Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001345911.2
Sequence Length
784 nt
GC Content
0.4426
AUCACUAGGCGCCGAGGAGGGGAGCGGGAAGCGCAGUGCCAGCGCCACAGCCCUUCAAUCAUUUUGGUUGCUAUCCAGCUUCUCCACAUCAAGUCCAACUUCAGAAACCCCAAGCCUGUAGAGAAAAGUUGACCUGUGCUGACUCUGGUGAUGGUGAUGCUGUGGAGUCUUCAAAAAGCCCGACCACUCUGGAUUACAAAUUUACAGGAGGAUGAAACAGAAGAAAUGGAAGGCCCACAGUCACCUGGUCAGCUCUUAAACCCUGCCCUAGCCCAUUCUAUCUCUGUGGCUUCGUGUGGUAAUAUUUUUAGUUGUGGUGCAGAAGAUGGUAAGGUUCGAAUCUUUCGGGUGAUGGGAGUUAAGUGUGAACAGGAACUGGGAUUUAAGGGCCACACUUCAGGGGUAUCCCAGGUCUGCUUUCUCCCAGAAUCCUAUUUGCUGCUUACUGGAGGGAAUGAUGGGAAGAUCACGUUGUGGGAUGCAAACAGUGAAGUUGAGAAAAAACAGAAGAGUCCCACAAAACGUACCCACAGGAAGAAACCUAAAAGAGGAACUUGCACCAAGCAGGGUGGAAAUACUAACGCUUCAGUAACAGAUGAGGAAGAACAUGGCAACAUUUUACCAAAGCUAAAUAUUGAACAUGGAGAAAAAGUGAACUGGCUCUUGGGUACAAAAAUAAAGGGACACCAAAAUAUAUUAGUAGCUGAUCAAACUAGUUGUAUAUCUGUAUACCCCUUAAAUGAAUUUUAAAUCCAAUAAAAACAUUUGAAGAAUUGUGGCAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-197.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -215.93
Frequency: 0.0000
Diversity: 196.46
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.......((((((......)...(((.....))).)))))...(((((((..((((((...((((((..(((.((((((.((.(((((((((((((((((((((...........))).......)))))).........)))).))))).))).)).)))).)))))..)))))).............((((((..(((((((...((((.....(((((.....(((.....)))........(((((((((.((((....(((((.((((..(((.....((....((((((((..(((((((..(((((.(((((.(((.(.((.((..((((...(((((.((((..((((((..((((.......(((.(((((((......(((.(......).)))))))))).))))))).))))))..))))......(((.(((((((((.(...(((......)))((((((((((((.......((..............))......))))))))..))))..(((((((......)))..........(((((.....))))))))).........).))))))))))))..))))).)))).)).)).).)))))))).)))))))))))).))))))))....)).)))..))))...)))))..........((....))........)))).))))))))).............))))).....))))...)))))))..))))))..........))))))..)))))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
....{,.((((((.....,|,,.(((.....))).,}))),}.(((((((..((((((...,{{{|({{{{{..{{{{..{(,{((((,((,,{{{{,({{(((...........}}}..,,,...},))}}..}}}),.)},,)))),}.,||{{,.|{||{||,|{{{{{.........,,||.,,,(({{{{..,{{{{{,.,,||||.....,{{{,.....,||}}}}})))}})))}})(((((((((,({{,.,,,(((((.((((..(((..,{.,{.,..((((((((..((((((,,{(((((.(((((.,{({(,((,(,..((((...(((({,((((..((((((..((((.......((,.(((((((......{((.{......},)})))))))).))))))).))))))..))))......(((.(((((((((.(..,({(,{,...}}}{(((((((((((.......,{....{{........}}......))))))))..}))).}||||{{{......|||.....}}}..{(({(,,,..}}}})))),.....,...).))))))))))))..))))}.)))).,},),.),)))))))).)))))))))))).))))))))..,.)).)))..))))...))))}..........||,...}}........}})).)))))))))........||{{,,,,}),},,.}}||,,,||,,|}},,},,,}}.,.}}}....))))))..}))))))....
Back