Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001346541.2

Sequence Length

2037 nt

GC Content

0.4561

ACUCGCCCGGCCCUGGGCGGUGGGAGGCGGCGGCGGCGGCGGCGCUCGCGCACCUCGGAGGAGCCAGGAGCCGGAACCAGGGCCGAGCCCGCGGGCCGGGGCUAGCCAGCCGGUCGGAGAUGUCCGCCCAGAGGUUAAUUUCUAACAGAACCUCCCAGCAAUCGGCAUCUAAUUCUGAUUACACCUGGGAAUAUGAAUAUUAUGAGAUUGGACCAGUUUCCUUUGAAGGACUGAAGGCUCAUAAAUCAAUGCAGAGUCCUCAGAGAAGAGAUUCAGAAUGAACAGCUUUGUGUCAGACUUUGGAAGACCUCUGGAGCCAGAUAAAGUAUUUUCUCGCCAAGGCAACGAGGAGUCCAGGUCUCUCUUUCACUGCUACAUCAAUGAGGUGGAACGCUUGGACAGAGCCAAAGCUUGUCACCAGACCACAGCCCUUGACAGUGACGUCCAACUCCAGGAAGCCAUCAGAAGCAGUGGGCAGCCAGAGGAGGAGCUGAACAGGCUCAUGAAGUUUGACAUCCCCAACUUUGUGAACACAGACCAGAACUACUUUGGGGAGGAUGAUCUUCUGAUUUCUGAACCACCUAUUGUUCUGGAAACUAAGCCACUUUCCCAGACCUCACACAAAGACCUGGAUUGAGAAACAUGCUCUGUAAAGGGUCUUCCUGAAGAUGUGGAUUCUAUCUUUAUGUAGCAAGAAAUCUACAUCCACCAAAAUUGUGUGUGUUUGGGGGAGAGAGAGACAUAGAGAUAGAGACAGAGAGGCAGAGAAGAGACCCCUUUAGAAGAGAGCUGAGCUGAUUAAGCUGAGUGGUUUUUUGUUUUGUUUUGUUUUUGCUUUUUAAUACAUUUGGAGCUUUGGGAGUAUUAAAGUAUUUACACCAAGCUUGUCCAACCCGUGGCAUGUGUCCCAGGACAGCUUUGAAUGUGGCCCAAUACAAAUUUUAAACUUUAUUAAAACAUGAGUUUUGUUUUUUUUUUUGCUAUUUUUUUUAAAGCUCGUCAGCUAUCGUUAGUGUUAGUGUACUUUAUGUGUGGCCCAAGACAACUCUUCUUCCAGUGUGGCACAGGGAAGCUAAAAGAUUGGACACCUCUGAUUUAUACUAGCUCGUUUUGCUUGUUGAAAAAUUUGGCCAAAUACCUAUUGUCAGCAUUCUUGGGUGAGGAUUAGCCUACCAUGUUCUAAUCUGGCCCUGCCACUACUAUGCUCUACCUUUGGUGAGUUGCUUUACCUCUCUGGGCUGCCCCAUUUUUAACUGUAGGUUGACAGGUCUAGAGUGAUCCAUCCCACCUCUAAUAUUUUGUGAAUUUAUGACUUUGCCUUCAGAUGAGGCUGAGCUAUACAUAAAACAGUAUAAACUAGGGUACUGCCUCGUAUCUCUUGUAGGCUCUCUCAAAUCUCUGUACCUUCCACUUAACCCUAAUUGAGCCAAGCUUUAGUCAGGGGAUCUGGUUGUCUACCAGAAUGUCAGGAGACUCAUCUUACACAGUCAUGGUGGCCAAUGUUUCUGGUGGGUUGUGCUGAAACAGCUCUUCUGAGAACUUCCAACCACCCAUGCUCUAACCUGGAGACAGCCAUCCCCUGCCUCAGAAUAAGUACCAAUUCGUAGUACAUGUAUGGUACUCUUGUCCCCAAGAAAUGUUAGGAAGCUUGUCAGCUGAAUGAGAGGAGGUGCCUUCUGGGUAUCUCUGUGUUGGUGUAUCUGUGCCAUUGGCUACAGAACAAGAAAAAUACUAUUUGCCAUGCUAUUACCUUGGCAGAUGUGUAGGUGAUAGUCAUCUGGCUUUGAGCUGAGAUGGUCAGUGGGUUGUAAAUUCCCCACUAGCAGAUAUUCAGGGUGGCCUGAGUUAUGUAAACAAGUGAGCAACACAGCUUUAAUUUCAUGGAGGAAUCAAAGCUGCACACUGGUAUUAAAACAACUUGAUUUUGCGCACACAGUUGCAUGCAUGGCAAGCUGUUAACCUCUGGGUGGCAUUUUCAUUAUGAAUUUGUUCACCACCUGUCUUGCUUAAGCUACAAAAUAAAUGCAUUUGACUGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-637.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -678.07

Frequency: 0.0000

Diversity: 479.25

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((.((((((....))))))))(.(((((((.((((((.((((.(((((.((.(((....((..((.......))..))))))))))))))))..)))).((((....))))....(((((((.((((((((((((((((((((...))))..((((((.((((((.(......)))))))....)))))).........(((((((.......(((..((((....)))))))....)))))))((((((((((((..(((((((.(((((((......((((((....((((((((..(((((((((((((((.(((............((((((.........))))))((((((((.(((.(((((.((......)).))))).)))..)))))))).((((....))))(((....)))(((.((..((((...((.(.(((.......))).).))))))..)).))))))..)))))))..(((((.....)))))...........(((((((...(((((....)))))(((((.....))))))).))))).))))))))..)))))..)))...))))))(((........))).((((((((((..(((((((((((((..((.(((.......))).))...)))))))......((((((((((((..((......))..)).)))))))))).........)))))).))))))))))((((((((((.((((((((((...((((((((((((.(((((.....(((((((..(((.((((.....)))).)))..)))))))....))))).)))))))))))).........(((((((.(((((...(((((((.((.(((((((...(..((....((((((..((((....)))).....((((((....(((((((((((((.(((.....((((((((((((((((......................))))))))))..((((....))))(((((((((..(((.(.(((..((((..........(((((.(((...)))..)))))........)))).))))..)))..)))))))))..))))))...)))..))))))))..........)))))...))))))..((((..(((((((.(......)..))))))).)))))))))).....))..)....))))))))).))))))).))))).))))).))..........((((......))))...(((((((........)).)))))...(((((((....((((.(((.(((((.....))))).))).)))))))))))((((((........)))))).))).))))))))))...))))))).)))))))((((((.((.(((.......(((.(((((((((((((.(((((((..(((((((((.((((..(((.((((......))))))).((.((((((((......((((.((.(((((((......))))))).)).))))........))).))))))).....)))))))))))))))))))).))........((((((...(((.....)))..))))))(((((....)))))........))))))))...))).)))))).)))))))).)))))))...))))))))))))((.((((((((...))).))))))).............((((((((((((((((((..((....))..))))))))).(((((((((...)))).)))))((.((((((..........)))))).))....(((((((....)))))))(((((((....(((.((((..(((((((.(((((.....))))).))))))).........(((((......))))).)))).)))....))))))))))))))))..)))))))))))))))))))))))....((((....)))))).)).))))).).................((((......))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

...,(((((,,,,||||||{{(,((((((({({((((,{{{{,||{|{,{|.||{,{,.,{.,||.,,.,}|}}..}}}}))))}})))))},}})))}|{{{.,|.||}}|||.(((((((.((((((((((((((({,{{{...|}},..((((((.((((((.(......,))))))....)))))).........(((((((.,{....((({.{(({....}))))))..,,)))))))((((((((((((..(((((((.(((((((,,,,..({,{{{,{..(((((((({{(({,,,,.(((((((.(((,{{,.......,{{{{{({....}}..,))))}{{{{{{||,||,.{{{(({(({{....,..|||||{||}..||||||||.{{((....))}}((({,..|}|{,,.{{..{||,..|||.,.|{{...,,,.)),.}}},))}}.,))}))))))..)))))))..(((((.....))))).,}}}}}}}}}|||{{{{,,.{{{((....,}}},(((({{{....}}||}}.|||,|,||}}}}))}})))||.|}},.....))))|||........}},.((((((((((..(((((((((((((..{{.(((.......))).}}...))))))}......((((((((((((..((......))..)))))))))))))........,)))))).))))))))))((((((({((.(((((((,,,...((((((((((((.(((((.....(((((((..(((.((((.....)))).)))..)))))))....))))).)))))))))))).......{(((((((({((,,(((.....,,},,),}.)))))),..})))}..,(,((((.{((.({{..((((((((((((.(((((..,,...{((....((((((..........,)))))).,.,},.......)))))....})))))))).))).((((....)))},,(({(((({{(((((((((((,((({,...,{|,,,,...{((((((({|{{|{,|{(({..{{{||||{,...}))))}}).,..))))},.,,..|,.((((((..{{{..((.......)).})}.)))))).....((((.,(((((((.{......)..))))))).)))))))))).})}..|{{{.{{{...))))))),}}},..,||||,{{{{|,..}}},........{(((((((.(((((..(((((((........))}}))))....})))).)))))))|.,,..((({{,....))))).),))))))))))),.,}}))},.,}},)))))))))),)})))))))})}...))))))).}))))))((((({{((.(((,......{((.((((((((((({(.(((((((..{((((((((.((((..{((.((((......))))))}.((.((((((((.....(((((,((.(((((((......))))))).,).})))))......)))))}))))}.....)))))))))))))))))))).)}.......,((((((...(((.....)))..))))))|((((....)))),........))))))))...))).)))))).)))))))).}))))))...))))))))))))((.((((((((...))).))))))).............{(((((((((((((((((..((,...}),,))))))))}.(((((((((...)))).)))))((.((((((..........)))))).))....(((((((....))))))),((((((....(((.((({..(((((((.(((((.....))))).)))))))......,,,,,,,,......,}},,.}))).)))....)))))))))))))))}..)))))))))))))))))))))))....{((,....}))}}}.)),)}}}}|),...,}...........{(({......)))}