Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001348384.2
Sequence Length
1689 nt
GC Content
0.3967
AAAUCGCAAAUAUGGCGCCGGAGCGGCUGCGGAGCCGGGCGCUCUCCGCCUUCAAGUUGCGGGGCUUGCUGCUCCGUGGUGAAGCUAUUAAGUACCUCACAGAAGCUCUUCAGUCUAUCAGUGAAUUAGAGCUUGAAGAUAAACUGGAAAAGAUAAUUAAUGCAGUUGAGAAGCAACCCUUGUCAUCAAACAUGAUUGAACGAUCUGUGGUGGAAGCAGCAGUCCAGGAAUGCAGUCAGUCUGUUGAUGAAACUAUAGAGCACGUUUUCAAUAUCAUAGGAGCAUUUGAUAUUCCACGCUUUGUGUACAAUUCAGAAAGAAAAAAAUUUCUUCCUCUGUUAAUGACCAACCACCCUGCACCAAAUUUAUUUGGAACACCAAGAGAUAAAGCAGAGAUGUUUCGUGAGCGAUAUACCAUUUUGCACCAGAGGACCCACAGGCAUGAAUUAUUUACUCCUCCGGUGAUAGGUUCUCACCCUGAUGAAAGCGGAAGCAAAUUCCAGCUUAAAACAAUAGAAACCUUAUUGGGUAGUACAACCAAAAUCGGAGAUGCGAUUGUUCUUGGAAUGAUAACGCAGUUAAAAGAGGGAAAAUUUUUUCUGGAAGAUCCUACUGGAACAGUCCAACUAGACCUUAGUAAAGCUCAGUUCCAUAGUGGUUUAUACACAGAGGCAUGCUUUGUCUUAGCAGAAGGUUGGUUUGAAGAUCAAGUGUUUCAUGUCAAUGCCUUUGGAUUUCCACCCACUGAGCCCUCUAGUACUACUAGGGCAUACUAUGGAAAUAUUAAUUUUUUUGGAGGUCCUUCUAAUACAUCUGUGAAGACUUCUGCAAAACUAAAACAGCUAGAAGAGGAGAAUAAAGAUGCUAUGUUUGUGUUUUUAUCUGAUGUUUGGUUGGACCAGGUGGAAGUAUUGGAAAAACUUCGCAUAAUGUUUGCUGGUUAUUCACCAGCACCUCCAACCUGCUUUAUUCUGUGUGGUAAUUUUUCAUCUGCACCAUAUGGAAAAAAUCAAGUUCAAGCUUUGAAAGAUUCCCUAAAAACUUUGGCAGAUAUAAUAUGUGAAUACCCAGAUAUUCACCAAAGUCGUUUUGUGUUUGUACCUGGUCCAGAGGAUCCUGGAUUUGGUUCCAUCUUACCAAGGCCACCACUUGCUGAAAGCAUCACUAAUGAAUUCAGACAAAGGGUACCAUUUUCAGUUUUUACUACUAAUCCUUGCAGAAUUCAGUACUGUACACAGGAAAUUACUGUCUUCCGUGAAGACUUAGUAAAUAAAAUGUGCAGAAACUGCGUCCGUUUUCCUAGCAGCAAUUUGGCUAUUCCUAAUCACUUUGUAAAGACUAUCUUAUCCCAAGGACAUCUGACUCCCCUACCUCUUUAUGUCUGCCCAGUGUAUUGGGCAUAUGACUAUGCUUUGAGAGUGUAUCCUGUGCCCGAUCUACUUGUCAUUGCAGACAAAUAUGAUCCUUUCACUACGACAAAUACCGAAUGCCUCUGCAUAAACCCUGGCUCUUUUCCAAGAAGUGGAUUUUCAUUCAAAGUUUUUUAUCCUUCUAAUAAGACAGUAGAAGAUAGCAAACUUCAAGGCUUUUGAGAUUCUUAAAGAUCAUCUGAAGAAAAUUCAUCAGUUUUCUGCUUAACUCUAUAUCUUAUGUGAUUCUGAUAUUACAAUAAAAUUAUGGUAAACUUUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-439.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -472.42
Frequency: 0.0000
Diversity: 551.07
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((((.....((((..((((((.(((......))).)))))).))))........(((((((.....))))))).((((.(((....)))...))))..(((((((....((.......))...))))))).((((((...(((((((((......((((((.(((.(((.....))).)))......(((((((((((.((((((((.....((((((.(...((......)).).)))))).....))))))))...)))..)))..))))).((((((((((((.((((((.....))).......((((((((((....))))))..)))).....((((((((...((((.(((((....)))))........(((((((((((....(((((((((.((((.........)))).(((((((((((.....................(((((((....((((((.((((.(((((((((((((.....)))).))))...............)))))))))))...))))...))))))).(((((((((((...)))))))..)))).........)))......)))))))).((((((((.(((((((((...((((.....))))...)))..))))))))).)))))...))).))))))))))))))))).))))..)))))))).))).)))))))))))).((((((.(..((((((((((((((......(((((..(((...))))))))...(((.((((((....)))))).))).(((((..((((.(((((........(((((((............)).)))))...(((.(((((((((.......)))))))))))))))))))))..))))).)))))))))....(((....)))(((...((..(((((((.....)))))))....))...)))....(((((((((((..............)))))))))))..((((...(((((...))))).))))..)))))..).))))))..........(((((((......)))))))...((.(((((.((((((((.(.((((..((((((((..((..(((((........)))))..))(((..((((((((..(((.....)))..))))).)))..))).........(((((((((......(((((((((.........)))))...))))..(((((((((((...))))))..)))))..(((((((((((...)))))..))))))..((((.........))))..............)))))))))............(((........)))............((((((((.((((.((((((((((.((.(((((((...))))))))).)))))))))).)))).).....))))))).....)))))))).)))).))))))))).))))).))))))))..........)))))))))....((((((((((.((((((((((.(((((.(((((.........)))))))))).))))))...((.(((((((...))))))).))...))))))))))))))(((....)))..........)))))).)))))))......((((.(((....))).))))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,{{{(((.....((((..{(((((,(({...,}}))),))))}}.}}}},,.,.,{{(((((((.....))))))}|((({.({{....|}},,,||||,,((((((({{{.({......,))...))))))}|||||,..{{(({({{({{.......{{||||{((,{{(..,..}}}.||{{{{,.,{,{({{({,{{.{(((({{({,,..||{||{,|},,{,.,,,,,}},}|))))))}}||.||,|||||,,.,|||||||,,,|||{.((((((((((({.{{{{(({,...))),......((((((((({....})))))..)))).....{(((((((...((((.((({,....,})))....,,,,(((((((((((...,(((((((((.({((.........}})}.(({((((((({.,,{|...{,,,...,,.,|,|||{|||,...||||||,{{|(|{{{{{((((((((.....)))).))))....,,,,,,.....))))))|||.,...,)))...}||}}}}.{{{{|{{{(((,..}}}}))}..)))}.......||}}|,....,))))))}|.{(({(({{.(((((((((...((((,...,))))...)))..))))))}}).))}||,,.}}),))))))))))))))))}.))))..)))))))}.}}}.}))))))))))),}|{({{{{,{,|||{((((((({{...,,.(((({.,(((...)))))))).,,{{{,||||||....,}}}}|.}||,(((((..({{{.{({{{...,,,,,||{{{{{............||,|||}}..,((,{(((((((((.......))))))))))))}}}})}))).,)||||,|||}|||||,|{{{{.,,,|,,,,{,....}}.{((((((.....)))))))..,,}}},.}))}}},|{{{{{{{|||...,.......,.,)))))}}}}}|..,,(({{{(,,,.}},}))),.,,}},,.,,...,{{{{|{{{({{,,,{.{{((({{{{......)))))}),,,}|,,{{{|,||||||||,|,||{|,,{((((({{.{((.,(((((........))))),.))|((..((((((((..(((.....)))..))))).))).,))}.........(((((((({,,,...((((((({(,,...,||.|||}}...))}}..{((({((((((...)))))).,))))}..{{{{{{{((((...))))}..)}))))..||||,{{....,,))),..............))}}}}}}}..,,,..,}.,}||,,,,.,,,,...............((((((({.((((.((((((((((.((.(((((((...))))))))).)))))))))).)))).).....))))))).....))}))))).}))).))))))}}}.)}))}||}})),}},,,,,.,}},})))))))},},,||{|||||||.|||,{(((((.((((,{(((((.........)))))))))).)))))).,,|||{||||{(,,,||},,|}|,,.,}}}}}||||||))}},})}}})))}},,..,,||,||,.||,||||||,.....}||||,,||....)))})},,......
Back