Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001324221.2
Sequence Length
3374 nt
GC Content
0.3811
AACAAAUGUGUCAGUUAUCAGCAGGAUCCAUGCCGCCAGAGUAAAGCUUUCUACCCUUUACUCCCUGCAAAGAAACAAGAGUGCUUAUCCCAGCUAAGCUCCAGGGUAAUGUUAUCAUGACAGCUUCAACUUUUAGACCACAGGCAAAUGCUUUGAACCAUAAAUCCAUGGCUAACCUUGACAAAUACACUGAAACAUUCAAGAUGGGUAGCAACAGUACCAGCACUGCUGAGAUUUACUGUAAUGUCACUAAUGUGAAAUUUCAAUACUCCCUCUAUGCAACCACCUAUAUCCUCAUAUUCAUUCCUGGUCUUCUGGCUAACAGUGCAGCCUUGUGGGUUCUGUGCCGCUUCAUCAGCAAGAAAAAUAAAGCCAUCAUUUUCAUGAUCAACCUCUCUGUGGCUGACCUUGCUCAUGUAUUAUCUUUACCCCUCCGGAUUUACUAUUACAUCAGCCACCACUGGCCUUUCCAGAGAGCCCUUUGCCUGCUCUGCUUCUACCUGAAGUAUCUCAACAUGUAUGCCAGCAUUUGUUUCCUGACGUGCAUCAGUCUUCAAAGGUGCUUUUUUCUCCUCAAGCCCUUCAGGGCCAGAGACUGGAAGCGUAGGUACGAUGUGGGCAUCAGUGCUGCCAUCUGGAUCGUUGUGGGGACUGCCUGUUUGCCAUUUCCCAUCCUGAGAAGCACAGACUUAAACAACAACAAGUCCUGCUUUGCUGAUCUUGGAUACAAGCAAAUGAAUGCAGUUGCGUUGGUCGGGAUGAUUACAGUUGCUGAGCUUGCAGGAUUUGUGAUCCCAGUGAUCAUCAUCGCAUGGUGUACCUGGAAAACUACUAUAUCCUUGAGACAGCCACCAAUGGCUUUCCAAGGGAUCAGUGAGAGGCAGAAAGCACUGCGGAUGGUGUUCAUGUGUGCUGCAGUCUUCUUCAUCUGCUUCACUCCCUAUCAUAUUAACUUUAUUUUUUACACCAUGGUAAAGGAAACCAUCAUUAGCAGUUGUCCCGUUGUCCGAAUCGCACUGUAUUUCCACCCUUUUUGCCUGUGCCUUGCAAGUCUCUGCUGCCUUUUGGAUCCAAUUCUUUAUUACUUUAUGGCUUCAGAGUUUCGUGACCAACUAUCCCGCCAUGGCAGUUCUGUGACCCGCUCCCGCCUCAUGAGCAAGGAGAGUGGUUCAUCAAUGAUUGGCUAAAAUUAAGAUAUCUCUUUAAUUACGCCUUUGUUUACCUACGUUCCUUGUCUUUUUCCAAAGGCCAGAAUUGUCAACCAAUUUCUUUAAUUGAACAUUGUAAAAAACAGGAAUAAGUACUUUUGUGUAAUAUUCACAGUCAACAGGGGUGUGAUGGUGAAGGCAGAGUGUGAAAAACGUGAGAGAGGAAGAGAAAAUAGAUUUACCUGAUUCCUCUUUAAAAUUCAAGCCACUUUCUUAUUUAAGAAACCUAGAUCAAGUUUUUACAGAUGUAAAUAAAAGUUGAAUAGUUUACCUUAAAUUUUUUUCAAUAAGUAAGUUAUUGUUAAUAAUGCACAGUAAAUAUGUGAAUUUUUCCUAGAUGUAAAAAAAAAAAUCUUUCAUAUAAAGACCUUAAAUUCUGAGUGAGAGUAAAAAUGUCUAAUCUUUCUAACAGGUAAAUUUUUCUAACAGGCAAGACAGUGUGAAGAAUUGAAGCAAUAUGUGCAUAAAUUUCAGGACCACAAGCCUGUUAUUAAAGAAAAGGCAUGGAAAUUCAUUCAUUCCUUGAAAAUGUGUUGAGUGCCUAUUGUGUUCUUGGUUGUCACUUUGUUAGGUACUUUCUUUUUUUUUCAUAAGUUAUUGGGGUACAGGUGGUAUUUGGUUACAUGAGUAAGUUCUUUAGUGGUGAUUUGUGAGAUUUUGGUGCAGCCAUCACCCGAGCAGUAUACACUGCACCACAUUUGUAGUCUUCUAUCCCUCGCCCCCUUCCCACUCUUCCACACAUAACAUCUCAUCUUGCCCUCCUAAUAAACCUGUGGAAGUUGCCGAUACAAAUGAAUAAAUGGAACUUCAGAGAGGUUAAGCAAUUUGCCUCAGGAUCAACAGUGGUUAGCCAAAAUUGGUCCAGUAUAAUACACCAUAUAUGCUUAUGUUAUUCCCUUGCUUUUGUUGUUACAUUUAUUAGGUCUAUACUAAAUUAGCCUUCAAUGAUGAAGACAGACUAAAGCUAAGCCACAUGAGAUCAAGGCCAUUUCAACAUGGUUUGCCUGGAAUUCUCCAAAAAACCUGUGGGUUGUGGGUUUGGCAUGUCAAGCUUCAGACCACAAGGUCUUAAGUGGUAAAUAGAUGCGUUGUCCUAAUACUGUUCCAAGGUAGAGAAUCCUGAUGAUAAGGAGUAUAGGAAACUCAAAUAGUUCAUUAUUUCUAAAAAAUGUAUAUUUUAAGGCAUGAUACAAGUCCUACAAACCUCAUAAGUAGGUGAAAAAAAAAACCCUGUGGAGUGAUAAACAUUCUAUAAAACCUGGAAAUUUGUGUGGAGUUCGCCUAAGCUCACUUUUCCUAAAUAUAGCUAUAUAAUAUUGUAAACAAAUUUGUUUUUUAGAAACUUUUAAGAAGAUUUCUGUGAGCGUAAUUGACAAUAUCUGCAUUAGAAACAGAAAGUAUUAUCCAUCAUAAAUAUGAGAAAAGUGUGUGUCCUCUUUCUGACAAUCUUUUUAUCUUAUUUUUUUCAAACGUUGUGGUUGUUGUUUCAGCACCAUUUUAAAGAAUUUGAAUACAAACAAUCCCUCAGCUUAUCAGGUUGACAUUUAUGAAGCUGACCUCAUCACUCUUUAUCUUUUAUGUCUGCAGUAUAAAUAGCAUAGACAUUUGGUGUGAAGGGAGGAGAAAGGAAGUAGUAGUUCUGAGAAUAUUCAUUUGAACAGAGUGACUAUGGAAGAAUGAAUAGCAAAAAAAGGAGAAUUUUUUUAAAAAGAUCUCUCACUGGGAAAAGAAAAAGUUAUGCAUUUAUAAAGUAAUUAAACUGGUUUUCCUUGUACUUUAUUAAUCUGAAUCUAAUGGCACUUCCUUACGAGGGUUUUCAGAUGUGCUUGUAGUUAAUGGCAACAUUAUCAGAAUGACUACACAGACAGUCCUACUCUGAGGAGAUGACUUUGGAAGAAACCCAUUUGGAACUACACACCCUGCUAUGUCUGUGGAGAAAUGGAACUGCAAUCCUCAAGAGUCACACUUCAUAUUCCUUCCUUUCAAGUGGUUGAUAAAAGGUAGUGCUUCAAGCACAGGAUUUAUGGAAUAGUUGGCAAAUUAAACAACAUGCUUUUUAUUUUGACUACCAUUUAAGUGGAAUCUUUGAACUUUUUUUUUGACAUGUGAAUCUCUAAUGUGGUGAGAGAGAAAAACAUAAAAAUAUAAAAACAUUCAAGCAAUCGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-818.24 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -885.67
Frequency: 0.0000
Diversity: 1021.52
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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