Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001330163.2
Sequence Length
1465 nt
GC Content
0.5857
CUUUGUUAAGUCGUUCCCUCUACAAAGGACUUCCUAGUGGGUGUGAAAGGCAGCGGUGGCCACAGAGGCGGCGGAGAGAUGGCCUUCAGCGGUUCCCAGGCUCCCUACCUGAGUCCAGCUGUCCCCUUUUCUGGGACUAUUCAAGGAGGUCUCCAGGACGGACUUCAGAUCACUGUCAAUGGGACCGUUCUCAGCUCCAGUGGAACCAGGUUUGCUGUGAACUUUCAGACUGGCUUCAGUGGAAAUGACAUUGCCUUCCACUUCAACCCUCGGUUUGAAGAUGGAGGGUACGUGGUGUGCAACACGAGGCAGAACGGAAGCUGGGGGCCCGAGGAGAGGAAGACACACAUGCCUUUCCAGAAGGGGAUGCCCUUUGACCUCUGCUUCCUGGUGCAGAGCUCAGAUUUCAAGGUGAUGGUGAACGGGAUCCUCUUCGUGCAGUACUUCCACCGCGUGCCCUUCCACCGUGUGGACACCAUCUCCGUCAAUGGCUCUGUGCAGCUGUCCUACAUCAGCUUCCAGCCUCCCGGCGUGUGGCCUGCCAACCCGGCUCCCAUUACCCAGACAGUCAUCCACACAGUGCAGAGCGCCCCUGGACAGAUGUUCUCUACUCCCGCCAUCCCACCUAUGAUGUACCCCCACCCCGCCUAUCCGAUGCCUUUCAUCACCACCAUUCUGGGAGGGCUGUACCCAUCCAAGUCCAUCCUCCUGUCAGGCACUGUCCUGCCCAGUGCUCAGAGGUGUGGAUCUUGUGUGAAGCUCACUGCCUCAAGGUGGCCGUGGAUGGUCAGCACCUGUUUGAAUACUACCAUCGCCUGAGGAACCUGCCCACCAUCAACAGACUGGAAGUGGGGGGCGACAUCCAGCUGACCCAUGUGCAGACAUAGGCGGCUUCCUGGCCCUGGGGCCGGGGGCUGGGGUGUGGGGCAGUCUGGGUCCUCUCAUCAUCCCCACUUCCCAGGCCCAGCCUUUCCAACCCUGCCUGGGAUCUGGGCUUUAAUGCAGAGGCCAUGUCCUUGUCUGGUCCUGCUUCUGGCUACAGCCACCCUGGAACGGAGAAGGCAGCUGACGGGGAUUGCCUUCCUCAGCCGCAGCAGCACCUGGGGCUCCAGCUGCUGGAAUCCUACCAUCCCAGGAGGCAGGCACAGCCAGGGAGAGGGGAGGAGUGGGCAGUGAAGAUGAAGCCCCAUGCUCAGUCCCCUCCCAUCCCCCACGCAGCUCCACCCCAGUCCCAAGCCACCAGCUGUCUGCUCCUGGUGGGAGGUGGCCUCCUCAGCCCCUCCUCUCUGACCUUUAACCUCACUCUCACCUUGCACCGUGCACCAACCCUUCACCCCUCCUGGAAAGCAGGCCUGAUGGCUUCCCACUGGCCUCCACCACCUGACCAGAGUGUUCUCUUCAGAGGACUGGCUCCUUUCCCAGUGUCCUUAAAAUAAAGAAAUGAAAAUGCUUGUUGGCACAUUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-575.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -599.41
Frequency: 0.0000
Diversity: 250.66
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((((.((.........)).)))))....((((..((((((((((.(((.(((......(((((.(((((((.((((((((((((..(.((((.......)))).).)).)))(((((.......))))).......)))))))((((((..........(((.((((((((((((((((...(((..((((.((((.((((.((((...........)))))))).)))).))))..)))...(((((((((((((((((...)).)))))).)))))))))((((........)))).(((((..((.(.(((((((((..(((((((((............))))))).(((((((((.((((((((.((((((........)))))).))))).......((........))))))))))))))((((((....(((((((.(((......))))).)))))..((((........))))..))))))(((((........)))))))..))).)))))).).))..)))))....))).))))))).....)))))).)))......((((...)))).)))))).......))))).)).)))))(((........))).............)))...))).))))))))))..))))..(((((((((((...........(((((((((((((.((...(((((((.......))))))))))))).))))).)))).((((((.....((((.((((((((..(((((((((.((..............))))))))..(((((((((((.(((((((....(((.(((((.((.(....).)).))))))))........(((((((.....((((....))))(((((((..(((((((((((..(((((.((.((((.((((((((....((((..((((((((.................))))))))..)))).....))).))))))).(.((((((.(((..(((((((.((((....)))).(((((...(((...((((((((..(((((......)))))((((.(((......))).)))).))))))))....))).......))))))))))))..))).)))))).)(((((((((.(((.(.(((..(((......)))..))).))))))))..))))))).)).))))))))))))))))..))).)))).)))))))...)))))))))))....)))))))........................)))..))))))))....).)))......))))))))))))))))).(.(((((.(.(((....)))).))))).).....((((..((((....))))))))((((((((........)))..)))))...)))))))...((((..((((....))))..))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((({((({.{,.........}|,)}}},....((((..((((((((((.(((.{((.....,(({((,(((((((.(({,,,((((((..{.((((.......)))).}.)).)))|{{{|,.,,,,,||||}......,|||}|||((((((..{,.,,.,.(((.((((((((((((((((...(((..((((.((((.((((,((((..{........)))))))).)))).))))..)))...(((((((((((((((((...)),)))))).)))))))))((((........)))).(((((..((.{.(((((((((..(((((((((.,......,.|.|}}}}}}.{{{(|(.||,}}}}}},,}||||,|,,....{{(((((((|||,{,.....((.(((((((.{(({(|...,,}))}),.......(((((((.(((......))))).)))))))))))).)),....}))))))))))(((((........))))),,..))).)))))).}.))..)))))....))).))))))).....)))))).)))......{|{{.,.)))).))))))..}}}.}))),}.,),))}}|{||........}}}}........,.}})))...))).))))))))))..))))..(((((((((((.,,....,,..(((((((((((({{((...(((((((.......))))))))))))).))))).)))).(((({(.....{((,.((((((((..((((({((({((.....,...|....,.,}}}}}(.(((((((((((.(((((((....(((.(((((.((.(....).)).))))))))......{.(((((((..{{.((((....||||{{{{|||,.(((((((((({.,(((((.((.((((.((((((((....((((..((((((((...,.............))))))))..)))).....))).)))))}}.,.((((((.(((..(((((((,((((....)))).{((((...(((...((((((((..(((((......)))))((((.(((......))).)))).))))))))....))).......))))))))))))..))).)))))),|(((((((((,(((,{.(({..{{{......))),,))}.)))))))}..}}})))).)).)))))))))))))))).,))).))}}.))))))).,.)))))))))))....))))))),.........,,}},,........)))..))))))))....}.))}......}}}))}))))))))))).{.(((((.(.(((....)))).))))).,.....((((..((((....)))))))){{|(((((........))))}}))))...)))))))...{(((..((((....))))..)))}
Back