Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001345913.2

Sequence Length

1538 nt

GC Content

0.4785

AUCACUAGGCGCCGAGGAGGGGAGCGGGAAGCGCAGGUAUGAGGCUGGCGCCGGUGGCUUCGAUGCUGCUUUCCGGUGACUUCGAUGCUGUUUUCCAGUGCUUUUUCCUUUUUCUGGUCUGGUGGCUCCGCGUCUGCUCUCCUGGGCUCCCUUUCCUGUGACGUUUCCCUGUGUCCGUUAGGUCCUUGCUUCAGACUCCAGCUCAACGCAUGAAACUUUUCUCUCCUUGCUUGCCGGGUCCUGGCUCCCCAACCUUUUUGUGUAGCUUGGGCAGCGGAGGCCGUCUUUACCUGGUCAGGCCCUCUCGUUCUCCCUAAGUAUCGGCACUUAGCGAACGUCUGUCCCUGUGUGCCUUCGCAAAGUAAGGUGGCUGCGACUGAACACCCCCUCGCCCAAACGUUCGAGUGCCAUUUGAGCGCUAAUUAAGUGCUGCCGUCUUUUGGACAAGAUGUGGUCUUUACUGGAUCCACCGCUUAUGCCAGCGCCACAGCCCUUCAAUCAUUUUGGUUGCUAUCCAGCUUCUCCACAUCAAGUCCAACUUCAGAAACCCCAAGCCUGUAGAGAAAAGUUGACCUGUGCUGACUCUGGUGAUGGUGACUGUCUCUCACUAAUUUCUUUGAAGUCUUCAAGGAUAAGCAGAGUUGAUCCAUCUGAGAAAGGGAUCAUGAACUAGACAGAAUGAACAGCCUUAGAGGCACAGACUCUUGAACGGGACGGUGGUGGUAUGACUAGUGCAGAGUGUUUAGAGAUCACUCAGUUUUUAAAGACUGGCCUUUAUCGUGUCUCAGUGCAGCCGAGGCAGAGCCUUUGAAGGAUGCGAUGUUGUCAUUCUUACUAAUCUAGUCCAGCCGCUGAGGUGACUUUCAACGGCAGACCGUCUCCUGAGCGCCCCAGGUAGAAUUUCAAAGUGAUGCUGUGGAGUCUUCAAAAAGCCCGACCACUCUGGAUUACAAAUUUACAGGAGGAUGAAACAGAAGAAAUGGAAGGCCCACAGUCACCUGGUCAGCUCUUAAACCCUGCCCUAGCCCAUUCUAUCUCUGUGGCUUCGUGUGGUAAUAUUUUUAGUUGUGGUGCAGAAGAUGGUAAGGUUCGAAUCUUUCGGGUGAUGGGAGUUAAGUGUGAACAGGAACUGGGAUUUAAGGGCCACACUUCAGGGGUAUCCCAGGUCUGCUUUCUCCCAGAAUCCUAUUUGCUGCUUACUGGAGGGAAUGAUGGGAAGAUCACGUUGUGGGAUGCAAACAGUGAAGUUGAGAAAAAACAGAAGAGUCCCACAAAACGUACCCACAGGAAGAAACCUAAAAGAGGAACUUGCACCAAGCAGGGUGGAAAUACUAACGCUUCAGUAACAGAUGAGGAAGAACAUGGCAACAUUUUACCAAAGCUAAAUAUUGAACAUGGAGAAAAAGUGAACUGGCUCUUGGGUACAAAAAUAAAGGGACACCAAAAUAUAUUAGUAGCUGAUCAAACUAGUUGUAUAUCUGUAUACCCCUUAAAUGAAUUUUAAAUCCAAUAAAAACAUUUGAAGAAUUGUGGCAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-457.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -488.59

Frequency: 0.0000

Diversity: 319.28

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..........((((...(((((((((((..(((.((.(((.(((((((((((((.(((.........)))..))))))........((((.....))))..............))))))).))).)).))).)))))))))))(((((((.((((((((..(((((.((((((((((...((((...((((.((((((((...((.(((.((((((((((((((.(..(((((..((((.((((((.(((((.((........)).))))).)))((((((((.((......)).).)).))))).................((((((...(((((((..((((((...(((....))).....))).))).((((..(......)..))))....))))))))))))).....((((((.....))))))........((((((..(((((((......((((((....((((......))))...(((((.............)))))..)))))).....)))))))..))))))...)))..)))))))))..).))))))))))).(((((.((.(.(((.((.((((((......((((..((....((((((((...))))))))..)).)))).((((((..((.....))))))))((.((((((.(((((((.((((....(((((((.((((((.(((((.....(((.((((...)))).)))....))))))))).))..(((((((....)))))))........)))))))..((((.(((((((...)))))....)).))))..)))))))))))......)))))).))((((.(((((....))))).))))..)))))).)).))))))..)))))......)))..))).))...)))))))).....))))..))))....))))).........))))).)))))..))))..)))).)))..)))).........(((((((((.((((....(((((.((((..(((.....((....((((((((..(((((((..(((((.(((((.(((.(.((.((..((((...(((((.((((..((((((..((((.......(((.(((((((......(((.(......).)))))))))).))))))).))))))..))))......(((.(((((((((.(...(((......)))((((((((((((.......((..............))......))))))))..))))..(((((((......)))..........(((((.....))))))))).........).))))))))))))..))))).)))).)).)).).)))))))).)))))))))))).))))))))....)).)))..))))...)))))..........((....))........)))).)))))))))........(((((....)))))...(((((((..(((((.......))))).))))))).......))))....

Thermodynamic Ensemble Prediction

.,((((((((.(.(((((((((((((((((({({{(,{{({(((,,,,((((((.(((......,..)))..)))))).}}}},,}})}}},}})).,}))},..,)))))))).))))))))),,,,|{|,,|||},,,..{(((((((.((((((((..(((((.((((((((((...((((...((((.(((((((({{,({.({{.((((((((((((((.(..(((((..((((.((((,...,{{{.,.....,.,..(((((((.(((((((((({.((......)).}.))}}})).))))...))}))))...((((((...(((((((.,({{{{{,,,({{..,|}}}..,..}}}.|)},({{{..{..,,..,..}})).,,.))))))))))))).....((((((.....))))))........((((((..(((((((......((((((....{(({......}}}}...,{||,...,,,......,)))))..)))))).....)))))))..))))))...)))..)))))))))..).))))))))))}.(((((.({,(.(((.((.((((((......({((..{{....((((((({...})))))))..}}.)))).((((((..{{.....}})))))){(.((((((.(((((({,((((..,{(((((.{,({((({{(((({...{,{(({({{,...)))).))}.,,,|}}}}}}}).}),,,{{{{{|....)))))))}}}}}|{({(((({|,..,({.{.{((((...)))))}}..))}))))),)))))))))))......)))))).)}((((.(((({....,)))).))))..)))))).)).)))))}..))))).....,)))..))),,)}..}))))))).....))))..))))....))))}........,))))).)))))..))))..)))).)),.,))))}.,|,,...(((((((((,({{,.,,,(((((.((((..(((..,{.,{.,..((((((((..((((((,,{(((((.(((((.,{({(,((,(,..((((...(((({,((((..((((((..((((.......((,.(((((((......{((.{......},)})))))))).))))))).))))))..))))......(((.(((((((((.(..,(,(,,,...}}}{(((((((((((.......,{....{{........}}......))))))))..}))).}||||{{{......|||.....}}}..{(({(,,,..}}}})))),.....,...).))))))))))))..))))}.)))).,},),.),)))))))).)))))))))))).))))))))..,.)).)))..))))...))))}..........||,...}}........}})).)))))))))........(((({....)))))...(((((((..(((((.......))))).))))))),)...,))))}....