Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001345910.2
Sequence Length
1674 nt
GC Content
0.4654
AUCACUAGGCGCCGAGGAGGGGAGCGGGAAGCGCAGGUAUGAGGCUGGCGCCGGUGGCUUCGAUGCUGCUUUCCGGUGACUUCGAUGCUGUUUUCCAGUGCUUUUUCCUUUUUCUGUGCCAGCGCCACAGCCCUUCAAUCAUUUUGGUUGCUAUCCAGCUUCUCCACAUCAAGUCCAACUUCAGAAACCCCAAGCCUGUAGAGAAAAGUUGACCUGUGCUGACUCUGGUGAUGGUGACUGUCUCUCACUAAUUUCUUUGAAGUCUUCAAGGAUAAGCAGAGUUGAUCCAUCUGAGAAAGGGAUCAUGAACUAGACAGAAUGAACAGCCUUAGAGGCACAGACUCUUGAACGGGACGGUGGUGGUAUGACUAGUGCAGAGUGUUUAGAGAUCACUCAGUUUUUAAAGACUGGCCUUUAUCGUGUCUCAGUGCAGCCGAGGCAGAGCCUUUGAAGGAUGCGAUGUUGUCAUUCUUACUAAUCUAGUCCAGCCGCUGAGGUGACUUUCAACGGCAGACCGUCUCCUGAGCGCCCCAGGUAGAAUUUCAAAAGUCUCCGGGACCAUUAUGGCAGUCAAGUGGACGGGUGGGCAUUCUUCUCCUGUCCUCUGCCUGAAUGCAAGUAAAGAAGGGCUGCUGGCUUCUGGAGCAGAGGGCGGAGAUCUCACGGCUUGGGGUGAAGAUGGAACUCCAUUAGGACACACGCGGUUCCAAGGGGCUGAUGAUGUUACCAGUGUCUUAUUUUCUCCCUCCUGUCCCACCAAGCUCUAUGCCUCACAUGGAGAAACCAUUAGUGUACUGGAUGUCAGGUCCCUCAAAGAUUCCUUGGACCAUUUUCAUGUGAAUGAAGAAGAAAUCAAUUGUCUUUCAUUGAAUCAAACGGAAAACCUGCUGGCUUCUGCUGACGACUCUGGGGCAAUCAAAAUCCUAGACUUGGAAAACAAGAAAGUUAUCAGAUCCUUGAAGAGACAUUCCAAUAUCUGCUCCUCAGUGGCUUUUCGGCCUCAGAGGCCUCAGAGCCUGGUGUCAUGUGGACUGGAUAUGCAGGUGAUGCUGUGGAGUCUUCAAAAAGCCCGACCACUCUGGAUUACAAAUUUACAGGAGGAUGAAACAGAAGAAAUGGAAGGCCCACAGUCACCUGGUCAGCUCUUAAACCCUGCCCUAGCCCAUUCUAUCUCUGUGGCUUCGUGUGGUAAUAUUUUUAGUUGUGGUGCAGAAGAUGGUAAGGUUCGAAUCUUUCGGGUGAUGGGAGUUAAGUGUGAACAGGAACUGGGAUUUAAGGGCCACACUUCAGGGGUAUCCCAGGUCUGCUUUCUCCCAGAAUCCUAUUUGCUGCUUACUGGAGGGAAUGAUGGGAAGAUCACGUUGUGGGAUGCAAACAGUGAAGUUGAGAAAAAACAGAAGAGUCCCACAAAACGUACCCACAGGAAGAAACCUAAAAGAGGAACUUGCACCAAGCAGGGUGGAAAUACUAACGCUUCAGUAACAGAUGAGGAAGAACAUGGCAACAUUUUACCAAAGCUAAAUAUUGAACAUGGAGAAAAAGUGAACUGGCUCUUGGGUACAAAAAUAAAGGGACACCAAAAUAUAUUAGUAGCUGAUCAAACUAGUUGUAUAUCUGUAUACCCCUUAAAUGAAUUUUAAAUCCAAUAAAAACAUUUGAAGAAUUGUGGCAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-508.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -545.16
Frequency: 0.0000
Diversity: 350.11
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.......(((((.((((((((((((((((((.((((...(((((....((((((.(((.........)))..)))))).)))))...)))))))))..)))))...)))))))).)))))...(((((((..((((((((((((.((.((((((((((....(((((((..((((((.((((....((((((((((.((.((((...(((.((((((.((((((.(.((((((((......((((..((....((((((((...))))))))..)).)))).((((((..((.....))))))))((.((((((.(((((((.((((....(((((((.((((((.(((((.....(((.((((...)))).)))....))))))))).))..(((((((....)))))))........)))))))..((((.(((((((...)))))....)).))))..)))))))))))......)))))).))..((((.(((.(((..((.......))..))).))).)))).(((.((.(((..........)))))))))))))))).).)))))...).)))))).))).....(((((.((((((((((((((.((.((((.........)))).))))).)).)))))))))))))))))))))))))))))))))).))).)))......(((((...(.((....((((.((((..........)))).)))).......)))...)))))(((((.(((((..(((((...(.(((((.(((((((((((.((((((((.(((((....(((....)))))))).(((((((....))))))).....(((((........)))))......(((((..((....)).)))))((((.((((((((((.........)))))).((((.....))))..)))).))))...........)))).)))).)))..)))....))))).))))).).....)))))...))))).)))))..)))))))))))))).)))((((..(((((((.((((((...........((.(.(((.............)))).))......((.......)))))))))))))))))))(((((((((.((((....(((((.((((..(((.....((....((((((((..(((((((..(((((.(((((.(((.(.((.((..((((...(((((.((((..((((((..((((.......(((.(((((((......(((.(......).)))))))))).))))))).))))))..))))......(((.(((((((((.(...(((......)))((((((((((((.......((..............))......))))))))..))))..(((((((......)))..........(((((.....))))))))).........).))))))))))))..))))).)))).)).)).).)))))))).)))))))))))).))))))))....)).)))..))))...)))))..........((....))........)))).)))))))))........(((((....))))).))..))))))......................))))))..)))))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
....,{.(((((.(((((((((((({(((((,(({({{{(((((....((((((.(((......,,.)))..)))))).)))),,}}))))}))))..})))}.,})))))))).))))),}.(((((((..((((((,,,{{({((.((((((((((....(((((((..{(((((.((((,...{(((((((((.((.((((...(((.((((((,((((((.(.((((((((..,,,.((((..,,....((((((({...})))))))..,,.}))).((((((..{{.....,,)))))}{{.{(((((.(((((({,((((..,{(((((.{.({{(({{{{{{{,,,{|{(({({{,...}))).}}}.,,,||}}}}}}},}),,||{||{|....}))))))}}}}}|{({(((((|...,{,,{.{((({...)))))})..))}))))),)))))))))))......)))))).)}{,{(((.(((.(((..((.......))..))).))).))))}(((.((.(((.{{....,},)))))))))))))))).).))))).,,}.)))))).))).....(((((.((((((((((((((.((.((((.........)))).))))).)).)))))))))))))))))))))))))))))))))).)))},)}......(((((,..{.((,,,.{(((,{(((.,{.......}})),)))).......}},...}}}}}(((((.(((((..(((((...,{({({{.{{{{{((,(({.((((((((.(((((....(((....)))))))).(((((((....))))))).....{((({.,.....}))))).||,..,(((,..{(,,.,||,||||},{{{{((,(((((({.........})))))){|||.....)}))..,)))},))).}}},}},...)))),,))).))},,))}....}}}||,|}}}},}}}...)))))...))))).)))))..)))))))))))))).))}((((,.,((((((.((((((........,..,{.{((((,,,,.....,,,.,})},)}.,,...|{.......},))))))))))))))))){((((((((,({{,.,,,(((((.((((..(((..,{.,{.,..((((((((..((((((,,{(((((.(((((.,{({(,((,(,..((((...(((({,((((..((((((..((((.......((,.(((((((......{((.{......},)})))))))).))))))).))))))..))))......(((.(((((((((.(..,(,(,,,...}}}{(((((((((((.......,{....{{........}}......))))))))..}))).}||||{{{......|||.....}}}..{(({(,,,..}}}})))),.....,...).))))))))))))..))))}.)))).,},),.),)))))))).)))))))))))).))))))))..,.)).)))..))))...))))}..........||,...}}........}})).))))))))}........(((({....)))))..,,,|||,,,..|||}...,,,...,,,....))))))..)))))))....
Back