Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001345915.2
Sequence Length
667 nt
GC Content
0.4333
AUCACUAGGCGCCGAGGAGGGGAGCGGGAAGCGCAGGUGAUGCUGUGGAGUCUUCAAAAAGCCCGACCACUCUGGAUUACAAAUUUACAGGAGGAUGAAACAGAAGAAAUGGAAGGCCCACAGUCACCUGGUCAGCUCUUAAACCCUGCCCUAGCCCAUUCUAUCUCUGUGGCUUCGUGUGGUAAUAUUUUUAGUUGUGGUGCAGAAGAUGGUAAGGUUCGAAUCUUUCGGGUGAUGGGAGUUAAGUGUGAACAGGAACUGGGAUUUAAGGGCCACACUUCAGGGGUAUCCCAGGUCUGCUUUCUCCCAGAAUCCUAUUUGCUGCUUACUGGAGGGAAUGAUGGGAAGAUCACGUUGUGGGAUGCAAACAGUGAAGUUGAGAAAAAACAGAAGAGUCCCACAAAACGUACCCACAGGAAGAAACCUAAAAGAGGAACUUGCACCAAGCAGGGUGGAAAUACUAACGCUUCAGUAACAGAUGAGGAAGAACAUGGCAACAUUUUACCAAAGCUAAAUAUUGAACAUGGAGAAAAAGUGAACUGGCUCUUGGGUACAAAAAUAAAGGGACACCAAAAUAUAUUAGUAGCUGAUCAAACUAGUUGUAUAUCUGUAUACCCCUUAAAUGAAUUUUAAAUCCAAUAAAAACAUUUGAAGAAUUGUGGCAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-170.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -186.95
Frequency: 0.0000
Diversity: 142.48
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..........((((..((((((.(((.....)))(((((..(((((((.((((((...........((.(.(((.............)))).))......((.......))))))))))))))))))))((((((((.((((....(((((.((((..(((.....((....((((((((..(((((((..(((((.(((((.(((.(.((.((..((((...(((((.((((..((((((..((((.......(((.(((((((......(((.(......).)))))))))).))))))).))))))..))))......(((.(((((((((.(...(((......)))((((((((((((.......((..............))......))))))))..))))..(((((((......)))..........(((((.....))))))))).........).))))))))))))..))))).)))).)).)).).)))))))).)))))))))))).))))))))....)).)))..))))...)))))..........((....))........)))).))))))))........(((((....)))))))))))(((((..(((((.......))))).))))).........))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
.......,..(((,.,({((((,(({....,|}|(((((,.,((((((.((((((........,..,{.{((((,,,,.....,,,.,})},)}.,,...|{.......},))))))))))))))))))|{{{{||||||,..|||{((((.{(((,,(((..,{.{{.,..((((((((..((((((,,{(((((.(((((.,{({(,((,(,..((((...(((({,((((..((((((..((((.......((,.(((((((......{((.{......},)})))))))).))))))).))))))..))))......(((.(((((((((.(..,(,(,,,...}}}{(((((((((((.......,{....{{........}}......))))))))..}))).}||||{{{......|||.....}}}..{(({(,,,..}}}})))),.....,...).))))))))))))..))))}.)))).,,,),.),)))))))).)))))))))))).))))))))..,.)).))}..)))}...)))),.........,((|...}}....,.,.|}}},)}))))}}...,,},.,||||...,}},,.)))))|{{{{{..{((({.......,}}},.}))))},,,,,.,,})))....
Back