Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001329904.2
Sequence Length
1346 nt
GC Content
0.5490
AGUGUGCAGGCUUAGAGGGACUAGGCUGGGUGUGGAGCUGCAGCGUAUCCACAGGGCUCCCCAGACCCCGACAGCACAGGGGCGCUGGUGGAGGAGGAGGAUCCUUUCUUCAAAGUCCCCGUGAACAAGCUGGCAGCGGCUGUCUCCAACUUCGGCUAUGACCUGUACCGGGUGCGAUCCAGCACGAGCCCCACGACCAACGUGCUCCUGUCUCCUCUCAGUGUGGCCACGGCCCUCUCGGCCCUCUCGCUGGGAGCGGAGCAGCGAACAGAAUCCAUCAUUCACCGGGCUCUCUACUAUGACUUGAUCAGCAGCCCAGACAUCCAUGGUACCUAUAAGGAGCUCCUUGACACGGUCACUGCCCCCCAGAAGAACCUCAAGAGUGCCUCCCGGAUCGUCUUUGAGAAGAAGCUGCGCAUAAAAUCCAGCUUUGUGGCACCUCUGGAAAAGUCAUAUGGGACCAGGCCCAGAGUCCUGACGGGCAACCCUCGCUUGGACCUGCAAGAGAUCAACAACUGGGUGCAGGCGCAGAUGAAAGGGAAGCUCGCCAGGUCCACAAAGGAAAUUCCCGAUGAGAUCAGCAUUCUCCUUCUCGGUGUGGCGCACUUCAAGGGGCAGUGGGUAACAAAGUUUGACUCCAGAAAGACUUCCCUCGAGGAUUUCUACUUGGAUGAAGAGAGGACCGUGAGGGUCCCCAUGAUGUCGGACCCUAAGGCUGUUUUACGCUAUGGCUUGGAUUCAGAUCUCAGCUGCAAGAUUGCCCAGCUGCCCUUGACCGGAAGCAUGAGUAUCAUCUUCUUCCUGCCCCUGAAAGUGACCCAGAAUUUGACCUUGAUAGAGGAGAGCCUCACCUCCGAGUUCAUUCAUGACAUAGACCGAGAACUGAAGACCGUGCAGGCGGUCCUCACUGUCCCCAAGCUGAAGCUGAGUUAUGAAGGCGAAGUCACCAAGUCCCUGCAGGAGAUGAAGCUGCAAUCCUUGUUUGAUUCACCAGACUUUAGCAAGAUCACAGGCAAACCCAUCAAGCUGACUCAGGUGGAACACCGGGCUGGCUUUGAGUGGAACGAGGAUGGGGCGGGAACCACCCCCAGCCCAGGGCUGCAGCCUGCCCACCUCACCUUCCCGCUGGACUAUCACCUUAACCAGCCUUUCAUCUUCGUACUGAGGGACACAGACACAGGGGCCCUUCUCUUCAUUGGCAAGAUUCUGGACCCCAGGGGCCCCUAAUAUCCCAGUUUAAUAUUCCAAUACCCUAGAAGAAAACCCGAGGGACAGCAGAUUCCACAGGACACGAAGGCUGCCCCUGUAAGGUUUCAAUGCAUACAAUAAAAGAGCUUUAUCCCUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-459.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -483.63
Frequency: 0.0000
Diversity: 366.35
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((((..(((..((((..(((((((((.(((((((......)).)))))((((((((((((.((((.........))))..)))).)))).((((((.(((((((((((......(((((....(((((....)))))(.((((.......((((((...(((.(.((((((((((.((((.((((((((((.....)))).(((((.((((((((((((.((....((((.....)))).)).))))))))..))))))).))...((((.....))))...)))))).......)).)).)))).))).))).))))..))))))........))))).......)))))((((((((((..........((((((((..((....))..).)).)))))..((((.(((((...........((((((((...((((((....(((......))).....)))))).((((.(((((..((((((((((.((((.................)))).))))))........))))..))))).)))).)))))))).......((((.((((.......))))....))))....)))))))))..))))))))))...............(((((..(((..(((.....)))..)))..))))))))))))))))))...(((((((..........))))))).(((((((........)))))))((..((((....((((((((....)))..)))))...))))))(((((.((((...)))))))))))))(((((((...((...(((((((((..((.(((.(((((((.(((((......((.(((.((((((((.(((....((...(((.((((((....)))))).)))...........))....))).))))))))...))).)).....((((((.((((((((((((.....((((((((((.(((((((((...(((((..(((....((....)).)))..)))))(((.((((...)))))))))))...))))).)))))))))).(((((((.......))).)))).((((........)))).............(((((.............))))).)))))))))....))))))))).........))))).))))))))))..))..)))))))))))..))))))))))).....)))))))))...........))))..))).(((((..((((.((((....(((...))).......)))).))))....)))))...)))))))......................
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((((({((((.,(((.,||(|((((((((((((({{{,{{,..}}|||,(((((((((((.((((.........))))..)))).)))|(((((((,,..,}}}}||,..,,}}|||}}..,,,|}}{|||||((({({{{.,....,{(({({{{,.,{||,||||((((......))))((((((((((.....)))).((((({(({(((((((((.((....((((.....)))).}).))))))))).))))))).))...((((.....})))...)))))),,.....,|,,..|,,,,||||||,.{{{{{,{((((,,{{,.,{{((....}}}}}....||{(((((((((...,,,,...((((((((..((....))..}.))}}})))..((((,(({((,,......,.,|(((((((.,,((((((....(((......))).....)))))).((((.(((((..((((((((((.{((({,,..,,........}}}}}),))))}},,,..,..))))..))))).)))),))))))}),,.....((((.((((.......))))....)))),}}}}))))))))..)))))))))|.,....,,{{{{,.,,,|,,..|||}}|((,{{{.||,,{|||.{||,,...)))}})))})).))|||||{{}}}}}}})}}}}}},},..||||||,....,,,}}))}}}|||,.}}}.}}.,|))}||,,},},))}.,))))}}}))}..,(((((.{{({...,,))},}))))).(((((((...(,,..(((((((((..((.(((.(((((((.(((((......((.(((.((((((((.{{(...,{{...(((.((((((....)))))).))),,,}}....,{|,...}))}.))))))))...))).)).....((((((.({((((((((((,,,..((((((((((.(((((((((...{((((..(((....({....,},)))..))))}(((.((((...)))))))))))...))))).)))))))))),(((((((......,}}}.}}}}.{||{.,...,,.)))).............(((((..,,......,,.))))).,)))))))))...,}})))))).........))))).))))))))))..))..))))))))),},.))))))),,,......}}}})}}}}....}}}..}}}}},....{.{{{((..{(((.((((....(((...))}.......)))).))))....))))},..)))))))...............,......
Back