Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001348178.2

Sequence Length

1364 nt

GC Content

0.4597

GCCCUCCCCUCCCGAUCCCGGAGCCAUGUGGCCCCUGGCCCUAGUGAUCGCCUCCCUGACCUUGGCCUUGUCAGGAGUGAAUUACCCCAAAACUCUACAAUGUGCCAACAUCCAACUUCGCUCAGAUGAGGAGUGUCGUCAAGUCUACCCAGGAAAGAUCACUGACAACAUGUUGUGUGCCGGCACAAAAGAGGGUGGCAAAGACUCCUGUGAGGGUGACUCUGGGGGCCCCCUGGUCUGUAACAGAACACUGUAUGGCAUCGUCUCCUGGGGAGACUUCCCAUGUGGGCAACCUGACCGGCCUGGUGUCUACACCCGUGUCUCAAGAUACGUCCUGUGGAUCCGUGAAACAAUCCGAAAAUAUGAAACCCAGCAGCAAAAAUGGUUGAAGGGCCCACAAUAAAAGUUGAGAAAUGUACCGGCUUCCAUCCUGUCACCAUGACUUCCUCACAUGGUCUGCUUAGCCCUUCUCUGCUCCUUAUUCCCAGUGUUCCAUUUGAACCAGUGAUCCAUGUCCUGAAAAAUGCUCAAUCUCAGCUAACAUUCCAUGUUUCAGAAGCAUUCAGGCACUGCCAGGCUUGCAGUCUCCCAGAUGUUGCAUCCCUGAAACAUCUCAACAACCUGAAUGUCCCAACCCAGACAAUGGCCCAGGUCUCUCAACUUCAUCAGUGUGGCUUCUAUGAGCCCAGAUCACCACCUGAACGUUCUGUCUGUGGCACAUUCUUAAAUAUUUCCAUCAGCCCAUCUCAACAAUAUAUGUCCUAUAAAUGGACCAUCCUUGACAACAUCCUCUAACUCUUCAAGUAUUUAUUCAAUGCCAGUAUCCUAGACCUUCUAUUUUUUGCACUCAAGAAGGCUCUAGACUCCCAUGAUAGUUCAUCCUGAAAAUAUUCUCUUAUGCCCACAAUCUUCUGCCCUGACAACAUUCUGUGUACCUCUGUGACUCACCACAGCUAACAUUGGAUCCUCAGAAUAUUUCAUUCUCACACUGUUAUGGGUGUCUCAGAAGUCCCAACCCAACCUACAUCCCACAUUCUUCCAAUACCCCACCUCUGCCAACAUUCCCUCUCUGAAUCAAUGGCACCCUAGUCUCUAGAGUUAUAGGGUUCAGUAUACCAAAGGGUCUUCUUGCCUGAACUUUAUUGUCUACCAAAUAUUCCGUCUUGUAUCCCCUCCAUGAACAUCCUUGGUCAGUGUCCCUUGCUGUUACAUCUUUGUGCAUGACCCUAAAAUGUAGUGCAAAUCCUUGCUUUGGACAAGUUAUAAAACUCACAGUCUCUGUGCUUUCUCAUCUGUAAAAUGGGUUCAUAAUUUUUUUUAAUUGUAACAUUAUUACAAGAAUAAAUGUCAAGCAUUUAUCACUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-325.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -351.90

Frequency: 0.0000

Diversity: 360.75

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((....((((.......))))....).)))....((((.((.((((.........(((((.(((((((((.(((((.............)))))...((((....))))....((((....(((((.(((((((.............(((((..((((((((........((((((....)))))).((((((.(((.(((...((((((((((((((..((((((((....((((((((.(((....)))))))).)))((((((...))))))......(((((((..((((((((((((((.(((((((..((((((....))))))...))))))).((.((.....))))............))))..)).....)))))..)))))))))).....................))))))))....)))))........))))))).))....))).))).))))))................((((.....))))))))))))....)))))......(((.......)))..))))))).)))))..))))((((((((.(((((.......))))).....(((((((.((....)).)))))))......))))))))..........))))).)))).)))))..........)))).)).))))..((((((((((..(((.....))).......((((((((((......(((((((((.........................((((.......))))((....))....................))))))))).....)))))......)))))........(((((((....((((((((((((((.(((((((((((......(((((.((((((................((......))....((((.((((....(((((......)))))...)))).))))....))))))))))).......))))))))))).)))).))).((((.........((((((..........................(((((..((((.......))))...)))))...(((.(..(((((((...((((..((...(((....)))...)).)))).)))))))..).)))....((((........))))......((((.(((....((..(((((.....)))))...))....))).))))........)))))).((((....))))...)))).((((....)))).((((...)))))))))))....)))))))))))))))))...........((((((.....))))))..((((((((...)))))))).....

Thermodynamic Ensemble Prediction

,,,,....,,,{,{....,||}|,,..,.|||{...))}},,{(((({,{,...,,{(((,,,{{{,{{|||,|({({,............}}}}},,,|,|{},,,)}}}......,.,..{{{{{((((({(((.((((((......(((((..((((((((.,......{(((((....)))))}.{((((({(((..{(((,{.((((((((((((..((((((((....(((({{{.{(((....))))||||.},.((((((...))))))...}}}|((((((..(({{{{(({{{(((,(((((((..((((((....))))))...))))))).{(.({.....}})}............||}}|,||.....})))),.}))))))))}......,,,,.........,,))))))))....))))),.......})))))).)))))}))..))))))}},|,............}}.((((.....))))))))))))....)))))...,{((((...{{{.,|,.{(({{...}))))..})))))))}|,{(,|{{{{,{{{..,||||},,...{||{{{|,||..,,)).,})}}}}.........((((((.(((...(((((({,{|,.{((({............,,,,|{.(((({....}))))}},,.....)))))..})}..})))))))).)))))).......,........,..................((((.......))))....)))))).))}},,}}..........,||{{{.....,}))).,......{{({{{{{{{.....,,,,.....}}}}||,||||(((.(((((((((((......((((((((((((.................,.,....}|....{(((.((((....(((((......)))))...)))).)))}....))))))))))).......))))))))))).)))}.}||,{{,,..,.......{{{,...........................{((((..((((.......))))...))))}..{{{{...|||||||..{((((({{{{{{{{,,..{((({,,{{.{{,..||,,..{{{{,.......}|||.....,,..}},.......||,|}|,|,,,,})},(((({.....}))))..,||....}))}}}})))}}}...,))))}}||||,,,,},)),,,)))}.((({....})))(((((...)))))..}}}},,,,))}},..})))}}.,,,,,,........{(((({.....)))))}|,{(((((((...))))))))),},.