Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001329905.2

Sequence Length

1103 nt

GC Content

0.5367

AGUGCCUGGGGAUGCCAGCAGAAGUCCUGGCAAGUCACAGGAAGAUGCUGGCUGGGAAGUCAGGGCCUGCUGAGCGCUAAACCAGAACCCGAGCCUGGCAGGCUCUCAAAGACGGGAUGCUUGUCGUCGAGUCUCAUACGCUAACCUCUGCUCCGCCUCUUCUCAGAGCUGCGCAUAAAAUCCAGCUUUGUGGCACCUCUGGAAAAGUCAUAUGGGACCAGGCCCAGAGUCCUGACGGGCAACCCUCGCUUGGACCUGCAAGAGAUCAACAACUGGGUGCAGGCGCAGAUGAAAGGGAAGCUCGCCAGGUCCACAAAGGAAAUUCCCGAUGAGAUCAGCAUUCUCCUUCUCGGUGUGGCGCACUUCAAGGGGCAGUGGGUAACAAAGUUUGACUCCAGAAAGACUUCCCUCGAGGAUUUCUACUUGGAUGAAGAGAGGACCGUGAGGGUCCCCAUGAUGUCGGACCCUAAGGCUGUUUUACGCUAUGGCUUGGAUUCAGAUCUCAGCUGCAAGAUUGCCCAGCUGCCCUUGACCGGAAGCAUGAGUAUCAUCUUCUUCCUGCCCCUGAAAGUGACCCAGAAUUUGACCUUGAUAGAGGAGAGCCUCACCUCCGAGUUCAUUCAUGACAUAGACCGAGAACUGAAGACCGUGCAGGCGGUCCUCACUGUCCCCAAGCUGAAGCUGAGUUAUGAAGGCGAAGUCACCAAGUCCCUGCAGGAGAUGAAGCUGCAAUCCUUGUUUGAUUCACCAGACUUUAGCAAGAUCACAGGCAAACCCAUCAAGCUGACUCAGGUGGAACACCGGGCUGGCUUUGAGUGGAACGAGGAUGGGGCGGGAACCACCCCCAGCCCAGGGCUGCAGCCUGCCCACCUCACCUUCCCGCUGGACUAUCACCUUAACCAGCCUUUCAUCUUCGUACUGAGGGACACAGACACAGGGGCCCUUCUCUUCAUUGGCAAGAUUCUGGACCCCAGGGGCCCCUAAUAUCCCAGUUUAAUAUUCCAAUACCCUAGAAGAAAACCCGAGGGACAGCAGAUUCCACAGGACACGAAGGCUGCCCCUGUAAGGUUUCAAUGCAUACAAUAAAAGAGCUUUAUCCCUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-382.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -399.57

Frequency: 0.0000

Diversity: 280.07

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((((((((((((((((((....(((((........)))))...))))))).((((((((((((((((((.((.(((.............)))))))))))))))....(((((.(....).)))))(((((..........(((((((((((..((.(((.(((((.(((.((((((.......))))))))).)))))))).)).....((.(.(((.(((.((((.((((.(((((..((((((((((.((((.................)))).))))))........))))..))))).))))(((.....)))..........((((.......)))).)))).))).)))).))......))))))).))))..........)))))......)))))))).((.((.(((((.(((.....)))))))).)).))(((((((..........)))))))..(((.(((((..((...((((.((((....)))).))))))))))).)))..((((((((((...(((((.((((...))))...))))).(((((((...((...(((((((((..((.(((.(((((((.(((((......((.(((.((((((((.(((....((...(((.((((((....)))))).)))...........))....))).))))))))...))).)).....((((((.((((((((((((.....((((((((((.(((((((((...(((((..(((....((....)).)))..)))))(((.((((...)))))))))))...))))).)))))))))).(((((((.......))).)))).((((........)))).............(((((.............))))).)))))))))....))))))))).........))))).))))))))))..))..)))))))))))..))))))).............((((....(((..........)))..)))).)))))).))))..))))).)))).))).((((((.....((((..((......)).)))).......))))))........

Thermodynamic Ensemble Prediction

.,,,,{(((((({(((((((....(((((........)))))...))))))){((((,((,((((,,,,,,..(((((,.{{{{{{,...{{||{|,,,)))))),....{,{(({(,{{{|.|||||(,(((,,,,,.{,...,{,{{||,,,{.((.(((.(((((.(((.((((((.......))))))))).)))))))).}}.|...||||}|,,,||,,||||.((((.(((((..((((((((((.{((({,,..,,........}}}}}),))))}},,,..,..))))..))))).)))){|{.....||}...,,}}}},||{|..,,,,,)))}.}))).))).))))))...{{,{|||||||{||||{,....{{{{|||||{{....||},}|||{((.((.{((((.(((.....)))))))}.)).))||||||{...,,..},,))))}},..(((,,{{{,..||,.,((((.((({....}))).))))},..,.}))))},|)))|||}}|,..(((((.({((...,}})}.,))))).(((((((...(,,..(((((((((..((.(((.(((((((.(((((......((.(((.((((((((.{{(...,{{...(((.((((((....)))))).))),,,}}....,{|,...}))}.))))))))...))).)).....((((((.({((((((((((,,,..((((((((((.(((((((((...{((((..(((....({....,},)))..))))}(((.((((...)))))))))))...))))).)))))))))),(((((((......,}}}.}}}}.{||{.,...,,.)))).............(((((..,,......,,.))))).,)))))))))...,}})))))).........))))).))))))))))..))..))))))))),},.)))))))}}}}.}}.}}}}},...............,,,,,}..,,{{{{{,,||||.||||..,,{({.,,)),,,,....)})).}))),,..))}})}...}},},.........}}}}}}}}},,,,.