGACCGAGGAAGGAUUAUUACAUGUUGAAGAUAUAAUUUUGCACAUGUUUCAAUACAUUCAGAAGUUACGUGCAGAAGGACCUCAAGAAUGGGUUUUCCAAGAGUGCAAGGACUUGAAUGCUGUUGCUUUUAGGUUUAAAGACAAAGAGAGGCCACGGGGCUAUACAUCUAAGAUUGCAGGAAUAUUGCAUUAUUAUCCCCUAGAAGAGGUGCUCACAGCGGAAUAUUUACUGGAAGAAUUUAGACCUGACUUAAUAGAGAUGGUUCUCGAUAAACUCAGACCAGAAAAUGUCCGGGUUGCCAUAGUUUCUAAAUCUUUUGAAGGAAAAACUGAUCGCACAGAAGAGUGGUAUGGAACCCAGUACAAACAAGAAGCUAUACCGGAUGAAGUCAUCAAGAAAUGGCAAAAUGCUGACCUGAAUGGGAAAUUUAAACUUCCUACAAAGAAUGAAUUUAUUCCUACGAAUUUUGAGAUUUUACCGUUAGAAAAAGAGGCGACACCAUACCCUGCUCUUAUUAAGGAUACAGCUAUGAGCAAACUUUGGUUCAAACAAGAUGAUAAGUUUUUUUUGCCGAAGGCUUGUCUCAACUUUGAAUUUUUCAGCCCAUUUGCUUAUGUGGACCCCUUGCACUGUAACAUGGCCUAUUUGUACCUUGAGCUCCUCAAAGACUCACUCAACGAGUAUGCAUAUGCAGCAGAGCUAGCAGGCUUGAGCUAUGAUCUCCAAAAUACCAUCUAUGGGAUGUAUCUUUCAGUGAAAGGUUACAAUGACAAGCAGCCAAUUUUACUAAAGAAGAUUAUUGAGAAAAUGGCUACCUUUGAGAUUGAUGAAAAAAGAUUUGAAAUUAUCAAAGAAGCAUAUAUGCGAUCUCUUAACAAUUUCCGGGCUGAACAGCCUCACCAGCAUGCCAUGUACUACCUCCGCUUGCUGAUGACUGAAGUGGCCUGGACUAAAGAUGAGUUAAAAGAAGCUCUGGAUGAUGUAACCCUUCCUCGCCUUAAGGCCUUCAUACCUCAGCUCCUGUCACGGCUGCACAUUGAAGCCCUUCUCCAUGGAAACAUAACAAAGCAGGCUGCAUUAGGAAUUAUGCAGAUGGUUGAAGACACCCUCAUUGAACAUGCUCAUACCAAACCUCUCCUUCCAAGUCAGCUGGUUCGGUAUAGAGAAGUUCAGCUCCCUGACAGAGGAUGGUUUGUUUAUCAGCAGAGAAAUGAAGUUCACAAUAACUGUGGCAUCGAGAUAUACUACCAAACAGACAUGCAAAGCACCUCAGAGAAUAUGUUUCUGGAGCUCUUCUGUCAGAUUAUCUCGGAACCUUGCUUCAACACCCUGCGCACCAAGGAGCAGUUGGGCUAUAUCGUCUUCAGCGGGCCACGUCGAGCUAAUGGCAUACAGGGCUUGAGAUUCAUCAUCCAGUCAGAAAAGCCACCUCACUACCUAGAAAGCAGAGUGGAAGCUUUCUUAAUUACCAUGGAAAAGUCCAUAGAGGACAUGACAGAAGAGGCCUUCCAAAAACACAUUCAGGCAUUAGCAAUUCGUCGACUAGACAAACCAAAGAAGCUAUCUGCUGAGUGUGCUAAAUACUGGGGAGAAAUCAUCUCCCAGCAAUAUAAUUUUGACAGAGAUAACACUGAGGUUGCAUAUUUAAAGACACUUACCAAGGAAGAUAUCAUCAAAUUCUACAAGGAAAUGUUGGCAGUAGAUGCUCCAAGGAGACAUAAGGUAUCCGUCCAUGUUCUUGCCAGGGAAAUGGAUUCUUGUCCUGUUGUUGGAGAGUUCCCAUGUCAAAAUGACAUAAAUUUGUCACAAGCACCAGCCUUGCCACAACCUGAAGUGAUUCAGAACAUGACCGAAUUCAAGCGUGGUCUGCCACUGUUUCCCCUUGUGAAACCACAUAUUAACUUCAUGGCUGCAAAACUCUGAAGAUUCCCCAUGCAUGGGAAAGUGCAAGUGGAUGCAUUCCUGAGUCUUCCAGAGCCUAAGAAAAUCAUCUUGGCCACUUUAAUAGUUUCUGAUUCACUAUUAGAGAAACAAACAAAAAAUUGUCAAAUGUCAUUAUGUAGAAAUAUUAUAAAUCCAAAGUAAAUUACAAAAUCUUAUAGAUGUAGAAUAUUUUUUAAAUACAUGCCUCUUAAAUAUUUUAAAAUUUUUCUUUUGAUUACUGAGAGAAAUUUCCCCAAUAUAACAAUGCUUAAAAUGAAUGAUAUUCCUAUAGAAUCUUCCUUCCCUAUUCUGUAAAAUAGUCACUUGUCCGAAGAAAGUUAAAAGUUAGCUCUUUUCUAAAAGCCUCCUAGCUUGACAUAGAAGGCUUCACAACAUUUAGAAAGGUAAUAACUUUUUAAAAAUUGAUCCUCAAAUUUGCUUUCUACUUGAUGGUUUCAUGUAAAUCAGUGGAAAACAUUACAUUUGGCAGAUGAUAAAGCAAUGUCAUCUUUUAUUAGUGAAAUGCUGGUUAUAUAAGGCAUGGUUUUAAUCUUUUUAUAAAAUUUGAACAUGUUUUUUAUGCCAACUCGUAAAAUGCUAGAAAACCCUACUUAUUUACAAUGCUAGAAAUACAGACUUACCUUACAUCAAUUUUGUCCUAAACCGAAUUUCUCAGGAUUACUGUGGUUUCUUUCAUUCUGAUUGAAUUAUAUUGACCUACUUCUUCAUAGUUGGUUUGCAGUGUUCCAUGAGUUUUACUUUUCCUCAUCAACAUAUUGCUUUAACACAACAUAUUUAUUUAACACGUACAAAUAGGGUCAACUUCAGAUCCUACUGAGUGUGUGACAUGCUUUUCCAACAUCAGCUUUUUGUAACCACCUGUAUAACUUUUUAUUACAGUGAAAUUGCAGUCAGUAUGUGAACCAAAAUAUCUUGCCCCUUUAUGAAUUUAAAAGGCAGCCAAUACAAAGCCACCUUUUUGGAAAUAUAAAAAGUAAAGCCUUGCAUUCUUAUAUAGCAGGUCUUCAUAAAACUCUAAAAUCCCUUGUUGCUACCAGUCUAAUCUUGCCUUAAAUGUUAAGUUAUUUUUUGAAUAUAUAAAUAUAAACAUAUAAACACAGAUGAUGACUGGAGUAGACUUUUAAAAAAAUAUUUUUUUCAUGAGAUACUAUUUUAGGUGAAAUUGUUACUGUAGAUUUAACAGCUGUUUUGAAAUAUUUACUGUUAUUAAAACUUGCUUCAAGAGAAAUUGUGAAUAUAUUUCCAUAUACAAGCACUAGUAACAGUAAGUGGCCCUGUCAUCCACUAACUCAGGCAAAGUAAAGAAUGGCAUUUUUGAAGGACAUUUUACCUCCCCAUAUGAUUUGAUUGGCUAGGACUUUCUUCUGUAAAGUCAUACCUUUUCACAUCUUAAGUUUUUACAUUUGCCAUUUUCCAAAUCUCAAUUUUGGGCAAGAACGAUAUAGUCACAACUAUGGGGCUGCUUUCAAAAGCGGGGCUCCAUUUCUACUGUCAGAUCAAUGUGGUGCUGUAACCAUCUUUUUAUCCCUACCUUCAAGAACCUCCUUAUAUGAAGCCUGUCUUUAUCCAUCAGAAGGUGUGUGAAAUCAUCACUUCCUUCUGGUUUUAUGUAUUUGUAGACUAUGCAGCUUUUCAUUAAACUGCAAGUAUAUACAAGACAGAUCUGAAAUUAGGCCUGAGUGUUCCGAUCCACCACUGUACUAGUAAAUAAAAAUCCACCUACCUUUUAUGUGGAAAAUUAUGUGCUAUUGAGUAACUUUUAGCUCUUUUUUAAAAAAUGGGUGAAAUUUAAGUGUCUUUUUUAUGAGAAUGACACAUGAAGAGAUCUGAGAGCAAUCUCAUGUAGUCUUCCAUGAACCUGCAAUUGUUUGGUAUGCGUCAGCAUUUUCCAAUUUCCAGGUUGGAUCUAGAGCUGCUGUUGAUCACUCAGGCAUACUAAUGGAUUCAUUUAGAUGGGUCCAA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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1496.92 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1605.89
Frequency: 0.0000
Diversity: 1307.45
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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