Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001323629.2
Sequence Length
801 nt
GC Content
0.3983
ACUCUUGGCGCCUUCGCGGAAGGUGCGUCCGAGCCAUGGCCGCUGCCAACCCGUGGGACCCGGCGUCCGCGCCUAACGGCGCUGGGCUAGUGCUAGGCCACUUCAUAGCUUCGGGGAUGGUCAAUCAGGAGAUGUUAAACAUGUCUAAGAAAACAGUUUCUUGUUUUGUGAACUUCACCAGACUACAGCAGAUCACAAAUAUUCAAGCUGAAAUCUACCAGAAAAACCUGGAAAUUGAACUCCUGAAACUAGAAAAAGAUACAGCAGAUGUUGUUCAUCCUUUCUUUUUGGAGAUGAAGUCUUGCUAUGUUGCCCAGGCUGGUCUCGAACUCAUGGCCUCAAUUCUCCCGUUUCAGUCUCCCAAAACACUGCGAUUACAGCUCAGAAGUGUCAUACUCUGCAAAGCAUGAAUAAUCAUUUGGAAGCAGUGCUGAAAGAGAAGAGAUCCCUUAGGCAAAGACUGUUGAAACCCAUGUGCCAGGAAAACUUACCUAUUGAAGCUGUUUAUCACAGGUUAGACUGAAAAGUAGAAAUUAACAGUUACACCUGUUUUCUGAGUUUACUUUUUGUUUUGCAGUUACUUUGUAGCAGAAUUCAUAAAACAAUUAGUGAUUGUAUUUGUUAACAUUAUUAAUGGUGAUAUAUUAAAUCAGAAAGAAAAUCUUUGCUUUUAAACCAUUAUACCUAUGGCAAAAAGGAAGAACUUGGCCAUCGUGUUUUGGGAAUUAUAAAUUAUGAGUUUAAUGAAAGAAAUUAGAUCCAUAACAUGUAACAAUAAAAACUGUUUGUAUGUGAAGUAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-202.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -219.79
Frequency: 0.0000
Diversity: 249.38
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((((((((((...))))))))((((.(....((((....)))).....).))))..((((((((((((....))))).))))....))).(((((((((........)))).)))))...)))))).......(((....(((((((....)))))))...)))..((((((((((((..((((.((..........))..)))).......((((......)))).........(((((((((.(((((..((((((((....)))))..))).)))))..((.(((((..(((((.((......))..))))).))))).))...((((((....((((.((.(((((((((.....(((.(((.(((.(((((((((.((.((....((((....(((((......((.....))....)))))...))))........(((..((((......((....)).....))))))).......)))).))).))))))..))).)))))))))))))))...........((((((((...((((((.(((((((......(((..(((((.....))))))))))))))).))))))....)))))))).(((((((.......(((((((......(((((....(((((...)))))...))))))))))))......)))))))..)).))))...))))))...))))))))).(((((..(((((.(((((((.......))))))).)))))..)))))...........)))))...)))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
,{{{,..((((((((...)))))))),.{{{({{{,(((({{..||||.....}})|,|,||||(,{{({{{{...,)))))|||||.,{,||.,(({{{{(((.{{{.{{{||||.,||||{{(,,(((,((((...)))).}}},((({,.,,,|||}}}{{((,((((.,,}}}}.}}},..{{{{.|,,,,,,,,...,,..))))...,,,.((((......))))..,}}},.}))))))}.}}}||,...{{,(((((,,.,}}}}|{{{{{,|,|,,....))|)}})}|||||.||,.,,..))},)))))})||||{{{{.|||||{{,,..((((,{,.(((((((((.....(((.(((.(((.(((((((((.{(,{{,...((((....(((((,.....,{...,,,...,,}))))...)))),.|,..}.{||,.((((.....,{|....,,.,,..))))}))......,,})).))),})))))..))).)))))))))))))))...,},,....((((((((...((((((.((((({{....,{(((..{((((.....))))))))))))))).))))))....)))))))).,{(((({.,,,,..{{|||{{,,,...{{{{{..,,(((({...})))).,,}))}}}|||}}|{{,..,||||}},,,|}.,}},,},}))))).),)),,)))}}..,,,...{((((.(((((((.......))))))).))))|{{||||{((,.......))})}}))))))}))}...
Back