Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001330728.1
Sequence Length
4213 nt
GC Content
0.5661
UCCGGCCCGCACCCACCCCCAAGAGGGGCCUUCAGCUUUGGGGCUCAGAGGCACGACCUCCUGGGGAGGGUUAAAAGGCAGACGCCCCCCCGCCCCCCGCGCCCCCGCGCCCCGACUCCUUCGCCGCCUCCAGCCUCUCGCCAGUGGGAAGCGGGGAGCAGCCGCGCGGCCGGAGUCCGGAGGCGAGGGGAGGUCGGCCGCAACUUCCCCGGUCCACCUUAAGAGGACGAUGUAGCCAGCUCGCAGCGCUGACCUUAGAAAAACAAGUUUGCGCAAAGUGGAGCGGGGACCCGGCCUCUGGGCAGCCCCGGCGGCGCUUCCAGUGCCUUCCAGCCCUCGCGGGCGGCGCAGCCGCGGCCCAUGGAGCCCGCCGGCCCGGCCCCCGGCCGCCUCGGGCCGCUGCUCUGCCUGCUGCUCGCCGCGUCCUGCGCCUGGUCAGGAGUGGCGGGUGAGGAGGAGCUGCAGGUGAUUCAGCCUGACAAGUCCGUGUUGGUUGCAGCUGGAGAGACAGCCACUCUGCGCUGCACUGCGACCUCUCUGAUCCCUGUGGGGCCCAUCCAGUGGUUCAGAGGAGCUGGACCAGGCCGGGAAUUAAUCUACAAUCAAAAAGAAGGCCACUUCCCCCGGGUAACAACUGUUUCAGACCUCACAAAGAGAAACAACAUGGACUUUUCCAUCCGCAUCGGUAACAUCACCCCAGCAGAUGCCGGCACCUACUACUGUGUGAAGUUCCGGAAAGGGAGCCCCGAUGACGUGGAGUUUAAGUCUGGAGCAGGCACUGAGCUGUCUGUGCGCGCCAAACCCUCUGCCCCCGUGGUAUCGGGCCCUGCGGCGAGGGCCACACCUCAGCACACAGUGAGCUUCACCUGCGAGUCCCACGGCUUCUCACCCAGAGACAUCACCCUGAAAUGGUUCAAAAAUGGGAAUGAGCUCUCAGACUUCCAGACCAACGUGGACCCCGUAGGAGAGAGCGUGUCCUACAGCAUCCACAGCACAGCCAAGGUGGUGCUGACCCGCGAGGACGUUCACUCUCAAGUCAUCUGCGAGGUGGCCCACGUCACCUUGCAGGGGGACCCUCUUCGUGGGACUGCCAACUUGUCUGAGACCAUCCGAGUUCCACCCACCUUGGAGGUUACUCAACAGCCCGUGAGGGCAGAGAACCAGGUGAAUGUCACCUGCCAGGUGAGGAAGUUCUACCCCCAGAGACUACAGCUGACCUGGUUGGAGAAUGGAAACGUGUCCCGGACAGAAACGGCCUCAACCGUUACAGAGAACAAGGAUGGUACCUACAACUGGAUGAGCUGGCUCCUGGUGAAUGUAUCUGCCCACAGGGAUGAUGUGAAGCUCACCUGCCAGGUGGAGCAUGACGGGCAGCCAGCGGUCAGCAAAAGCCAUGACCUGAAGGUCUCAGCCCACCCGAAGGAGCAGGGCUCAAAUACCGCCGCUGAGAACACUGGAUCUAAUGAACGGAACAUCUAUAUUGUGGUGGGUGUGGUGUGCACCUUGCUGGUGGCCCUACUGAUGGCGGCCCUCUACCUCGUCCGAAUCAGACAGAAGAAAGCCCAGGGCUCCACUUCUUCUACAAGGUUGCAUGAGCCCGAGAAGAAUGCCAGAGAAAUAACACAGGUACAGUCCUUGGACACAAAUGAUAUCACAUAUGCAGACCUGAACCUGCCCAAGGGGAAGAAGCCUGCUCCCCAGGCUGCGGAGCCCAACAACCACACGGAGUAUGCCAGCAUUCAGACCAGCCCGCAGCCCGCGUCGGAGGACACCCUCACCUAUGCUGACCUGGACAUGGUCCACCUCAACCGGACCCCCAAGCAGCCGGCCCCCAAGCCUGAGCCGUCCUUCUCAGAGUACGCCAGCGUCCAGGUCCCGAGGAAGUGAAUGGGACCGUGGUUUGCUCUAGCACCCAUCUCUACGCGCUUUCUUGUCCCACAGGGAGCCGCCGUGAUGAGCACAGCCAACCCAGUUCCCGGAGGGCUGGGGCGGUGCAGGCUCUGGGACCCAGGGGCCAGGGUGGCUCUUCUCUCCCCACCCCUCCUUGGCUCUCCAGCACUUCCUGGGCAGCCACGGCCCCCUCCCCCCACAUUGCCACAUACCUGGAGGCUGACGUUGCCAAACCAGCCAGGGAACCAACCUGGGAAGUGGCCAGAACUGCCUGGGGUCCAAGAACUCUUGUGCCUCCGUCCAUCACCAUGUGGGUUUUGAAGACCCUCGACUGCCUCCCCGAUGCUCCGAAGCCUGAUCUUCCAGGGUGGGGAGGAGAAAAUCCCACCUCCCCUGACCUCCACCACCUCCACCACCACCACCACCACCACCACCACCACUACCACCACCACCCAACUGGGGCUAGAGUGGGGAAGAUUUCCCCUUUAGAUCAAACUGCCCCUUCCAUGGAAAAGCUGGAAAAAAACUCUGGAACCCAUAUCCAGGCUUGGUGAGGUUGCUGCCAACAGUCCUGGCCUCCCCCAUCCCUAGGCUAAAGAGCCAUGAGUCCUGGAGGAGGAGAGGACCCCUCCCAAAGGACUGGAGACAAAACCCUCUGCUUCCUUGGGUCCCUCCAAGACUCCCUGGGGCCCAACUGUGUUGCUCCACCCGGACCCAUCUCUCCCUUCUAGACCUGAGCUUGCCCCUCCAGCUAGCACUAAGCAACAUCUCGCUGUGGACGCCUGUAAAUUACUGAGAAAUGUGAAACGUGCAAUCUUGAAACUGAGGUGUUAGAAAACUUGAUCUGUGGUGUUUUGUUUUGUUUUUUUUCUUAAAACAACAGCAACGUGAUCUUGGCUGUCUGUCAUGUGUUGAAGUCCAUGGUUGGGUCUUGUGAAGUCUGAGGUUUAACAGUUUGUUGUCCUGGAGGGAUUUUCUUACAGCGAAGACUUGAGUUCCUCCAAGUCCCAGAACCCCAAGAAUGGGCAAGAAGGAUCAGGUCAGCCACUCCCUGGAGACACAGCCUUCUGGCUGGGACUGACUUGGCCAUGUUCUCAGCUGAGCCACGCGGCUGGUAGUGCAGCCUUCUGUGACCCCGCUGUGGUAAGUCCAGCCUGCCCAGGGCUGCUGAGGGCUGCCUCUUGACAGUGCAGUCUUAUCGAGACCCAAUGCCUCAGUCUGCUCAUCCGUAAAGUGGGGAUAGUGAAGAUGACACCCCUCCCCACCACCUCUCAUAAGCACUUUAGGAACACACAGAGGGUAGGGAUAGUGGCCCUGGCCGUCUAUCCUACCCCUUUAGUGACCGCCCCCAUCCCGGCUUUCUGAGCUGAUCCUUGAAGAAGAAAUCUUCCAUUUCUGCUCUCAAACCCUACUGGGAUCAAACUGGAAUAAAUUGAAGACAGCCAGGGGGAUGGUGCAGCUGUGAAGCUCGGGCUGAUUCCCCCUCUGUCCCAGAAGGUUGGCCAGAGGGUGUGACCCAGUUACCCUUUAACCCCCACCCUUCCAGUCGGGUGUGAGGGCCUGACCGGGCCCAGGGCAAGCAGAUGUCGCAAGCCCUAUUUAUUCAGUCUUCACUAUAACUCUUAGAGUUGAGACGCUAAUGUUCAUGACUCCUGGCCUUGGGAUGCCCAAGGGAUUUCUGGCUCAGGCUGUAAAAGUAGCUGAGCCAUCCUGCCCAUUCCUGGAGGUCCUACAGGUGAAACUGCAGGAGCUCAGCAUAGACCCAGCUCUCUGGGGGAUGGUCACCUGGUGAUUUCAAUGAUGGCAUCCAGGAAUUAGCUGAGCCAACAGACCAUGUGGACAGCUUUGGCCAGAGCUCCCGUGUGGCAUCUGGGAGCCACAGUGACCCAGCCACCUGGCUCAGGCUAGUUCCAAAUUCCAAAAGAUUGGCUUGUAAACCUUCGUCUCCCUCUCUUUUACCCAGAGACAGCACAUACGUGUGCACACGCAUGCACACACACAUUCAGUAUUUUAAAAGAAUGUUUUCUUGGUGCCAUUUUCAUUUUAUUUUAUUUUUUAAUUCUUGGAGGGGGAAAUAAGGGAAUAAGGCCAAGGAAGAUGUAUAGCUUUAGCUUUAGCCUGGCAACCUGGAGAAUCCACAUACCUUGUGUAUUGAACCCCAGGAAAAGGAAGAGGUCGAACCAACCCUGCGGAAGGAGCAUGGUUUCAGGAGUUUAUUUUAAGACUGCUGGGAAGGAAACAGGCCCCAUUUUGUAUAUAGUUGCAACUUAAACUUUUUGGCUUGCAAAAUAUUUUUGUAAUAAAGAUUUCUGGGUAAUAAUGA

Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1611.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1683.99
Frequency: 0.0000
Diversity: 1020.41
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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