Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001322974.2

Sequence Length

1925 nt

GC Content

0.4109

GUUGCGCUUCAUAGACGCCGCGUGUACCCGGUUGUCCUCAGGCGCUGUCAGGUAUUUACUUAUGGGAUGUAGAAGGCAGAAAAUAUUUUGACUUCCUGAGUUCUUACAGUGCUGUCAACCAAGGGCAUUGUCACCCCAAGAUUGUGAAUGCUCUGAAGAGUCAAGUGGACAAAUUGACCUUAACAUCUAGAGCUUUCUAUAAUAACGUACUUGGUGAAUAUGAGGAGUAUAUUACUAAACUUUUCAACUACCACAAAGUUCUUCCUAUGAAUACAGGAGUGGAGGCUGGAGAGACUGCCUGUAAACUAGCUCGUAAGUGGGGCUAUACCGUGAAGGGCAUUCAGAAAUACAAAGCAAAGAUUGUUUUUGCAGACUGUGUCCAGUCUCUUUCUUAAUAGCAAAGGGUGCAAAGAUGUUUUCACCUGAGUAUUGAAAGAAGCUGGUGAGUCAGUGGGGUGGAGAGACAGAGGAAGACUGUCCCUAACUCUGGGAACUUCUGGGGUAGGACGUUGUCUGCUAUCUCCAGUUCCACAGACCCAACCAGUUACGAUGGUUUUGGACCAUUUAUGCCGGGAUUCGACAUCAUUCCCUAUAAUGAUCUGCCCGCACUGGAGCGUGCUCUUCAGGAUCCAAAUGUGGCUGCGUUCAUGGUAGAACCAAUUCAGGGUGAAGCAGGCGUUGUUGUUCCGGAUCCAGGUUACCUAAUGGGAGUGCGAGAGCUCUGCACCAGGCACCAGGUUCUCUUUAUUGCUGAUGAAAUACAGACAGGAUUGGCCAGAACUGGUAGAUGGCUGGCUGUUGAUUAUGAAAAUGUCAGACCUGAUAUAGUCCUCCUUGGAAAGGCCCUUUCUGGGGGCUUAUACCCUGUGUCUGCAGUGCUGUGUGAUGAUGACAUCAUGCUGACCAUUAAGCCAGGGGAGCAUGGGUCCACAUACGGUGGCAAUCCACUAGGCUGCCGAGUGGCCAUCGCAGCCCUUGAGGUUUUAGAAGAAGAAAACCUUGCUGAAAAUGCAGACAAAUUGGGCAUUAUCUUGAGAAAUGAACUCAUGAAGCUACCUUCUGAUGUUGUAACUGCCGUAAGAGGAAAAGGAUUAUUAAACGCUAUUGUCAUUAAAGAAACCAAAGAUUGGGAUGCUUGGAAGGUGUGUCUACGACUUCGAGAUAAUGGACUUCUGGCCAAGCCAACCCAUGGCGACAUUAUCAGGUUUGCGCCUCCGCUGGUGAUCAAGGAGGAUGAGCUUCGAGAGUCCAUUGAAAUUAUUAACAAGACCAUCUUGUCUUUCUGAGGGUAGCCAGCUGUUUUCAGUGGUCCCUGGGAGCCAGCUGGAGACAGGUGGUCCUGUAAAAGCUUUAUUCCUAAUGUGGGCACAUUCCACUCCCAUGAGUCUUCAAAAACUUUUUUUUUGAAUAUAUUUUUUUCAGUUGAUACAUAAUAGAACAACGUUUAUGAACCUGCCGUUUGCUUUGUAACGUAACUAAAUAAUGUAAUGGCAUCUAUAUUCAGUUGAAGUGUUUUGAUGUGCAUGUGUACUUCCUAAGGUGAAAUGCAUCUAUAUACAGACAGCCUCUAAAUCAAGUCCUUCAGUAUAAUUGAUAUAUGUUUUUAUAAUUUCCUCACUGGUAUAAGUGUUUCAUAUUUGAAAAAGUUAUCUCUGGGUAUUGCAUAAAAGGCUUCAUCUUAUAAAGUGAAAUCAUUGUUAUUGAAUUUUAGGAAGGAUUAAUGGUUAAGUGUAUAUAAAAUACUAAUAUUAAGUAAACUUCAUAUUGGCCAACACCAGGGUUGUAUUCUAUGGAUGUCAUUAUUUUGAAUUAAGAAUUAGUGUUUAACAUUCCUAAAUUGUUUUGAGUGCUUGAUUAUAAUUUGUAAAAAAUGUUUAUUUUCAAUACUUCUUUAAAUUUAAAAUAAAGCUUAUAUUUCAAAUGUC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-545.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -585.08

Frequency: 0.0000

Diversity: 630.99

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

...((((((....(((((((........))).))))...)))))).(((((((((((((....(((((((.(((.((..((((((...((((.(((..((.....((((((((.(......).)))))))).........((((((((.(((((((((.(((((.........))))))))......)))))).))).))))).(((..(((((((....((((((((.((....)).))))))))(((((((...(((((((((((.((((..((((((((((..((.((.((((((((((....((((((.......))))))..((.....))((.((((((((.((((.(((((((...))))))).(((((....)))))((((((..((((.....(((((.(((....))).)))))...))))))))))((((((((.(((.((((((((((((..((((.((....(((((...((((((((....)))))))).))))))).))))...)))))).)))))).))).).)))))))..((((((((((..............((((((((..(((((((((....(((...((.(((......))).))...)))((((((.((((((.((((.(((((....(((....)))...))))))))).))....))))..)))))).(((((((.....((((.(((((((((.(((.....)))...)))))))........(.((((...((((.(((.(((.((((....)))).)))..))).))))...)))).)....(.(((((((((((..(((..((.(((..((((((((...))))))))...(((..((((((((....((((((.....(((.(((((((..((.........))..))))))))))))))))(((((((....((((.((...)).)))))))))))((((....((((((((........))))))))))))....))))))))....)))((((((((((((..(((....))).....((((((((((((((.(((((.((......))....((.((.((((..((....))..))))..)).))..)).))).)))).)))))))))).(((...)))))))))))))))......((((...))))..))).)).)))..))))))))))))))))))...))))))).))).))))))...))))..))))..............)))))))))))))).)))))))).))..((((((((((((((......))))))).)))))))..)))))))))))).))....))))))))))...(((((.....)))))...((((.....(((((((((((....(((((((((................(((((..(.....)..)))))....(((((((.((.((((...........)))).)))))))))..)))))))))..))))).))))))....))))..(((((..((((((((......(((......))).(((((......(((..(((..((.((((((..((((......)))).......((((......))))(((((....))))).))))))))..)))..)))......)))))))))))))..)))))...(((.......))))))))))))))))))..))))..)))............(((((((.(((....))).)))))))....)))))))..)))...))..))).)))).)))))).............)).))).)))))))......))...)))))))))))....(((((.........((((((((.(((..........))).))))))))..........)))))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

...((((((....(((((((.{......))),,)))...)))))).((((((((((((((((((((({((,((((,((((,....,}}}|,|}}|{{{,,,,,,.{(((((((.{......}.)))))))|{{{,,...,{((({(({.(((((((((.(((((.,.......))))))))......}))))).))).)))}}......,,{{(({....((((((((.{,....,}.))))))))..}}}}}....((((,.,,,,.||||.,(((({(((({{(((,((.((((((((((....((((((.......))))))..((.,,..||((,,(((({{{.{{{,.(((((({...))))))),(((((....)))))|(((((..((((.,...(((((.(((....))).)))))..,)))))))))}((((((((.(((.((((((((((((..((((.((...,{((((.,.((((((({....}))))))),))))))).))))...)))))).)))))).))).),}))))))..((((((({{{,,,,,,,......,((({{{{{..((((({{{{....|||,,.{|||{{,,.||,|}||||,},}}}{{{{((,,,,,{{.((((.|||||,}.,|||},..,},.,,))))})))),)},.,||||},.}}}}}}.{{{,,{(...,|(((({({((({(({,{((,..,,}||,,,||||||}..,,,{.{({.,,....,}}|.|||,,.,|{((|,.,||||,.|,||,||||||}},,,,,,,....,,|||{{{{{{{{{{..{{{..((,(((,,(((((((,...}))))))}...(((..((((((((..,{,(((((,((..{{|,||||(((..{{........,||,.}||||}|}}||||}},|((((({...,|,,,.{||||))||)))))),),))||)),,,((((((((........))))))))}},,....))))))))....)))(({{{(({((({..{{{.,,{|||(({({{{((({{((({((({(,.,,.((......}}....{{.{,.{,,,..{{....))..,},,..,..||,....,}||{.|||||||,,||}},{|{|,,},,}})))))))}))..,..,|{{|,,,)))).,))).)),))),.))))))))},}}}||}}},,.))))}))}})),))}))),,,))),}}))}),,,..........,|||||}}})))))),)))))))),)),,(((|((({{{{|||,,,,,,)))))))}}}}}}))..})))}))))))).}...}))))}})))))...{{|||.....}))))))))))}))}.{(((((((.....}))))))|.,,,.........,,,|,..{,,,,..|,,},|},.},}}},,,,|||{({{,{{.{{||,,,,.......,|||.|||||||||{{{{||,||||{{|||{{.,||{{{{(({(((..,(((({,,..}|}|}..}})}},.((((((((...((((..{.{{((...((((((((((,,(.((((....{{{{{{{{,....,({((..((,(,{{.{.(((((....))))).}.})))),.))))..,,,.,}}}})}}){((({,,,....,))))})))).)..)))))),....)))).,)))),..)))}...)))))))).....{{,||||,|||...,)))})}))))}.{{{|.,..,})}}).....)))))))))))}})},||,...,,}}}}}}}||,,...}))}}},,,,...,,..,)))))))))))....(((((..,...,.,((((((((.{({..........))).)))))))),}.....,,.)))))...