Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001345917.2

Sequence Length

2096 nt

GC Content

0.4418

AUCACUAGGCGCCGAGGAGGGGAGCGGGAAGCGCAGUGCCAGCGCCACAGCCCUUCAAUCAUUUUGGUUGCUAUCCAGCUUCUCCACAUCAAGUCCAACUUCAGAAACCCCAAGCCUGUAGAGAAAAGUUGACCUGUGCUGACUCUGGUGAUGGUGACUGUCUCUCACUAAUUUCUUUGAAGUCUUCAAGGAUAAGCAGAGUUGAUCCAUCUGAGAAAGGGAUCAUGAACUAGACAGAAUGAACAGCCUUAGAGGCACAGACUCUUGAACGGGACGGUGGUGGUAUGACUAGUGCAGAGUGUUUAGAGAUCACUCAGUUUUUAAAGACUGGCCUUUAUCGUGUCUCAGUGCAGCCGAGGCAGAGCCUUUGAAGGAUGCGAUGUUGUCAUUCUUACUAAUCUAGUCCAGCCGCUGAGGUGACUUUCAACGGCAGACCGUCUCCUGAGCGCCCCAGGUAGAAUUUCAAAAGUCUCCGGGACCAUUAUGGCAGUCAAGUGGACGGGUGGGCAUUCUUCUCCUGUCCUCUGCCUGAAUGCAAGUAAAGAAGGGCUGCUGGCUUCUGGAGCAGAGGGCGGAGAUCUCACGGCUUGGGGUGAAGAUGGAACUCCAUUAGGACACACGCGGUUCCAAGGGGCUGAUGAUGUUACCAGUGUCUUAUUUUCUCCCUCCUGUCCCACCAAGCUCUAUGCCUCACAUGGAGAAACCAUUAGUGUACUGGAUGUCAGGUCCCUCAAAGAUUCCUUGGACCAUUUUCAUGUGAAUGAAGAAGAAAUCAAUUGUCUUUCAUUGAAUCAAACGGAAAACCUGCUGGCUUCUGCUGACGACUCUGGGGCAAUCAAAAUCCUAGACUUGGAAAACAAGAAAGUUAUCAGAUCCUUGAAGAGACAUUCCAAUAUCUGCUCCUCAGUGGCUUUUCGGCCUCAGAGGCCUCAGAGCCUGGUGUCAUGUGGACUGGAUAUGCAGGUGAUGCUUUUGCACAGAGUACUUGGGGAAUUUCUAAGUGGGAUUUGCUAACAGGAUCAAAUUAUUGAUCACACGAAAUAUCUUUGCUUUUUCUGUUUUCUACUAACAUAUCCAUUUAUGAACAAUAAGCCUUAUUUCUACAUUUAAUGCUAGUCUGAUAAAACCUAAUAGAAUUUAUUCACAAAGUAAUCAUUAAUCCUUUACUUUUCCUUUCUCUAUACUGUAAGAUACUCCUAAAACCUGAAAAUGCAAAUAUUUGAUUGUAAACAUCUGUUUAAACAAACAGUGAGUACUAAAGGCAGAGUUGGUCCACCCACUCUCUGUAAACUCUGUUUAAACAAAAAGUUAGAGGGGUCUGUUUUUACUUUAAAGUUCUGGGGUACAUUAACUGAAAUAGUGUGUAUUGGUGAUCAGGAUCAGAGCACUGUAUUCAAUGCUGAGUUUUGAAAGGAGCAUCACGGCUGGGCACGGUGGCUCACGCCUGUAAUCCCAGCACUUUGGAAGGCCGAGGUGGGCAGAUCACUUGAGGUCAUCAAGACCAGCCUGGCCAACGUGGUGAAACCCUGUCUCUACUAGAAAUACAAAAAUUAGCCAGGCGUGGUGGUGGGCUCCUGCAAUCCCAGCUACUUGGGAGGCUGAGGCAGCAGAAUCGCUUGACCCAGGAGGUGGAGGUUGCAGUGAGCCGAGAUCAUGCCACUGCACUCCUGCCUAGGCAACAGAGUGAGACUCUGUCUCAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAGAAAGGAGCAUCACAAAUUGCCCAAAUACAGAGGAAGUCCAUCAGGAGAGUAGAUGUAUCUAGAAACCCAUUAUGUAGAGAACUGGAGGUGUUUAAUUCUUAGUUUUCAUGAGGGGAAAAAAUGGAAUGUGCUGGUCUUCAUAAGAGAAGUCAUGGGAAAGCAGAUUUGGGCUUAAUGUAAACGUUUUCAAAUAGCUUGAACGUUCCCAUGGCAGGAUGUGCUUCCUCUUGAGAGAGUAAAUCUCAUCACUGGAGUGAGUCGUCAUGAUUUCUGUCUGUUGAGCACUUAGUUCUUGCCAAUGCUUUGUGUAUAUUAGUUUUAAUUCUAAUCACACCCUCCUAGUUAUUUUUUUUAAUAAAUAAAGAAACUGAAAUUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-637.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -677.40

Frequency: 0.0000

Diversity: 480.84

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..............(((((((((((((.(((.((((((((((((..((((((((((.(((((.....(((((((((((....(((((((..((((((.((((....((((((((((.((.((((...(((.((((((.((((((.(.((((((((......((((..((....((((((((...))))))))..)).)))).((((((..((.....))))))))((.((((((.(((((((.((((....(((((((.((((((.(((((.....(((.((((...)))).)))....))))))))).))..(((((((....)))))))........)))))))..((((.(((((((...)))))....)).))))..)))))))))))......)))))).))..((((.(((.(((..((.......))..))).))).)))).(((.((.(((..........)))))))))))))))).).)))))...).)))))).))).....(((((.((((((((((((((.((.((((.........)))).))))).)).)))))))))))))))))))))))))))))))))).))).)))......(((((...(.((....((((.((((..........)))).)))).......)))...)))))(((((.(((((..(((((...(.(((((.(((((((((((.((((((((.(((((....(((....)))))))).(((((((....))))))).....(((((........)))))......(((((..((....)).)))))((((.((((((((((.........)))))).((((.....))))..)))).))))...........)))).)))).)))..)))....))))).))))).).....)))))...))))).)))))..)))))))))))))).)))))))))((....))(((((((..((((.(((((((.....))))))).))))...((((((....)))))).....((((((..((((.(((((.(((((.......((((......)))).......(((.(((..........))).)))..((((.((.....)).))))..........(((((((...........)))))))..(((.(........).)))........)))))..))))).))))))))))....(((..((.((((((....))))))))..))).....((((((.(((.....)))..))))))..)))))))...(((.....))).)))))).))))......((((((((.((((((((((.....(((((((((((...(((((.......))))).))))))).)))).((((.((((.(((........))).)))).)))).((((.....))))))).))))))).)))))))).((((.((((((.....))))))..))))..((..(((((((((((....((((.((.......)).)))).................))))))).))))..))((((((((((((((((.((.((((((((((.((..(....)..))))))..)))))))).))).)))))))).)))))((((((((((.(((.(((((((((....)))(((((((...)))))))...........................((.(((........)))))......(((((((((.((((.(((((.(((((((.((((....(((.((((...(((((((((((........))).)))))))))))).)))......)))))))).))).))))).........(((((((((((((..(((((((...((((....))))))))))).)))......))))))))))..)))).)))))))))(((((((.....)))).)))..))))))))).).)))))))))....))))).)))))..)).))).))...))))((((...(((((........))))))))))))))))..(((.((((((((.....)))))))).)))......

Thermodynamic Ensemble Prediction

..............((((((({,((((((({,,,((((((((((.,((((((((((.{,{,{,{{|.{((((((((((....(((((((..{(((((.((((,...{(((((((((.((.((((...(((.((((((,((((((.(.((((((((..,,,.((((..,,....((((((({...})))))))..,,.}))).((((((..{{.....,,)))))}{{.{(((((.(((((({,((((..,{(((((.{.({{(({{{{{{{,,,{|{(({({{,...}))).}}}.,,,||}}}}}}},}),,||{||{|....}))))))}}}}}|{({(((((|...,{,,{.{((({...)))))})..))}))))),)))))))))))......)))))).)}{,{(((.(((.(((..((.......))..))).))).))))}(((.((.(((.{{....,},)))))))))))))))).).))))).,,}.)))))).))).....(((((.((((((((((((((.((.((((.........)))).))))).)).)))))))))))))))))))))))))))))))))).)))},)}......(((((,..{.((,,,.{(((,{{{{.,{.,.....}})),)))).....,.}},...}}}}}(((((.(((((,.(((((...,{({{{{.{{{{{((,(({.((((((((.(((((....(((....)))))))).(((((((....))))))).....{((({.,.....}))))).||,..,(((,..{(,,.,||,||||},{{{{((,(((((({.........})))))){|||.....)}))..,)))},))).}}},}},...)))),,))).}}},})}},,..}}}||{|}}}},}}}...)))))...))))).)))))..)))))))))))))).))))|||||((..,,}}(((((((..((((.(((((((.....))))))).)))}..,((((({....}))))).,..,(((((,.,{(((.(((((.(((({.......((((......)))).......{((.(((.......,..}}).))).,,.,{{{{,,..,,..,||,.}}},,,...(((((((...........))))))}..,,..,,,,.....}.,)),.......,})))..))))}.)))}}}}}}}...,{{{..{{.((((((....})))))}}..}}}.....((((((.(((.....)))..))))))..))))))).,,,|}},}}.)},.)))))).)))).....,{{((((((.((((((((((.....(((((((((((...{((((.......))))}.))))))).)))).{(((.((({.({{....,,,.))).}|||,||}}.((((.....))))})),,)))))).))))))}}.|(((.|{{{{|,,...}}}}}|..}}}}.,||.,(((((((((((..,.(,((,,,.,,,.,}},,||,,.}},.............))))))).)))),,)}((((((((((((((((.((.(((((({(((.((..(....)..)))))}..)))))))).))).)))))))).)))))((((((((((.(((.(((((((((....)))(((((((...)))))))...........................((.(((........)))))......(((((((((.((((.(((((.(((((((.((((....(((.((((,..{(((((((((({.......}))))))))))))))),))}......)))))))).))).))))).........(((((((((({((..,(((((({{...((....,,,}}})),,,,))))}}},,))))))))))..)))).)))))))))(((((((.....)))).))}..))))))))).).)))))))))....,)))).)))))..))})))})}...}},,{(((...(((((........))))))))}))))))).}|{,.(((((({{.....}))))))).},.......