Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001329556.3
Sequence Length
1441 nt
GC Content
0.6572
AGGCUGCGGGAAAGCGGUGCGCGUGCAGCGGGGUGGGUGCCCUGGUCCGCGGGCGAGCUCGAGCAGCCAACCCCGGGCGCGUCGGGGCCAUGGACGGCCUGAGGCAGCGCGUGGAGCACUUCCUGGAGCAAAGGAACCUGGUCACCGAAGUGCUGGGGGCGCUGGAGGCCAAGACCGGGGUGGAGAAGCGGUAUCUGGCUGCAGGAGCCGUCACUCUGCUAAGCCUGUAUCUGCUGUUCGGCUACGGAGCGUCUCUGCUGUGCAAUCUCAUCGGAUUUGUGUACCCCGCAUAUGCCUCAAUCAAAGCUAUCGAGAGCCCAAGCAAGGACGACGACACUGUGUGGCUCACCUACUGGGUGGUGUACGCCCUGUUUGGGCUGGCCGAGUUCUUCAGCGAUCUACUCCUGUCCUGGUUCCCUUUCUACUACGUGGGCAAGUGCGCCUUCCUGUUGUUCUGCAUGGCUCCCAGGCCCUGGAACGGGGCUCUCAUGCUGUAUCAGCGCGUCGUGCGUCCGCUGUUCCUAAGGCACCACGGGGCCGUAGACAGAAUCAUGAACGACCUCAGCGGGCGAGCCCUGGACGCGGCGGCCGGAAUAACCAGGAACGUCUUGCAGGUCCUGGCCCGUAGCCGGGCAGGCAUCACCCCGGUGGCUGUGGCCGGGCCCUCCACUCCCCUGGAAGCUGACCUCAAGCCAAGCCAGACCCCGCAGCCGAAGGACAAGUGAAGCAGCCCCCUGAGCCUCACAAGGACCUCCUGGCUGGUGAGGAGGGGGCCGCGCCAGGCUCCCAGGCCUCCACAGAGUCUUCAGCGCAUCCCCCAACAGCAGCCCCUGCCAGUCCCUCGGGUCCAGGCAAGGCCCUGGGGGUCUCCUUAAAUGCCACCUCGGGCAAGUCCCAGUCCCAGUCCUCGGCCACCCCCAGCUCUGGAUCCCAGGGCCAGCUGCCCUCUGGCUCUGGCUGUGGCUCCCGCCUGUCCGGCAGGGCCCAGGGCCAGCGUCGGGCACAGGGCAGCUCCCACUGGUCUCGGCAACACACCCAGCCGCCUGGUACUUCCUCCAGCCCCUCCCAGUCAGCCCUCCCGUCCUCGGGGCCCCUGCAGCCACCCAACGUCACCUCCAGCCCGGUCUCACCCAUGGUCCAGUCUCCCAGCAGCAGCAACAUCCCCACGCAGCCCCCCAGCAAGUCCUCUGGCAAGCCGGAGGACGCAGCCCCCAAGACCAGCGGACAGCGCCAGAAGGAAUCGUCGAAACAGCCUGCCAGCAGCGCCUCAGUGCCCGAGCUGGUCCCCUGCCAUUCCGGGACCUCUCUGGAGUACACUUCGGAGUCCACCACCGAGAUCACCUGCAGCUGGCCACACCACAGGCCCCCGUGCCUGCAGCACUACUGGUGCCUGAAACACCUGGCCUGCUAGGAGGCUCCAAUAAAGCUAACCCGGACCAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-610.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -635.83
Frequency: 0.0000
Diversity: 526.16
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((.(.((((..((((.((((.(((...((((((((((((((........)))))((((((.....(((.((((((.....))))))...)))..((((((((((.((((((((((((((((...((.((........)).))...))))))))(((((.(((((..((((((((((((.(((((..(((.....((((((((((.(((......(((((..((.(((......(.(((((((.(((.(.((((..((((((((((((....))))...)))))...((....))(((.............)))((((((((((.((.((((..((((..((((.....))))..))))..)).)))).))))))))))(((.(((....(((((........(((((..(((........)))..))).))(((((.(((..(((((((((((((....((((.((.(((((((...))))))).....((((...))))(((((((.(((((((((...(((.(((.((...))))).))).((......))........))))))))).))....))))))).))))))))))).)))))))))))))).((.((((((((((.((((((..(....)..)))))).)).).))))))))).((((......)))).))))).)))..))).))).)))))))).))))))).)))).))..)))))......((((((....)))..)))((((((((.((((.(((((..((((.((((((...((...))...))))))...))))..)))))....((((...)))).((.((((((((.((......)).)))))))).)).......((((......))))..........((((..((.((.....)).))..))))...((((((..((((((((((((((.((((((.(((.(((.(((.....))).))).))).)))))).)))))....))))))))).)).))))...((((..........)))).((((........))))..)))))))))))).....(((....)))))).)))))))))).....)))...))))).))))))))......)))))))))))))).((....)).......)))))).........((..(((((((((....)))))))))...))...........((((.(((.((......((....))......))))))).)).))))))))).)))))))))((((((..........)))))).((((((((....)))))))))))))).)))....))).)))).).((((........))))...((((.....))))...(((.((((......(((((....))))))))).))).....)))..)))).)))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((({{(..{((,{((({((((,{.((((((,,.,||||||,|.}}}},))},}|||,.}}}}}}..,{(((({.{{,|{{(((((..,...|||||||{||,(({{.((((((.((((((((,{(..{{{...,|((|(,,,|.||((((({((({(({((,((({.{(((((((,(((({.,((({....,(((((((((,(,,....,,||||,.,||},||..}|}}|{((((({({({(,(,({{,,{((((,(((,,{{....|||}.,{{{|,,..|||}.,.,}{{{...........,.}}}((((((((((.((.((((,.((((..((((.....))))..)))).,)).))}),))))))))))(({,(({{,,,((,({{,......,{{|{|{{(({{......,......||||({,,{{(((..,{{{((((((((({{.{(({{,(|.((((((({..((((({{(.{.{((((...,||,{{({{{{,{((,|,((({,,{({.(((.({...))))).)))}|}}...,}}}.,,}},..)))))})|)}))}}}}..}.))).))))))},,,,||||||,|}}},}}},||,||||||||||.(((((({.({......,,,|||{{|{|{||,,|||{||{{{{......}))).|{{||,,,,..|},.,||,||}}},,}.}||||||{|||,.||,,|||||,,,,{.{.{{{{..|..(({,,,.{{((((((.((((.(((((..((((.((((((...((...))...))))))...))))..)))))....{,,{...))))|||,|{,,.||||||{{|..,|||,|{|||||{,,.,.....{(((.....,|||,.......},,},,},,|},))}..,,,},,|||||||},})}))))}.((((((((((((((.((((((.(((.,((.(((.....))).))).))).)))))).)))))....)))))))))....}})),,,.|||..........}}}|.{(((........)))),.}))})))))))),..,,|{|..,,)))))),)))))))))),,...})}...))))},))))))))......}))),},)}}},}}})),|.,}},,,,......})),}},,,,,.||..(((((((((....)))))))))...}}......))))}|.}|,}}}}}},.}}})}|.,,}}}......))}))))})),)}))))),)})})))}}),{|{{{{..........)))}}}.((((((((....))))))))}))}}).))).}.,}.}}}}},}},({{{...,,.,.})))}}.}}))}).)}))))}..|})})|},,.....|||{|,,,.)))))))))}))}.....)))..))))},,,...
Back