Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001322965.2

Sequence Length

2034 nt

GC Content

0.4095

GUUGCGCUUCAUAGACGCCGCGUGUACCCGGUUGUCCUCAGGCGCUAUCUGUGGUUUUUCUACUUGAAGGACACAAUGUUUUCCAAACUAGCACAUUUGCAGAGGUUUGCUGUACUUAGUCGCGGAGUUCAUUCUUCAGUGGCUUCUGCUACAUCUGUUGCAACUAAAAAAACAGUCCAAGGCCCUCCAACCUCUGAUGACAUUUUUGAAAGGGAAUAUAAGUAUGGUGCACACAACUACCAUCCUUUACCUGUAGCCCUGGAGAGAGGAAAAGGUAUUUACUUAUGGGAUGUAGAAGGCAGAAAAUAUUUUGACUUCCUGAGUUCUUACAGUGCUGUCAACCAAGGGCAUUGUCACCCCAAGAUUGUGAAUGCUCUGAAGAGUCAAGUGGACAAAUUGACCUUAACAUCUAGAGCUUUCUAUAAUAACGUACUUGGUGAAUAUGAGGAGUAUAUUACUAAACUUUUCAACUACCACAAAGUUCUUCCUAUGAAUACAGGAGUGGAGGCUGGAGAGACUGCCUGUAAACUAGCUCGUAAGUGGGGCUAUACCGUGAAGGGCAUUCAGAAAUACAAAGCAAAGAUUGUUUUUGCAGCUGGGAACUUCUGGGGUAGGACGUUGUCUGCUAUCUCCAGUUCCACAGACCCAACCAGUUACGAUGGUUUUGGACCAUUUAUGCCGGGAUUCGACAUCAUUCCCUAUAAUGAUCUGCCCGCACUGGAGCGUGCUCUUCAGGAUCCAAAUGUGGCUGCGUUCAUGGUAGAACCAAUUCAGGGUGAAGCAGGCGUUGUUGUUCCGGAUCCAGGUUACCUAAUGGGAGUGCGAGAGCUCUGCACCAGGCACCAGGUUCUCUUUAUUGCUGAUGAAAUACAGACAGGAUUGGCCAGAACUGGUAGAUGGCUGGCUGUUGAUUAUGAAAAUGUCAGACCUGAUAUAGUCCUCCUUGGAAAGGCCCUUUCUGGGGGCUUAUACCCUGUGUCUGCAGUGCUGUGUGAUGAUGACAUCAUGCUGACCAUUAAGCCAGGGGAGCAUGGGUCCACAUACGGUGGCAAUCCACUAGGCUGCCGAGUGGCCAUCGCAGCCCUUGAGGUUUUAGAAGAAGAAAACCUUGCUGAAAAUGCAGACAAAUUGGGCAUUAUCUUGAGAAAUGAACUCAUGAAGCUACCUUCUGAUGUUGUAACUGCCGUAAGAGGAAAAGGAUUAUUAAACGCUAUUGUCAUUAAAGAAACCAAAGAUUGGGAUGCUUGGAAGGUGUGUCUACGACUUCGAGAUAAUGGACUUCUGGCCAAGCCAACCCAUGGCGACAUUAUCAGGUUUGCGCCUCCGCUGGUGAUCAAGGAGGAUGAGCUUCGAGAGUCCAUUGAAAUUAUUAACAAGACCAUCUUGUCUUUCUGAGGGUAGCCAGCUGUUUUCAGUGGUCCCUGGGAGCCAGCUGGAGACAGGUGGUCCUGUAAAAGCUUUAUUCCUAAUGUGGGCACAUUCCACUCCCAUGAGUCUUCAAAAACUUUUUUUUUGAAUAUAUUUUUUUCAGUUGAUACAUAAUAGAACAACGUUUAUGAACCUGCCGUUUGCUUUGUAACGUAACUAAAUAAUGUAAUGGCAUCUAUAUUCAGUUGAAGUGUUUUGAUGUGCAUGUGUACUUCCUAAGGUGAAAUGCAUCUAUAUACAGACAGCCUCUAAAUCAAGUCCUUCAGUAUAAUUGAUAUAUGUUUUUAUAAUUUCCUCACUGGUAUAAGUGUUUCAUAUUUGAAAAAGUUAUCUCUGGGUAUUGCAUAAAAGGCUUCAUCUUAUAAAGUGAAAUCAUUGUUAUUGAAUUUUAGGAAGGAUUAAUGGUUAAGUGUAUAUAAAAUACUAAUAUUAAGUAAACUUCAUAUUGGCCAACACCAGGGUUGUAUUCUAUGGAUGUCAUUAUUUUGAAUUAAGAAUUAGUGUUUAACAUUCCUAAAUUGUUUUGAGUGCUUGAUUAUAAUUUGUAAAAAAUGUUUAUUUUCAAUACUUCUUUAAAUUUAAAAUAAAGCUUAUAUUUCAAAUGUC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-558.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -598.19

Frequency: 0.0000

Diversity: 668.85

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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